N-Конец
N-Конец (англ. N-terminus), также амино-конец — аминогруппа первой аминокислоты, с которой начинается молекула белка или пептид[1].
Каждая аминокислота имеет аминогруппу и карбоксильную группу. Аминокислоты связываются друг с другом посредством реакции дегидратации присоединением карбоксильной группы одной аминокислоты к аминогруппе другой. Таким образом, полипептидные цепочки заканчиваются свободной карбоксильной группой — C-концом, а начинаются с аминогруппы — N-конца[1].
Методы определения N-концевой аминокислоты
Для определения природы N-концевой аминокислоты предложен ряд методов, в частности метод Сэнджера (F. Sanger), основанный на реакции арилирования полипептида 2,4-динитрофторбензолом (ДНФБ), что приводит к образованию окрашенного в желтый цвет 2,4-динитрофенильного производного N-концевой аминокислоты . Раствор полипептида обрабатывают ДНФБ, который взаимодействует со свободной NH2-группой N-концевой аминокислоты пептида.
После кислотного гидролиза продукта реакции – динитрофенилпептида только одна N-концевая аминокислота оказывается связанной с реактивом в виде 2,4-динитрофениламинокислоты (стабильной при гидролизе). В отличие от других образовавшихся при гидролизе полипептида свободных аминокислот она желтого цвета. Ее идентифицируют методом хроматографии.
Для определения N-концевой аминокислоты значительно более широко применяется фенилтиогидантоиновый метод Эдмана благодаря своей высокой чувствительности и возможности многократного использования в одной и той же пробе. Фенилизотиоцианат реагирует со свободной α-NH2-группой N-концевой аминокислоты полипептида с образованием фенилтиокарбамоилпептида.
Примечания
- ↑ 1 2 Нельсон, Кокс, 2011, с. 128.
Литература
- Дэвид Л. Нельсон, Майкл М. Кокс. Основы биохимии Ленинджера. — Бином, 2011. — Т. 1. — 692 с. — ISBN 978-5-94774-365-4.