CAP1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Это старая версия этой страницы, сохранённая Shuvaev (обсуждение | вклад) в 21:14, 5 февраля 2020 (викификация). Она может серьёзно отличаться от текущей версии.
Перейти к навигации Перейти к поиску
Отпатрулированная версия этой страницы, проверенная 5 февраля 2020, была основана на этой версии.
CAP1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1K8F

Идентификаторы
ПсевдонимыCAP1, CAP, CAP1-PEN, CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast), adenylate cyclase associated protein 1
Внешние IDOMIM: 617801 MGI: 88262 HomoloGene: 74572 GeneCards: CAP1
Расположение гена (Мышь)
4-я хромосома мыши
Хр.4-я хромосома мыши[1]
4-я хромосома мыши
Расположение в геноме CAP1
Расположение в геноме CAP1
Локус4|4 D2.2Начало122,752,840 bp[1]
Конец122,779,849 bp[1]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
    н/д
Наибольшая экспрессия в
  • lateral septal nucleus

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell

  • transitional epithelium of urinary bladder

  • tibiofemoral joint

  • decidua
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

10487

12331

Ensembl

ENSG00000131236

ENSMUSG00000028656

UniProt

Q01518
Q5T0R9

P40124

RefSeq (мРНК)

NM_001105530
NM_006367
NM_001330502

NM_001301067
NM_007598
NM_001358035
NM_001358036

RefSeq (белок)
NP_001099000
NP_001317431
NP_006358
NP_001337404
NP_001337405

NP_001337406
NP_001337407
NP_001337408
NP_001337409
NP_001337410
NP_001337411
NP_001337412
NP_001337413
NP_001337414

NP_001287996
NP_031624
NP_001344964
NP_001344965

Локус (UCSC)н/дChr 4: 122.75 – 122.78 Mb
Поиск по PubMedИскать[2]Искать[3]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

CAP1 (англ. Adenylyl cyclase-associated protein 1) — белок, регулирующий динамику актина. Продукт гена CAP1[4][5][6]

Функция

Белок регулирует динамику актиновых филаментов и участвует в ряде комплексных процессов развития и морфологии, включая локализацию мРНК и установление полярности клетки.

Структура

Ген CAP1 близок по структуре с соответствующим геном CAP из S. cerevisiae, который играет роль в сигнальном пути цАМФ. Белок человека CAP1 взаимодействует с другим CAP1, а также с CAP2 и актином[6]. Белок состоит из 475 аминокислот, молекулярная масса 51,9 кДа. Содержит домен C-CAP (319–453). Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 3 изоформ белка.

Взаимодействия

CAP1 взаимодействует с ACTG1[7] и CAP2[5].

Литература

  • Yu G, Swiston J, Young D (1994). "Comparison of human CAP and CAP2, homologs of the yeast adenylyl cyclase-associated proteins". J. Cell Sci. 107 (6): 1671—8. PMID 7962207.
  • Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides". Gene. 138 (1—2): 171—4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library". Gene. 200 (1—2): 149—56. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
  • Moriyama K, Yahara I (2003). "Human CAP1 is a key factor in the recycling of cofilin and actin for rapid actin turnover". J. Cell Sci. 115 (Pt 8): 1591—601. PMID 11950878.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
  • Gevaert K, Goethals M, Martens L, et al. (2004). "Exploring proteomes and analyzing protein processing by mass spectrometric identification of sorted N-terminal peptides". Nat. Biotechnol. 21 (5): 566—9. doi:10.1038/nbt810. PMID 12665801.
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40—5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
  • Dodatko T, Fedorov AA, Grynberg M, et al. (2004). "Crystal structure of the actin binding domain of the cyclase-associated protein". Biochemistry. 43 (33): 10628—41. doi:10.1021/bi049071r. PMID 15311924.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121—7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173—8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514.
  • Fautsch MP, Vrabel AM, Johnson DH (2006). "The identification of myocilin-associated proteins in the human trabecular meshwork". Exp. Eye Res. 82 (6): 1046—52. doi:10.1016/j.exer.2005.09.016. PMID 16289162.
  • Oh JH, Yang JO, Hahn Y, et al. (2006). "Transcriptome analysis of human gastric cancer". Mamm. Genome. 16 (12): 942—54. doi:10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674.
  • Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. (2006). "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1". Nature. 441 (7091): 315—21. Bibcode:2006Natur.441..315G. doi:10.1038/nature04727. PMID 16710414.
  • Beranova-Giorgianni S, Zhao Y, Desiderio DM, Giorgianni F (2006). "Phosphoproteomic analysis of the human pituitary". Pituitary. 9 (2): 109—20. doi:10.1007/s11102-006-8916-x. PMID 16807684.
  • Garewal G, Das R, Awasthi A, et al. (2007). "The clinical significance of the spectrum of interactions of CAP+1 (A-->C), a silent beta-globin gene mutation, with other beta-thalassemia mutations and globin gene modifiers in north Indians". Eur. J. Haematol. 79 (5): 417—21. doi:10.1111/j.1600-0609.2007.00958.x. PMID 17900295.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028656 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Matviw H, Yu G, Young D (Nov 1992). "Identification of a human cDNA encoding a protein that is structurally and functionally related to the yeast adenylyl cyclase-associated CAP proteins". Mol Cell Biol. 12 (11): 5033—40. PMC 360436. PMID 1406678.
  5. ↑ 1 2 Hubberstey A, Yu G, Loewith R, Lakusta C, Young D (Apr 1997). "Mammalian CAP interacts with CAP, CAP2, and actin". J Cell Biochem. 61 (3): 459—66. doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19960601)61:3<459::AID-JCB13>3.0.CO;2-E. PMID 8761950.
  6. ↑ 1 2 Entrez Gene: CAP1 CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast).
  7. ↑ Hubberstey, A; Yu G; Loewith R; Lakusta C; Young D (Jun 1996). "Mammalian CAP interacts with CAP, CAP2, and actin". J. Cell. Biochem. 61 (3). UNITED STATES: 459—66. doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19960601)61:3<459::AID-JCB13>3.0.CO;2-E. ISSN 0730-2312. PMID 8761950.
Источник — https://ru.wikipedia.org/ruwiki/w/index.php?title=CAP1&oldid=104974196