Бактериородопсин

Бактериородопсин
Bacteriorhodopsin trimer
Идентификаторы
Символ	Bac_rhodopsin
Pfam	PF01036
InterPro	IPR001425
PROSITE	PDOC00291
SCOP	2brd
SUPERFAMILY	2brd
TCDB	3.E.1
OPM superfamily	6
OPM protein	1vgo
Доступные структуры белков
Pfam	структуры
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	3D-модель
Медиафайлы на Викискладе

Бактериородопсин - светочувствительный белок, подобный зрительному родопсину человеческого глаза, встречающийся в бактериях (например, в галобактериях). Отностся к мембранным белкам, основная функциях которого провести протон через мембрану.

Состав белка

Трансмембранная часть бактериородопсина сложена из 7 регулярных $\alpha$ -спиралей, идущих от одного до другого края мембраны, а одинокая $\beta$-шпилька и все нерегулярные участки цепи (соединяющие спирали-петли) выходят из мембраны. Сидящие на $\alpha$-спиралях гидрофобные группы обращенны “наружу” к липидам (тоже гидрофобным) мембраны. Полярные же группы (их немного) обращены внутрь очень узкого канала, по которому идет протон.

Процесс переноса протона через мембрану

Протонная проводимость осуществляется при содействии прикрепленной внутри пучка спиралей молекулы кофактора – ретиналя. Он перекрывает центральный канал бактериородопсина. Поглотив фотон, ретиналь переходит из trans- в cis- форму. При этом он изгибается и переносит протон с одного конца семиспирального пучка на другой. А потом ретиналь разгибается и возвращается назад, но уже без протона.

Литература

• А.В. Финкельштейн, О.Б. Птицын, "Физика белка", 2002

См. также

• Родопсин
• Ретинол
• Сенсорный родопсин II