Биоинформатика: различия между версиями
| [непроверенная версия] | [непроверенная версия] |
GolerGkA (обсуждение | вклад) Перевод содержания |
GolerGkA (обсуждение | вклад) Нет описания правки |
||
| Строка 1: | Строка 1: | ||
'''Биоинформа́тика''' или '''вычисли́тельная биоло́гия''' — новая ветвь науки, в которой используются методы [[прикладная математика|прикладной математики]], [[статистика|статистики]] и [[информатика|информатики]] для решения [[биология|биологических]] задач. Исследования в вычислительной биологии нередко пересекаются с [[системная биология|системной биологией]]. Основные исследовательские усилия в этой области включают обнаружения [[ген]]ов, построение [[геном]]а, разбор структуры [[белок|белков]], предсказание структуры белков, предсказания кода генов и межбелковых взаимодействий, а также моделирование [[эволюция|эволюции]]. Термины ''биоинформатика'' и ''вычислительная биология'' часто взаимозаменяются, хотя последний чаще указывает на разработку [[алгоритм]]ов и конкретные вычислительные методы. Биоинформатика и её методы используются также в [[Биохимия|биохимии]] и [[Биофизика|биофизике]]. Основная линия в проектах биоинформатики — это использование [[математика|математических]] средств для извлечения полезной [[информация|информации]] из «шумных» данных, полученных с помощью биологичеких методов. Типичные задачи вычислительной биологии включают монтаж высококачественных [[ДНК]]-цепей из раздробленных участков, и предсказание предписаний гена, которые могут быть получены в м-ДНК или посредством [[масс-спектрометрия|масс-спектрометрии]]. |
'''Биоинформа́тика''' или '''вычисли́тельная биоло́гия''' — новая ветвь науки, в которой используются методы [[прикладная математика|прикладной математики]], [[статистика|статистики]] и [[информатика|информатики]] для решения [[биология|биологических]] задач. Исследования в вычислительной биологии нередко пересекаются с [[системная биология|системной биологией]]. Основные исследовательские усилия в этой области включают обнаружения [[ген]]ов, построение [[геном]]а, разбор структуры [[белок|белков]], предсказание структуры белков, предсказания кода генов и межбелковых взаимодействий, а также моделирование [[эволюция|эволюции]]. Термины ''биоинформатика'' и ''вычислительная биология'' часто взаимозаменяются, хотя последний чаще указывает на разработку [[алгоритм]]ов и конкретные вычислительные методы. Биоинформатика и её методы используются также в [[Биохимия|биохимии]] и [[Биофизика|биофизике]]. Основная линия в проектах биоинформатики — это использование [[математика|математических]] средств для извлечения полезной [[информация|информации]] из «шумных» данных, полученных с помощью биологичеких методов. Типичные задачи вычислительной биологии включают монтаж высококачественных [[ДНК]]-цепей из раздробленных участков, и предсказание предписаний гена, которые могут быть получены в м-ДНК или посредством [[масс-спектрометрия|масс-спектрометрии]]. |
||
{{wikify}} |
{{wikify}} |
||
| ⚫ | |||
==Основные области исследований== |
==Основные области исследований== |
||
===Анализ генетических последовательностей=== |
===Анализ генетических последовательностей=== |
||
| ⚫ | |||
Since the [[Phi-X174 phage|Phage Φ-X174;]] was [[sequencing|sequenced]] in 1977, the [[DNA sequence]]s of more and more organisms have been decoded and stored in electronic databases. This data is analyzed to determine genes that code for [[protein]]s, as well as regulatory sequences. A comparison of genes within a [[species]] or between different species can show similarities between protein functions, or relations between species (the use of [[molecular systematics]] to construct [[phylogenetic tree]]s). With the growing amount of data, it long ago became impractical to analyze DNA sequences manually. Today, [[computer program]]s are used to search the [[genome]] of thousands of organisms, containing billions of [[nucleotide]]s. These programs can compensate for mutations (exchanged, deleted or inserted bases) in the DNA sequence, in order to identify sequences that are related, but not identical. A variant of this [[sequence alignment]] is used in the sequencing process itself. The so-called [[shotgun sequencing]] technique (which was used, for example, by [[The Institute for Genomic Research]] to sequence the first bacterial genome, ''Haemophilus influenza'') does not give a sequential list of nucleotides, but instead the sequences of thousands of small DNA fragments (each about 600-800 nucleotides long). The ends of these fragments overlap and, when aligned in the right way, make up the complete genome. Shotgun sequencing yields sequence data quickly, but the task of assembling the fragments can be quite complicated for larger genomes. In the case of the [[Human Genome Project]], it took several months of CPU time (on a circa-2000 vintage DEC Alpha computer) to assemble the fragments. Shotgun sequencing is the method of choice for virtually all genomes sequenced today, and [[genome assembly]] algorithms are a critical area of bioinformatics research. |
|||
--> |
|||
C тех пор как в [[1977]] году был [[Секвенирование|секвенирован]] фаг Phi-X174, [[Генетический код| Последовательности ДНК]] всё большего числа организмов были дешифрованы и сохранены в базах данных. Эти данные используются для определения генетических последовательностей [[Белок|белков]] и регуляторных участков. Сравнение генов в рамках одного или разных [[Вид|видов]] может продемонстрировать сходство функций белков или отношения между видами (таким образом могут быть составлены [[филогенетические деревья]]). С возрастанием количества данных уже давно стало невозможным вручную анализировать последовательности. В наши дни для поиска по [[Геном|геномам]] тысяч организмов, состоящих из миллиардов пар нуклеотидов используются компьютерные программы. |
|||
<!-- |
|||
====Аннотация геномов==== |
====Аннотация геномов==== |
||
===Вычислительная эволюционная биология=== |
===Вычислительная эволюционная биология=== |
||
Версия от 10:24, 25 января 2006
Биоинформа́тика или вычисли́тельная биоло́гия — новая ветвь науки, в которой используются методы прикладной математики, статистики и информатики для решения биологических задач. Исследования в вычислительной биологии нередко пересекаются с системной биологией. Основные исследовательские усилия в этой области включают обнаружения генов, построение генома, разбор структуры белков, предсказание структуры белков, предсказания кода генов и межбелковых взаимодействий, а также моделирование эволюции. Термины биоинформатика и вычислительная биология часто взаимозаменяются, хотя последний чаще указывает на разработку алгоритмов и конкретные вычислительные методы. Биоинформатика и её методы используются также в биохимии и биофизике. Основная линия в проектах биоинформатики — это использование математических средств для извлечения полезной информации из «шумных» данных, полученных с помощью биологичеких методов. Типичные задачи вычислительной биологии включают монтаж высококачественных ДНК-цепей из раздробленных участков, и предсказание предписаний гена, которые могут быть получены в м-ДНК или посредством масс-спектрометрии.
 | Эту статью необходимо исправить в соответствии с правилом Википедии об оформлении статей. |
Основные области исследований
Анализ генетических последовательностей
C тех пор как в 1977 году был секвенирован фаг Phi-X174, Последовательности ДНК всё большего числа организмов были дешифрованы и сохранены в базах данных. Эти данные используются для определения генетических последовательностей белков и регуляторных участков. Сравнение генов в рамках одного или разных видов может продемонстрировать сходство функций белков или отношения между видами (таким образом могут быть составлены филогенетические деревья). С возрастанием количества данных уже давно стало невозможным вручную анализировать последовательности. В наши дни для поиска по геномам тысяч организмов, состоящих из миллиардов пар нуклеотидов используются компьютерные программы.
 | Это заготовка статьи по биологии. Помогите Википедии, дополнив её. |