SARS-CoV-2
| SARS-CoV-2 | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | ||||||||
| Научная классификация | ||||||||
|
Реалм: Царство: Тип: Класс: Порядок: Подпорядок: Cornidovirineae Семейство: Подсемейство: Род: Штамм: SARS-CoV-2 |
||||||||
| Международное научное название | ||||||||
| 2019-nCoV | ||||||||
| Группа по Балтимору | ||||||||
| IV: (+)оцРНК-вирусы | ||||||||
| ||||||||
2019-nCoV (по обозначению Всемирной организацией здравоохранения[2][3]) — одноцепочечный РНК-содержащий вирус, впервые обнаруженный в декабре 2019 года после тестирования нуклеиновой кислоты на положительной пробе у пациента с пневмонией во время вспышки пневмонии в Ухане 2019—2020 годов[4][5][6].
20 января 2020 года в китайской провинции Гуандун была подтверждена передача вируса от человека к человеку[7]. Пока какого-либо специфического лечения нового вируса не разработано.
Подтверждено более 1330 случаев заражения и 41 смерть от вируса.
По данным на 25 января зафиксировано 38 случаев успешного излечения от 2019-nCoV[8].
Температура тела одного пациента держалась в норме на протяжении 6 дней. Повторное исследование показало, что воспаление было полностью устранено, а два новых типа тестов на нуклеиновую кислоту на коронавирус показали отрицательный результат. После оценки городской экспертной группой он был выписан домой[9].
Распространение вируса
Вирус зафиксирован в Китае (1330 подтверждённых заражённых)[8], Таиланде (5), Гонконге (5), Сингапуре (3), Тайване (3), Макао (2), Вьетнаме (2), Японии (2), Южной Корее (2), США (2), Франции (2), Непале (1), Австралии (1), России (1). Зафиксирован 41 смертельный случай в Китае[8].
Пик эпидемии по прогнозам придётся на февраль 2020 года[10].
Симптомы
Симптомы коронавируса 2019-nCoV схожи с симптомами пневмонии или тяжёлого острого респираторного синдрома:
- Потеря сознания (в результате прогрессирующего разрушения лёгочных тканей)
- Сухой, непродуктивный кашель
- Лихорадка и повышение температуры (38 °С или выше, озноб)
- Затруднения при дыхании
- Боли в области груди
- Головная боль
- Миалгия
- Общее недомогание
Инкубационный период длится в течение 6—12 дней. Если инфицирование произошло от человека к человеку, то инкубационный период не превышает пяти дней. Более продолжительные сроки инкубационного периода могут быть характерны при передаче вируса от животных.
Предварительный анализ данных позволяет утверждать, что имеется высокая контагиозность при контакте с больным человеком.
Подтверждена и продемонстрирована передача вируса от человека к человеку[11].
Лица, контактировавшие в домашних или больничных условиях с заболевшими, наиболее подверженны возникновению стадии острого респираторного заболевания, в случае которого непосредственной причиной смерти является прогрессирующая острая неконтролируемая дыхательная недостаточность (респираторный дистресс-синдром).
Вирусология
Последовательности бетакоронавируса[англ.] обнаруживают сходство с бетакоронавирусами, выявленными у летучих мышей из Китая. Однако вирус генетически отличается от других коронавирусов, которые вызывают[12]:
- тяжёлый острый респираторный синдром (SARS-CoV), известный также как атипичная пневмония;
- ближневосточный респираторный синдром (MERS-CoV).
2019-nCoV, как и SARS-CoV, является членом линии Beta-CoV B[13].
Было выделено, описано и исследуется пять геномов нового коронавируса[6][14][15]:
- BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019;
- BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-04/2020;
- BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-05/2019;
- BetaCoV/Wuhan/WIV04/2019;
- BetaCoV/Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019.
Длина РНК-последовательности коронавируса составляет около 30 000 нуклеотидов.
РНК варианта Wuhan-Hu-1[16] (номер GenBank MN908947) 2019-nCoV содержит 29 903 нуклеотида с нетранслируемыми участками длиной 281 и 325 нуклеотидов. Предполагаемые кодирующие области распределены по 10 белкам. С точки зрения последовательности генов это соответствует вирусу SARS-CoV и иным коронавирусам.
Источник вируса
22 января 2020 года медицинский журнал Journal of Medical Virology[англ.] опубликовал исследование китайских учёных, в котором пять геномов вируса 2019-nCoV сопоставили с 276 известными геномными последовательностями коронавирусов, поражающих людей и различных животных. По мнению учёных, построенное филогенетическое древо коронавирусов показывает, что новые вирусы появились ориентировочно два года назад от одного общего предка, путём гомологичной рекомбинации между коронавирусом летучей мыши и, возможно, коронавирусом китайских змей — южнокитайского многополосного крайта или китайской кобры (обе разновидности змей продавались на рынке в Ухане в качестве экзотической пищи[англ.])[17][18].
Однако, ряд исследователей оспаривают (публикация в журнале Nature)[19] подобный вывод китайских учёных[20], и утверждают, что, с их точки зрения, маловероятно, что в качестве источника заражения могли выступить змеи, где наиболее вероятными кандидатами на эту роль являются млекопитающие и птицы. По мнению Пауло Эдуардо Брандао, вирусолога из Университета Сан-Паулу, китайские учёные не представили доказательств того, что змеи могут заражаться новым коронавирусом и служат для него хозяином, в том числе поскольку нет надёжных доказательств наличия коронавирусов у хозяев, кроме млекопитающих и птиц. Цуй Цзе, вирусолог из Шанхайского института Пастера, входивший в группу, выявившую в 2017 году вирусы, связанные с атипичной пневмонией у летучих мышей, сообщает, что полевые работы после вспышки атипичной пневмонии в 2002—2003 годах обнаружили такие вирусы только у млекопитающих.
Другая группа китайских учёных предполагает, что источником вируса 2019-nCoV являются летучие мыши, поскольку 2019-nCoV на 96 % идентичен геному коронавируса летучих мышей[21].
Профилактика и лечение
Всемирная организация здравоохранения дала рекомендации[22] по снижению риска заражения 2019-nCoV:
- часто мыть руки с мылом или средством на основе спирта;
- при кашле и чиханье прикрывать рот и нос локтем или платком;
- избегать тесного контакта с людьми, у которых есть жар или кашель;
- не употреблять в пищу сырые или не до конца прошедшие готовку продукты животного происхождения.
В основном, пациенты получают симптоматическую и поддерживающую терапию[23]. В январе 2020 года медики в Китае опробовали метод лечения пневмонии, вызванной коронавирусом 2019-nCoV, путем экстракорпоральной оксигенации — насыщения крови кислородом (ЭКМО)[24].
См. также
Примечания
- ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
- ↑ Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV)
- ↑ Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China. Cdc.gov (10 января 2020). Дата обращения: 16 января 2020.
- ↑ 中国疾病预防控制中心. www.chinacdc.cn. Дата обращения: 9 января 2020.
- ↑ New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert – Xinhua | English.news.cn. www.xinhuanet.com. Дата обращения: 9 января 2020.
- ↑ 1 2 CoV2020. platform.gisaid.org. Дата обращения: 12 января 2020.
- ↑ "China confirms human-to-human transmission of new coronavirus". CBC News. 2020-01-20. Дата обращения: 21 января 2020.
{{cite news}}: Википедия:Обслуживание CS1 (url-status) (ссылка) - ↑ 1 2 3 全国 确诊 923 例 疑似 1076 例 治愈 36 例 死亡 26 例.
- ↑ 澎湃新闻. 上海首例新型肺炎确诊病例治愈出院. news.sina.com.cn (24 января 2020). Дата обращения: 24 января 2020.
- ↑ Пик эпидемии пневмонии нового типа в Китае может прийтись на февраль. ТАСС. Дата обращения: 25 января 2020.
- ↑ The Associated Press. China confirms human-to-human transmission of new coronavirus. CBC / Radio Canada (ноябрь 2020).
- ↑ Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses. nextstrain. Дата обращения: 18 января 2020.
- ↑ Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses. nextstrain. Дата обращения: 18 января 2020.
- ↑ Initial genome release of novel coronavirus (амер. англ.). Virological (11 января 2020). Дата обращения: 12 января 2020.
- ↑ NCBI: Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome
- ↑ NCBI: Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome
- ↑ Wei Ji, 2020, с. 1—29.
- ↑ Китайский коронавирус оказался гибридом вирусов змеи и летучей мыши.
- ↑ Callaway, 2020.
- ↑ Snakes?! The Slippery Truth of a Flawed Wuhan Virus Theory. One paper advanced a controversial theory about the disease's origin. Other scientists aren't biting.
- ↑ Zhou, 2020.
- ↑ Novel Coronavirus (2019-nCoV) advice for the public
- ↑ Главное о китайском коронавирусе. Есть ли опасность массового заражения жителей России. Телеканал 360°, 22 января 2020.
- ↑ В Китае выявили метод лечения нового коронавируса. «Известия», 23 января 2020.
Литература
- Zhang Y.-Z. et al. [GenBank Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome] (англ.) : journal. — Bethesda MD, 2020. — 12 January.
- Ji W., Wang W., Zhao X., Zai J., Li X. J. Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human (англ.) // Journal of Medical Virology : журнал. — Hoboken, New Jersey: Wiley-Blackwell, 2020. — 22 January. — P. 1—29. — ISSN 1096-9071. — doi:10.1002/jmv.25682.
- Callaway E., Cyranoski D. Why snakes probably aren’t spreading the new China virus. One genetic analysis suggests reptilian reservoir — but researchers doubt that the coronavirus could have originated in animals other than birds or mammals (англ.) // Nature : журнал. — Nature Publishing Group, 2020. — 23 January. — doi:10.1038/d41586-020-00180-8.
- Peng Zhou, Xing-Lou Yang, Xian-Guang Wang, Ben Hu, Lei Zhang, Wei Zhang, Hao-Rui Si, Yan Zhu, Bei Li, Chao-Lin Huang, Hui-Dong Chen, Jing Chen, Yun Luo, Hua Guo, Ren-Di Jiang, Mei-Qin Liu, Ying Chen, Xu-Rui Shen, Xi Wang, Xiao-Shuang Zheng, Kai Zhao, Quan-Jiao Chen, Fei Deng, Lin-Lin Liu, Bing Yan, Fa-Xian Zhan, Yan-Yi Wang, Gengfu Xiao, Zheng-Li Shi. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin (англ.) // bioRxiv : сайт. — 2020. — 23 January. — P. 1—18. — doi:10.1101/2020.01.22.914952.