Проект:Биоинформатика

Целью проекта «Биоинформатика» является создание и улучшение русскоязычных статьей, посвященных высокопроизводительным технологиям современной биологии и методам биоинформатического анализа данных. Улучшение статьей является частью учебного процесса студентов ФББ МГУ, ФКН ВШЭ и ШБ. Этот проект в значительной степени вдохновлен аналогичным проектом в МФТИ.

Правила

1. Участники могут выбрать одну из статей представленных в таблице ниже или предложить статью самостоятельно, в этом случае статью необходимо согласовать с преподавателем.
2. Целью работы является получение статьей статуса добротной или улучшения ее статуса в ряду добротная-хорошая-избранная. Улучшение статуса автоматически обозначает получение максимального балла. Пожалуйста, ознакомьтесь с требованиями к статье и процедурой выдвижения
3. Над каждой статьей работают два студента: вы можете сами выбрать, с кем вы работаете над статьей.
4. Выбрав статью, вы должны сами вписать свои имена и ники в таблицу ниже.
5. Статью необходимо подготовить не позднее 24.04.2020 и прислать ссылку на нее преподавателю для проверки текста
6. Статья, не получившая статус, может быть зачтена в том случае, если она
   1. Была согласована с преподавателем и выдвинута на статус добротной не позднее 03.05.2020
   2. Все замечания, высказанные опытными участниками Википедии до 03.05.2020, должны были учтены, а необходимые исправления внесены до 12.05.2020.
7. Проверка будет осуществляться по состоянию на 12.05.2020

Кураторы проекта

1. Павел Мазин

Статьи, над которым работают участники проекта (2020 год)

Статья	Участники	Ники	Что сделать	Статус, дата сдачи
Количественный анализ экспрессии генов			улучшить структуру, расширить
Транскриптомика одиночных клеток	Потанина, Скаков	Darya Potanina		Согласовано 03.05.2020, получен статус
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)	Азбукина, Мыларщиков	DmitryOne		Согласовано 20.04.20, номинировано, ведется работа
ChIP-seq	Мищенко, Галкин	Prosto polinushka, Scibroth	добавить новую информацию о модификациях, обновить информацию о софте	Согласовано 18.04.2020, номинировано
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico	Кучеренко	Creepyorange
Функциональная аннотация геномов млекопитающих	Бартыш, Гладнева	Katyabartysh, Eva Tern		Согласовано 12.04.2020, получен статус
Энциклопедия_элементов_ДНК
Молекулярный докинг	Елизарова	evel147	Дополнить информацией из литературы и статей	Согласовано 18.04.20, получен статус
Вложенная полимеразная цепная реакция	Буян, Кравченко	Павел Крав	Перевести на русский, обязательно добавить раздел про nested PCR в основную статью Полимеразная цепная реакция и связать с новой страницей	Согласовано 29.03.2020, получен статус
Полимеразная цепная реакция в реальном_времени	Чашникова, Миронова	mimiroha	Сделать текст более структурированным, дополнить совеременной информацией про приложения, связать с ChIP и Количественным анализом экспрессии	Согласовано 12.05.2020, номинировано, замечания учтены
16S рРНК	Гусева, Юдина	Eguseva	Дополнить, дописать, зачем используется и почему, связать с релевантными страницами	Согласовано 30.03.2020, получен статус
Методы секвенирования нового поколения	Веселова, Никитин	yas0n1a, Nikkent	Дополнить, структурировать текст, добавить иллюстрации и примеры	Согласовано 23.04.2020, получен статус
Микробиом	Камышева, Шпудейко		Дополнить, структурировать текст, добавить иллюстрации и примеры	Согласовано 29.03.2020, получен статус
Предсказание структуры белка	Угольков, Васильева	Ugol24d	Дополнить - перечислить подходы, софт, etc	Согласовано 20.04.2020, получен статус
Модель замен			Довести до добротной
FASTA	Бусыгин	DaydreamingElephant	Дополнить, довести до добротной	Согласовано 16.04.2020, получен статус
Молекулярная эволюция	Цветков, Григорьян		Расширить	Согласовано 22.04.2020, номинировано, проигнорированы замечания
Двугибридный анализ	Серебренникова, Морозов		Дополнить, сделать более читаемой.	Согласовано 23.04.2020, номинировано, ведется работа
Нанопоровое секвенирование	Календр, Рюмина	E.caterina Ryu, Romanbioengee	Дописать про методы анализа, довести до добротной	Согласовано 14.04.2020, получен статус
Количественный анализ альтернативного сплайсинга	Ириоглов, Черкашина		Дополнить примерами, структурировать	Согласовано 24.04.2020, номинировано
Сборка Golden Gate	Зинкевич	Arsen-z	Перевести на русский и доработать	Согласовано 20.04.2020, получен статус, статья рекомендована в хорошие.
ATAC-seq	Минина	Minina	Создание новой статьи	Согласовано 05.03.2020, получен статус
Эпигеномика	Минина	Minina	Создание новой статьи	Согласовано 05.03.2020, получен статус
Пространственная транскриптомика	Козюлина, Гурылева		Создание новой статьи	Согласовано 24.04.2020, получен статус
Биоинформатика	Попов А, Селифанова М		Привести в порядок, добавить актуальную информацию

(2019 год) Статьи, над которым работали участники проекта

Статья	Участники	Ники	Что сделать	Статус
Групповой анализ дифференциальной экспрессии	Маргасюк, Посицельская	Sergey Margasyuk		получен статус
Количественный анализ экспрессии генов	Николаева			согласовано, требуются стилистические правки
Транскриптомика одиночных клеток	Исаев, Карпухина	serj.hop AnnShw
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
Секвенирование РНК	Морозова	morozova_ea	обновить	согласовано, получен статус
Визуализация данных секвенирования РНК	Волынкина, Галивонджян	InnaVolynkina	Добавить новую информацию, подробнее описать, подправить битые ссылки	согласовано, получен статус
Коррекция на множественное тестирование	Матвейшина, Котюргин	Mek1314		получен статус
ChIP-seq	Сефербекова, Теплова	zairasef, AdaTeplova	добавить новую информацию о модификациях, улучшить текст, связать с поиском пиков	согласовано, получен статус
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
секвенирование экзома	Карань, Пиунова	akartar.n,		согласовано, получен статус
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)	Васильева, Шагиев	Yeessa, Cyber500		получен статус
Cytoscape	Кузнецова, Максимов			согласовано, получен статус
SAMtools	Аксенова, Панова	Maribish, Nooroka		согласовано, получен статус
Предсказание генов	Борисов, Зареченская			согласовано, получен статус
Проект «Раковый геном»	Рюмин, Чаплий	ruminkd, chaplyk		согласовано, получен статус
Энциклопедия_элементов_ДНК
AutoDock	Герасева, Преображенская	Geraseva	сделать текст более читаемым, улучшить структуру	согласовано, получен статус
Молекулярный докинг	Усманов, Положинцев	Rustamusmanov973, Temasonos	Дополнить информацией из литературы и статей	согласовано
Промотор	Литвин, Радкевич	Litvinanna, Emir.radkevich	Улучшить, добавить инструменты поиска	Согласовано, получен статус
Выравнивание последовательностей	Гавриш, Авдюнина	GGleb42WP, P.avdiunina	Расширить статью, добавить информацию	согласовано, получен статус
en:Chromosome conformation capture	Калашникова, Гладкова	AKalashnikova, Gladmarine	перевести, придумать русское название	согласовано, получен статус

(2018 год) Статьи, над которым работали участники проекта

Статья	Участник[и]	Ник[и]
Групповой анализ дифференциальной экспрессии	Широковских, Байкузина	Tana_shir, P.baikuzina
Транскриптомика одиночных клеток
GenBank	Фролова, Шошинова	Froltasa, GloomyArmA
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
Коррекция на множественное тестирование
Визуализация данных секвенирования РНК
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
Модель_замен	Корзина	Askorzina
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
Секвенирование РНК
секвенирование экзома
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
Cytoscape
Теплокарта	Стариков, Ефремов	Staytunedpls, Aleks.a.efremov
Генная_онтология	Желтова, Самборская	Annetezv, margarita.samborskaya
SAMtools
Интерактом	Кашко, Кудрин	Natilika,
Предсказание генов
Проект «Раковый геном»
Энциклопедия_элементов_ДНК
FAIRE-Seq	Князева, Медведева	Naguest, Mmutilda
Секвенирование древней ДНК	Шугаева, Дианкин	Talianash, Warrdeyl
Формат файлов GFF	Сафронов, Мальков	Grigorij Saf, Ne0blako
en:N50,_L50,_and_related_statistics (перевод)	Горбачева, Ильницкий	DariaGorbacheva, ilnitsky_ivan
en:Pan-genome (перевод)	Николаева, Сигорских	Daria Nikolaeva, Andrey Sigorskikh
en:GENCODE (перевод)	Очередько, Бойко	Boiko.sash, elenaoch
en:De novo transcriptome assembly (перевод)	Макарова, Волик	makarve,

(2017 год) Статьи, над которым работали участники проекта

Статья	Количество студентов на статью	Участник[и]	Ник[и]
Ensembl	2	Злобин, Маслова	alex_the_evil, Valmarfgecnf
Групповой анализ дифференциальной экспрессии	2
Мотив (молекулярная биология)	2	Молдован, Пензар	Arajmob,Dmitrypenzar1996
Транскриптомика одиночных клеток	2	Адамейко, Галкин	Delfinio, Radiation7
Метод дробовика	2	Беженцев, Сахарова	Malenkaya vrednaya polymeraza, Eka_Sa
ДНК-микрочип	2	Кузнецова, Ливенский	kuznetmaria, livenskyi
TopHat	2	Березина, Валяева	Krevetkakrevetochka, Annvalyaeva
KEGG	2	Скибина Е., Волосникова М.	ES Skibina, Marinarazdvatri
UniProt	2	Дидковская Н., Санжаева У.	Nataliyadi, USanzhaeva
Белок-белковые взаимодействия	2	Хвень, Яровенко	Irishkasuperfresh, Brokoro
AutoDock	2	Белоусов, Пушкарёва	belv, opushkareva
GenBank	2	Кузнецов, Софронова
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)	2
Коррекция на множественное тестирование	2	Степаков, Менделевич	, Strausyatina
Логотип последовательностей	2	Рябых, Погорельская	alexapogorelskaya
Фармакогенетика	2	Безсуднова, Мухалева	Redgzb, Bezu
MEME	2	Хачатурян, Буянова	Zyukeriya, sonya_sofia7
Атлас ракового генома	2	Швецова, Корягина	theurgeforhappiness, liluoppi
BWA (выравнивание биологических последовательностей)	1	Prosvirov Kirill	Akado2009
STRING	1	Кононкова	A_Kononkova
Визуализация данных секвенирования РНК	1
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)	1	Елена Шушкевич	ElenaShush
Модель_замен	1
Поиск пиков в данных ChiP-Seq	1
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico	1
Секвенирование РНК	1	Ася Стол	smartnbeautiful
секвенирование экзома	1	Дюгай Илья
Функциональная аннотация геномов млекопитающих	1	Ксения Янкина	Salatcesar
Cytoscape	1	Ковальчук Михаил	kvlml
ChIP-seq	1	Ярослав Лозинский	Lozinsky.yaroslav
Теплокарта	1	Симонова Александра	alexandrevna
Генная_онтология	1	Сегодин Виталий	MC Poh
Метод присоединения соседей	1	Тихонова Полина	tikhonovapolly
Pfam	1	Мошенский Денис	loven-doo
SAMtools	1	Холина Татьяна	rainy_TK
Анализ метаболических потоков	1	Демкив Андрей	Andrey_demkiv
Байесовский подход в филогенетике	1	Худякова Ксения	khudyakova
Интерактом	1	Богдан Кириллов	Bakirillov
Позиционная весовая матрица	1	Сингх Лавприт	Preety
Предсказание генов	1	Чайников Антон	mrgutkun
Проект «Раковый геном»	1	Теванян Элен	Элен Теванян
Энциклопедия_элементов_ДНК	1	Филиппова Екатерина	edfilippova
FAIRE-Seq	1	Миронов Алексей
Секвенирование древней ДНК	1	Кунин Михаил
Формат файлов GFF	1	Ольга Васюткина	sunnymouse

(2016 год) Статьи, над которым работали участники проекта

Участник[и]	Ник[и]	Статья	Комментарий	Статус	дата окончания правки
Панкевич	Pankevich-ev	STARR-seq	перевод en:STARR-seq	согласовано
Образцова, Попов	Alcedattis	Пространственное_выравнивание	перевод en:Structural_alignment	согласовано
Гафуров, Меерсон, Носикова	FBA	Анализ_метаболических_потоков	перевод, en:Flux balance analysis	согласовано
Дудина, Елисеев, Малеева	Dudinadar, Glennerad	Секретомика	перевод, en:Secretomics	согласовано
Абдрахманов, Анисимова	SunnyBeque	Метагеномика	перевод en:Metagenomics	согласовано
Галкин Фёдор		Предсказание генов	перевод en:Gene_prediction	согласовано
Босхомджиева Баина, Андреева Анна	bainabos, lazyraccoon	Интерактом	перевод en:Interactome	согласовано
Гусев, Евстафьева, Желудкевич	zheludkevich.anna	Коррекция на множественное тестирование	доведение до статуса добротной	согласовано
Нуждина Екатерина	Alezanalp	BWA (выравнивание биологических последовательностей)	создание новой статьи, применение, алгоритмы, проблемы	список литературы согласован
Беседина Лиза, Вакуленко Юля	biobesedina, vakulenko_julia	Байесовский подход в филогенетике	Перевод en:Bayesian inference in phylogeny	согласовано
Шафиков Радик	iltarn.mos	Секвенирование ДНК одиночных клеток	создание новой статьи	согласовано
Травин Дмитрий, Трушина Наталия, Козлова Мария	TravinD, Nitrushina	Баркодирование ДНК	перевод en:DNA barcoding	согласовано
Мазитова Саша	AlMazitova	Метод дробовика	перевод en:Shotgun_sequencing	согласовано
Минькина Елена	Meatargz	Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico	создание новой статьи	согласовано
Тишина Соня, Федорова Алла	sonirabi, Triasteran	Множественное_выравнивание_последовательностей	перевод en:Multiple_sequence_alignment	согласовано
Марсиаль	Mahoul	Ensembl	перевод en:Ensembl	согласовано
Сутормин Дмитрий, Новикова Мария, Ежова Маргарита	sutormin94, Vadius Marie, rita501	Вызов пиков	создание новой статьи	согласовано, нет списка литературы
Кунин Михаил	mikhail_kunin	GenBank	перевод en:GenBank	согласовано
Медведев, Мамедов	D.o.medvedev, Z_Krookie	Фармакогенетика	перевод en:Pharmacogenetics	согласовано
Котлов	avkitex	AutoDock	перевод и дополнение AutoDock	согласовано
Бикметов	Bikdm	Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)	перевод en:Weighted correlation network analysis	Согласовано
Трофимов		Предсказание функции белка	перевод en:Protein_function_prediction	не согласовано

(2015 год) Статьи, над которым работали участники проекта

Участник[и]	Ник[и]	Статья	Комментарий	Статус	дата окончания правки
Алешин	Vasily msu11	Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)	улучшение существующей статьи	источники согласованы
Аккуратов	eakkuratov	визуализация данных РНК-сек	зачем нужно, что рисуют, примеры программ: genome browser, IGV, tablet, sashimi plot (MISO), …	источники согласованы
Галицына, Бредихин	Rilalim raordan, kerkomen	SAMtools	и формат bam/sam. зачем нужен, как пользоваться en:SAMtools	источники согласованы
Филаретов	Dragongene	Инкубатор:Sequence logo	может стоит придумать русское название en:Sequence_logo	источники согласованы
Столярова, Бутусова	taisniqm, amadreaera	Позиционная весовая матрица	en:Position_weight_matrix	источники согласованы
Клинк	GalkaKlink	Инкубатор:Групповой анализ дифференциальной экспрессии	GOstat, gorilla, goseq и т. д. Нужно придумать русское название.
Фоменко, Чаплин	lenafomenko, Chaplin_av	Инкубатор:Pfam	Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:Pfam	источники согласованы
Девяткин	AndreiDeviatkin	методы изучения редактирования РНК	секция в Секвенирование_РНК
Ланина	No.lanina	Энциклопедия_элементов_ДНК	улучшение существующей статьи	согласован перевод
Моисеева	janemoiseeva	Функциональная аннотация геномов млекопитающих	сайт проекта
Калинина, Новаковский, Елисеева	MarinaKalinina, fransilvion, julia-eliseeva	Атлас_Ракового_Генома	en:The_Cancer_Genome_Atlas	согласован перевод
Безменова, Сафина	bsshka, noraneko	Предпочтение кодонов	en:Codon Usage Bias, нужно придумать русское название	источники согласованы
Бурская, Сигалова	GreyCrow	Модель_замен	en:Substitution_model, нужно придумать русское название	источники согласованы
Артюхов, Прохорова	eugeniaprokhorova	Проект «Раковый геном»	en:Cancer Genome Project, en:COSMIC cancer database
Климчук	Olesyaklm	Инкубатор:STRING	en:STRING
Белова, Гречникова		секвенирование экзома	en:Exome Sequencing	согласован перевод
Максудов, Нафеев, Шарафиев		pipeline

(2014 год) Статьи, над которым работали участники проекта

Участник[и]	Ник[и]	Статья	Комментарий	Статус	дата окончания правки
		Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)	улучшение существующей статьи
Кулешов	Maxim Kuleshov	ДНК-микрочип	улучшение существующей статьи	Источники одобрены	10.05.2014
Дворкина, Муравьева	DashaDv, Fox.fbb.msu	ПЦР в реальном времени	улучшение существующей статьи	Источники одобрены	09.05.2014
Шадрина, Захаров	Olya_ldvgr, Matvey zaharov 25	FAIRE-Seq		Источники одобрены	09.05.2014
Зотова, Акулич	Umbrella22	ChIP-seq	en:ChIP-sequencing	Источники одобрены	09.05.2014
Антоненко, Шилин	Eka-hal-lo, I.Shilin	Секвенирование древней ДНК	неандертальцы, денисовец и т. д	Источники одобрены	09.05.2014
Осипова	Elosip	Транскриптомика одиночных клеток	методы, проблемы, достижения		15.05.2014
Брильков	brilkov	Секвенирование ДНК одиночных клеток	методы, проблемы, достижения
Шехирева, Залевский	KsushaSh,Aozalevsky	Предсказание вторичной структуры РНК	en:Nucleic_acid_structure_prediction	Источники одобрены	9.05.2014
Аюпов, Андрианов	ARustam, Esquel roche	Мотивы последовательностей (ДНК, РНК и белков)	en:Sequence_motif
Шмаков, Ситник	Arxcaeli, Zaheridor	Белок-белковые взаимодействия	en:Protein–protein_interaction	Перевод	15.05.2014
Поршнев, Шашков	ShashkovS	MEME	принципы работы en:Multiple_EM_for_Motif_Elicitation	Источники одобрены	15.05.2014
Тахавеев, Кондратьев	Vakeel	Cytoscape	зачем нужен, основные применения en:Cytoscape	Источники одобрены	10.05.2014
Балакирева		TopHat	принципы работы, зачем нужен, альтернативы [1]	Источники одобрены	8.05.2014
		визуализация данных РНК-сек	зачем нужно, что рисуют, примеры программ: genome browser, IGV, tablet, sashimi plot (MISO), ...
		SAMtools	и формат bam/sam. зачем нужен, как пользоваться en:SAMtools
		Bioconductor	en:Bioconductor
Гаранина, Гараева	irinagaranina, alice_garaeva	Теплокарта	улучшение существующей статьи	Источники одобрены	9.05.2014
		Sequence logo	может стоит придумать русское название en:Sequence_logo
		Позиционная весовая матрица	Position_weight_matrix
Гущина, Лунева	Gushchina	Генная_онтология	en:Gene_ontology	Источники одобрены	9.05.2014
		Gene set enrichment analysis	GOstat, gorilla, goseq и т.д. Нужно придумать русское название.
Кузькина	karatuk	nj-tree	Нужно придумать русское название. Метод_присоединения_соседей	Перевод английской вики. Согласовано.	12.05.2014
Котляров	Nikmort	Коррекция на множественное тестирование	en:Multiple_comparisons_problem
Мансурходжаев, Васетенков	Tim	KEGG	Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:KEGG	Источники одобрены	11.05.2014
Абдуллаев, Абашкин	, Dmitro_Fbb	Pfam	Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:Pfam	Источники одобрены
Сернова	wild_cat_NVS	UniProt	Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:UniProt	Источники одобрены	08.05.2014
Шарапова, Андреянова	Yana,ekaandreyanova	Формат файлов GFF	en:General_feature_format	Источники одобрены	09.05.2014
Иванова, Цепкова	Della FeniX,	Секвенирование_РНК	улучшение существующей статьи		09.05.2014
		методы изучения редактирования РНК	секция в Секвенирование_РНК
		Энциклопедия_элементов_ДНК	улучшение существующей статьи

(2013 год) Статьи, над которым работали участники проекта

Участник[и]	Статья	Комментарий	Статус
Александров, Аюпов	Methyl Array	www.illumina.com	Источники одобрены
Вербицкая	Бисульфитное секвенирование	Русская статья сильно меньше английской	Перевод с английского
Анисенко, Золотарев, Галиева	Открытый хроматин	необходимо активное взаимодействие с участниками, пишущими про DNase и FAIRE	Источники одобрены
Братцева, Ибрагимов	DNase-seq	DNase I hypersensitive sites sequencing	Источники одобрены
Изотова	FAIRE-Seq
Гуляева, Козлова	Иммунопреципитация	В списке изначально был RIP-[seq, chip, etc], однако это при отсутствии статьи по иммунопреципитации это как-то преждевременно	Источники одобрены
Ярахмедов, Иванов	Профилирование РНК	Статья должна описывать основные типы анализа клеточной РНК сгруппированные по ее (РНК) типу: по биологическому типу: polyA/not-polyA, short, microRNA, non-coding RNA, etc.; по локализации: цитоплазма, ядро, ядрышко и т.д. - см варианты в ENCODE.
Джумашев, Коннова	Кэп-анализ экспрессии генов	Cap analysis gene expression	Источники одобрены
Калинина	ДНК-микрочип	Существующая статья совсем маленькая	Источники одобрены
Карпов, Евсютина	Секвенирование спаренных концов	Необоходимо написать общую статью про PET и добавить разделы или отдельные статьи про RNA-PET (Карпов) и про DNA-PET (Евсютина)	Источники одобрены
Карпова	Секвенирование РНК	RNA-seq	Источники одобрены
Дзама, Маллохассани	Альтернативный сплайсинг	Существующая статья совсем маленькая.	Источники одобрены
Кирюхина	ChIP-seq	необходимо взаимодействие с авторами статьи про иммунопреципитацию
Лопатина	Определение конформации хромосом	en:Chromosome conformation capture	Источники одобрены
Максимычев	ChIA-PET	en:ChIA-PET	Источники одобрены
Журавлева, Нафеев	Позиционирование нуклеосом		Источники одобрены
Золотарева, Рябичко	Протеомика	Должны быть описаны основные варианты масс-спек анализа протеомов.	Источники одобрены
Караваева, Тухбатова	Профилирование репликации	Repli-chip, Repli-seq	Источники одобрены
Кузнецов	Двугибридный анализ		Источники одобрены
Маслова, Миссарова	Методы секвенирования нового поколения Высокоэффективное секвенирование	Небольшая статья про просто секвенирование уже есть. Следует либо дополнить ее, либо написать новую. В последнем случае надо не забыть добавить ссылку на статью про секвенирование. Необходимо взаимодействие с участниками, пишущими про отдельные методы	Источники одобрены
Медведева, (Ширшиков отказался)	Illumina/Solexa_method	Существует статья про компанию, нужна про принцип метода.
Мигур, Пятницкий	SOLiD		Источники одобрены
Мукосей, Лапшин	Helicos Biosciences		Источники одобрены
Никулина	Polony sequencing		Источники одобрены
Потанин	Ion semiconductor sequencing		Источники одобрены
Нарайкина, Шелякин	Одномолекулярное секвенирование в реальном времени		Источники одобрены
Борисевич	Нанопоровое секвенирование		Источники одобрены
Попков, Сапунов	Картирование коротких ридов	надо подумать над названием	Источники одобрены
Свистунова, Солдатов	Инкубатор:Количественный анализ экспрессии генов		Источники одобрены
Синицын, Ступников	Количественный анализ альтернативного сплайсинга		Источники одобрены
Сливко-Кольчик, Танас	differential (two samples) analysis of gene expression and alternative splicing	надо написать разделы в Количественный анализ экспрессии генов и Количественный анализ альтернативного сплайсинга. Рекомендуется объединить усилия с участниками, пишущими про time series.	Источники одобрены
Червонцева, Тетерина	time series analysis of gene expression and alternative splicing	Дописать необходимые разделы в Количественный анализ экспрессии генов и Количественный анализ альтернативного сплайсинга. Необходимо обратить внимания на все сложные модели (кроме попарных сравнений) а не только на временные зависимости. Рекомендуется объединить усилия с участниками, пишущими про парные сравнения.	Источники одобрены
Чернецова, Труханов	Однонуклеотидный полиморфизм	дописать саму статью и добавить методы поиска	Источники одобрены
Шерстюк, Чуклина, Мухина	Полногеномный поиск ассоциаций	Так как на русском статьи про GWAS нет, то стоит начать с нее, а "SNP imputation" сделать разделом или отдельной страницей - в зависимости от объема.	Источники одобрены
Давтян		Предлагается примкнуть к группе пишущей про GWAS
Балычев	Выравнивание последовательностей	en:Sequence alignment	Перевод с английского