Репортёрный ген: различия между версиями
[отпатрулированная версия] | [отпатрулированная версия] |
Sirozha (обсуждение | вклад) ← Новая страница: «'''Репортерные гены''' (гены-репортеры, {{lang-en|reporter gene}}) в молекулярной биологии — г...» |
отмена правки 116310621 участника 185.253.40.150 (обс.) - почти два года провисело; +лаконичность |
||
(не показаны 34 промежуточные версии 9 участников) | |||
Строка 1: | Строка 1: | ||
''' |
'''Репортёрные гены''' (гены-репортёры, {{lang-en|reporter gene}}) в [[молекулярная биология|молекулярной биологии]] — [[гены]], которые присоединяют к регуляторным последовательностям других генов для исследования проявлений генов в [[культура клеток|культурах клеток]]. Некоторые репортёрные гены используются исследователями, так как их [[экспрессия генов|экспрессия]] придаёт организму чётко выраженные легко измеряемые характеристики, некоторые, — так как они являются селективными [[ДНК-маркер|маркерами]]. Репортёрные гены используют для того, чтобы определить уровень экспрессии гена в [[Клетка|клетке]] или в [[популяция|популяции]]. Часто в [[Генетическая инженерия|генно-инженерные]] конструкции встраивают в качестве репортёра ген ''[[Лактозный оперон|LacZ]]''. |
||
== |
== Применение == |
||
Интересующий исследователя ген и ген-репортёр обычно встраивают в одну генетическую конструкцию, а затем вводят её в клетку или организм. В случае клеток [[Бактерии|бактерий]] и [[Эукариоты|эукариот]] для введения обычно используют кольцевые молекулы ДНК — [[плазмиды]]. Важно, чтобы ген-репортёр в норме не экспрессировался в клетке, тогда его экспрессия будет означать, что интересующий ген попал в клетку. |
|||
The amount of [[DNA]] in the [[haploid cell]] of an organism is not related to it’s evolutionary complexity or number of genes. |
|||
In [[eukaryotes]],C-value is defined as the amount of DNA per genome(1C=haploid nucleus,2C=diploid nucleus and 4C=nucleus which is just about to divide by [[mitosis]]).There is enormous variation in the range of C values, from as little as a mere 106bp for a [[mycoplasma]] to as much as 1011bp for some plants and animals. |
|||
Широкое применение находят репортёрные гены, кодирующие [[Флуоресценция|флуоресцентные]] и [[Биолюминесценция|люминесцентные]] [[белки]]: |
|||
== Common reporter genes == |
|||
* ген [[Медуза|медузы]], кодирующий [[зеленый флуоресцентный белок]] ({{lang-en|GFP}}), экспрессия которого проявляется в появлении зелёного свечения при освещении синим светом; |
|||
To introduce a reporter gene into an organism, scientists place the reporter gene and the gene of interest in the same [[DNA construct]] to be inserted into the cell or organism. For [[bacteria]] or [[eukaryote|eukaryotic cells]] in culture, this is usually in the form of a circular DNA molecule called a [[plasmid]]. It is important to use a reporter gene that is not natively expressed in the cell or organism under study, since the expression of the reporter is being used as a marker for successful uptake of the gene of interest. |
|||
* ген [[Ферменты|фермента]] [[люцифераза|люциферазы]], которая [[катализ]]ирует реакцию с [[люциферин]]ом и вызывает свечение; |
|||
* ген красного флуоресцентного белка ''[[Красный флуоресцентный белок|DsRed]]''; |
|||
Commonly used reporter genes that induce visually identifiable characteristics usually involve fluorescent and luminescent proteins; examples include the gene that encodes jellyfish [[green fluorescent protein]] (GFP), which causes [[cell (biology)|cells]] that express it to glow green under blue light, the enzyme [[luciferase]], which catalyzes a reaction with [[luciferin]] to produce light, and the red fluorescent protein from the gene dsRed. Another common reporter in bacteria is the Lac Z gene, which encodes the protein beta-galactosidase. This enzyme causes bacteria expressing the gene to appear blue when grown on a medium that contains the substrate analog [[X-gal]]. An example of a selectable-marker reporter in bacteria is the [[chloramphenicol acetyltransferase]] (CAT) gene, which confers resistance to the antibiotic [[chloramphenicol]]. |
|||
* бактериальный ген ''LacZ'', кодирующий фермент [[бета-галактозидаза|бета-галактозидазу]], экспрессия которого приводит к появлению синей окраски на среде, содержащей субстрат [[X-gal]]; |
|||
* ген [[хлорамфеникол]]-ацетилтрансферазы ({{lang-en|CAT}}) обуславливает устойчивость к антибиотику хлорамфениколу. |
|||
== Transformation and transfection assays == |
|||
Many methods of [[transfection]] and [[transformation (genetics)|transformation]] — two ways of expressing a foreign or modified gene in an organism — are effective in only a small percentage of a population subjected to the techniques. Thus, a method for identifying those few successful gene uptake events is necessary. Reporter genes used in this way are normally expressed under their own [[promotor (biology)|promoter]] independent from that of the introduced gene of interest; the reporter gene can be expressed constitutively (that is, it is «always on») or inducibly with an external intervention such as the introduction of IPTG in the β-galactosidase system. As a result, the reporter gene’s expression is independent of the gene of interest’s expression, which is an advantage when the gene of interest is only expressed under certain specific conditions or in tissues that are difficult to access. |
|||
In the case of selectable-marker reporters such as CAT, the transfected population of bacteria can be grown on a substrate that contains chloramphenicol. Only those cells that have successfully taken up the construct containing the CAT gene will survive and multiply under these conditions. |
|||
== Gene expression assays == |
|||
Reporter genes can also be used to assay for the expression of the gene of interest, which may produce a protein that has little obvious or immediate effect on the cell culture or organism. In these cases the reporter is directly attached to the gene of interest to create a [[gene fusion]]. The two genes are under the same promoter elements and are [[transcription (genetics)|transcribed]] into a single [[messenger RNA]] molecule. The [[mRNA]] is then translated into protein. In these cases it is important that both proteins be able to properly [[protein folding|fold]] into their active conformations and interact with their substrates despite being fused. In building the DNA construct, a segment of DNA coding for a flexible polypeptide linker region is usually included so that the reporter and the gene product will only minimally interfere with one another. |
|||
== Promoter assays == |
|||
Reporter genes can be used to assay for the activity of a particular promoter in a cell or organism. In this case there is no separate «gene of interest»; the reporter gene is simply placed under the control of the target promoter and the reporter gene product’s activity is quantitatively measured. The results are normally reported relative to the activity under a «consensus» promoter known to induce strong gene expression. |
|||
== Further uses == |
|||
A more complex usage of reporter genes on a large scale is in [[two-hybrid screening]], which aims to identify proteins that natively interact with one another ''[[in vivo]]''. |
|||
== Ссылки == |
== Ссылки == |
||
* [http://www.reportergene.com Информация о |
* [http://www.reportergene.com Информация о репортёрных генах] |
||
{{mol_bio-stub}} |
{{mol_bio-stub}} |
||
[[Категория:Методы молекулярной биологии]] |
[[Категория:Методы молекулярной биологии]] |
||
[[Категория:Генетика]] |
|||
[[de:Reportergen]] |
|||
[[es:Gen reportero]] |
|||
[[fr:Gène rapporteur]] |
|||
[[he:גן מדווח]] |
|||
[[ja:レポーター遺伝子]] |
|||
[[pl:Gen reporterowy]] |
Текущая версия от 21:40, 5 июня 2023
Репортёрные гены (гены-репортёры, англ. reporter gene) в молекулярной биологии — гены, которые присоединяют к регуляторным последовательностям других генов для исследования проявлений генов в культурах клеток. Некоторые репортёрные гены используются исследователями, так как их экспрессия придаёт организму чётко выраженные легко измеряемые характеристики, некоторые, — так как они являются селективными маркерами. Репортёрные гены используют для того, чтобы определить уровень экспрессии гена в клетке или в популяции. Часто в генно-инженерные конструкции встраивают в качестве репортёра ген LacZ.
Применение
[править | править код]Интересующий исследователя ген и ген-репортёр обычно встраивают в одну генетическую конструкцию, а затем вводят её в клетку или организм. В случае клеток бактерий и эукариот для введения обычно используют кольцевые молекулы ДНК — плазмиды. Важно, чтобы ген-репортёр в норме не экспрессировался в клетке, тогда его экспрессия будет означать, что интересующий ген попал в клетку.
Широкое применение находят репортёрные гены, кодирующие флуоресцентные и люминесцентные белки:
- ген медузы, кодирующий зеленый флуоресцентный белок (англ. GFP), экспрессия которого проявляется в появлении зелёного свечения при освещении синим светом;
- ген фермента люциферазы, которая катализирует реакцию с люциферином и вызывает свечение;
- ген красного флуоресцентного белка DsRed;
- бактериальный ген LacZ, кодирующий фермент бета-галактозидазу, экспрессия которого приводит к появлению синей окраски на среде, содержащей субстрат X-gal;
- ген хлорамфеникол-ацетилтрансферазы (англ. CAT) обуславливает устойчивость к антибиотику хлорамфениколу.
Ссылки
[править | править код]Это заготовка статьи по молекулярной биологии. Помогите Википедии, дополнив её. |