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ENCODE

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ENCODE
Tipo consorcio y base de datos biológica
Sitio web encodeproject.org y genome.ucsc.edu/ENCODE
[editar datos en Wikidata]

La Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) es un proyecto de investigación pública lanzado por el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano de Estados Unidos (NHGRI) en septiembre de 2003.[1]​[2]​[3]​[4]​[5]​ Destinado como un seguimiento del Proyecto Genoma Humano (Genomic Research), el proyecto ENCODE pretende identificar todos los elementos funcionales en el genoma humano.

El proyecto involucra a un consorcio mundial de grupos de investigación, y los datos generados a partir de este proyecto se pueden acceder a través de bases de datos públicas. El proyecto está comenzando su cuarta fase, a partir de febrero de 2017.[6]​

Motivación e Importancia

Se estima que los seres humanos tienen aproximadamente 20.000 genes codificadores de proteínas, que representan aproximadamente el 1,5% del ADN en el genoma humano. El objetivo principal del proyecto ENCODE es determinar el papel del resto del componente del genoma, gran parte de los cuales tradicionalmente se consideraba "basura". La actividad y expresión de genes codificadores de proteínas pueden ser moduladas por el regulome - una variedad de elementos de ADN, tales como el promotor, secuencias reguladoras transcripcionales y regiones de estructura de cromatina y modificación de histonas. Se cree que los cambios en la regulación de la actividad génica pueden alterar la producción de proteínas y los procesos celulares y resultar en enfermedad (Antecedentes del proyecto ENCODE). Determinar la ubicación de estos elementos reguladores y cómo influyen en la transcripción de genes podría revelar vínculos entre las variaciones en la expresión de ciertos genes y el desarrollo de la enfermedad.[7]​

ENCODE también pretende ser un recurso integral que permita a la comunidad científica comprender mejor cómo el genoma puede afectar la salud humana y "estimular el desarrollo de nuevas terapias para prevenir y tratar estas enfermedades" .[8]​

Véase también

Referencias

  1. ↑ Raney BJ; Cline MS; Rosenbloom KR; Dreszer TR; Learned K; Barber GP; Meyer LR; Sloan CA; Malladi VS; Roskin KM; Suh BB; Hinrichs AS; Clawson H; Zweig AS; Kirkup V; Fujita PA; Rhead B; Smith KE; Pohl A; Kuhn RM; Karolchik D; Haussler D; Kent WJ (enero de 2011). «ENCODE whole-genome data in the UCSC genome browser (2011 update)». Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D871-5. PMC 3013645. PMID 21037257. doi:10.1093/nar/gkq1017. 
  2. ↑ The ENCODE Project Consortium (2004). «The ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) Project». Science. 
  3. ↑ ENCODE Project Consortium (2011). «A User's Guide to the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE)». En Becker PB, ed. PLOS Biology 9 (4): e1001046. PMC 3079585. PMID 21526222. doi:10.1371/journal.pbio.1001046. 
  4. ↑ Error en la cita: Etiqueta <ref> no válida; no se ha definido el contenido de las referencias llamadas birney
  5. ↑ Guigó R; Flicek P; Abril JF; Reymond A; Lagarde J; Denoeud F; Antonarakis S; Ashburner M; Bajic VB; Birney E; Castelo R; Eyras E; Ucla C; Gingeras TR; Harrow J; Hubbard T; Lewis SE; Reese MG (2006). «EGASP: The human ENCODE Genome Annotation Assessment Project». Genome Biology 7: S2. PMC 1810551. PMID 16925836. doi:10.1186/gb-2006-7-s1-s2. 
  6. ↑ «ENCODE Project». www.genome.gov. Archivado desde el original el 17 de mayo de 2016. Consultado el 13 de mayo de 2016. 
  7. ↑ Saey, Tina Hesman (6 de octubre de 2012). «Team releases sequel to the human genome». Society for Science & the Public. Consultado el 18 de octubre de 2012. 
  8. ↑ The ENCODE Project Consortium (2004). «The ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) Project». Science. 

Enlaces externos

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