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Diferencia entre revisiones de «Caldarchaeales»

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'''Caldarchaeales''' o '''Aigarchaeota''' es un [[orden]] candidato de [[Archaea|arqueas]]<ref>GTDB database [https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=p__Thermoproteota Thermoproteota]</ref><ref>Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron J. Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, David W. Waite, William B Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz (2020). [https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.01.972265v1.full A rank-normalized archaeal taxonomy based on genome phylogeny resolves widespread incomplete and uneven classifications]. Biorxiv.</ref> recientemente propuesto a partir de muestras genómicas de la especie candidata ''[[Caldiarchaeum subterraneum]]'', encontrada en las profundidades de una mina de oro en Japón y todavía no cultivada.<ref name=Nunoura>Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Jungo Kakuta, Shinro Nishi, Junichi Sugahara, Hiromi Kazama, Gab-Joo Chee, Masahira Hattori, Akio Kanai, Haruyuki Atomi, Ken Takai e Hideto Takami. [http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2010/12/14/nar.gkq1228.full Insights into the evolution of Archaea and eukaryotic protein modifier systems revealed by the genome of a novel archaeal group]. Nucleic Acid Research (2011).</ref> Además, el material genético de Aigarchaeota ha sido encontrado en muestras tomadas de ambientes [[Fuente hidrotermal|geotermales]] tanto terrestres como marinos, a lo largo del mundo, lo que permitiría distinguir por lo menos tres [[familia (biología)|familias]].
'''Caldarchaeales''' o '''Aigarchaeota''' es un [[orden]] candidato de [[Archaea|arqueas]]<ref>GTDB database [https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=p__Thermoproteota Thermoproteota]</ref><ref>Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron J. Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, David W. Waite, William B Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz (2020). [https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.01.972265v1.full A rank-normalized archaeal taxonomy based on genome phylogeny resolves widespread incomplete and uneven classifications]. Biorxiv.</ref> recientemente propuesto a partir de muestras genómicas de la especie candidata ''[[Caldiarchaeum subterraneum]]'', encontrada en las profundidades de una mina de oro en Japón y todavía no cultivada.<ref name=Nunoura>Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Jungo Kakuta, Shinro Nishi, Junichi Sugahara, Hiromi Kazama, Gab-Joo Chee, Masahira Hattori, Akio Kanai, Haruyuki Atomi, Ken Takai e Hideto Takami. [http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2010/12/14/nar.gkq1228.full Insights into the evolution of Archaea and eukaryotic protein modifier systems revealed by the genome of a novel archaeal group]. Nucleic Acid Research (2011).</ref> Además, el material genético de Aigarchaeota ha sido encontrado en muestras tomadas de ambientes [[Fuente hidrotermal|geotermales]] tanto terrestres como marinos, a lo largo del mundo, lo que permitiría distinguir por lo menos tres [[familia (biología)|familias]].


Los análisis genéticos realizados apoyan la pertenencia de Aigarchaeota al [[clado]] TACK (acrónimo formado por las iniciales de [[Thaumarchaeota]], Aigarchaeota, [[Crenarchaeota]] y [[Korarchaeota]], los primeros grupos descubiertos).<ref>Alba, T. W.; Goertz, G.; Williams, A. J.; Cole, J. K.; Murugapiran, S. K.; Dodsworth, J. A.; Hedlund, B. P. Diversity and Habitat Niche Modeling of Candidate Archaeal Phylum Aigarchaeota. American Geophysical Union, Fall Meeting 2013, en The Smithsonian/NASA Astrophysics Data System. [http://adsabs.harvard.edu/abs/2013AGUFM.B31D0436A]
Los análisis genéticos realizados apoyan la pertenencia de [[Caldarchaeales]] en [[Nitrososphaeria]] o [[Thaumarchaeota]].<ref>Alba, T. W.; Goertz, G.; Williams, A. J.; Cole, J. K.; Murugapiran, S. K.; Dodsworth, J. A.; Hedlund, B. P. Diversity and Habitat Niche Modeling of Candidate Archaeal Phylum Aigarchaeota. American Geophysical Union, Fall Meeting 2013, en The Smithsonian/NASA Astrophysics Data System. [http://adsabs.harvard.edu/abs/2013AGUFM.B31D0436A]
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El genoma de ''C. subterraneum'' presenta características bastante diferentes a las de otras arqueas, codificando proteínas como Ub, E1, E2 y una pequeña proteína de la familia de [[dedo de cinc|dedo RING de cinc]], que pertenecen a un sistema modificador similar al de la [[ubiquitina]]. Las características estruturales de estas proteínas son más parecidas a los sistemas eucarióticos que a los procarióticos. Los genes encontrados en el genoma de ''Caldiarchaeum subterraneum'' sugieren que podría crecer [[litotrofo|quimiolitotróficamente]] utilizando [[hidrógeno]] o [[monóxido de carbono]] como [[donante de electrones]], mientras que usaría [[Dioxígeno|oxígeno]] y [[nitrito]] como [[aceptor de electrones|aceptores de electrones]].<ref name=Nunoura/>
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== Referencias ==
== Referencias ==

Revisión del 03:49 23 jul 2021

Caldarchaeales
Taxonomía
Dominio: Archaea
Filo: Thermoproteota
Clase: Nitrososphaeria
Orden: Caldarchaeales
Especies

Candidatus Caldiarchaeum subterraneum

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Caldarchaeales o Aigarchaeota es un orden candidato de arqueas[1]​[2]​ recientemente propuesto a partir de muestras genómicas de la especie candidata Caldiarchaeum subterraneum, encontrada en las profundidades de una mina de oro en Japón y todavía no cultivada.[3]​ Además, el material genético de Aigarchaeota ha sido encontrado en muestras tomadas de ambientes geotermales tanto terrestres como marinos, a lo largo del mundo, lo que permitiría distinguir por lo menos tres familias.

Los análisis genéticos realizados apoyan la pertenencia de Caldarchaeales en Nitrososphaeria o Thaumarchaeota.[4]​

El genoma de C. subterraneum presenta características bastante diferentes a las de otras arqueas, codificando proteínas como Ub, E1, E2 y una pequeña proteína de la familia de dedo RING de cinc, que pertenecen a un sistema modificador similar al de la ubiquitina. Las características estruturales de estas proteínas son más parecidas a los sistemas eucarióticos que a los procarióticos. Los genes encontrados en el genoma de Caldiarchaeum subterraneum sugieren que podría crecer quimiolitotróficamente utilizando hidrógeno o monóxido de carbono como donante de electrones, mientras que usaría oxígeno y nitrito como aceptores de electrones.[3]​

Algunos autores opinan que en realidad este supuesto grupo forma parte de Nitrososphaeria o Thaumarchaeota y que Caldiarchaeum subterraneum debe ser clasificado como Nitrososphaeria.[5]​

Referencias

  1. ↑ GTDB database Thermoproteota
  2. ↑ Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron J. Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, David W. Waite, William B Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz (2020). A rank-normalized archaeal taxonomy based on genome phylogeny resolves widespread incomplete and uneven classifications. Biorxiv.
  3. ↑ a b Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Jungo Kakuta, Shinro Nishi, Junichi Sugahara, Hiromi Kazama, Gab-Joo Chee, Masahira Hattori, Akio Kanai, Haruyuki Atomi, Ken Takai e Hideto Takami. Insights into the evolution of Archaea and eukaryotic protein modifier systems revealed by the genome of a novel archaeal group. Nucleic Acid Research (2011).
  4. ↑ Alba, T. W.; Goertz, G.; Williams, A. J.; Cole, J. K.; Murugapiran, S. K.; Dodsworth, J. A.; Hedlund, B. P. Diversity and Habitat Niche Modeling of Candidate Archaeal Phylum Aigarchaeota. American Geophysical Union, Fall Meeting 2013, en The Smithsonian/NASA Astrophysics Data System. [1]
  5. ↑ Guy, L., Spang, A., Saw, J. H., & Ettema, T. J. (2014). ‘Geoarchaeote NAG1’is a deeply rooting lineage of the archaeal order Thermoproteales rather than a new phylum. The ISME journal, 8(7), 1353-1357.
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