Целью проекта «Биоинформатика» является создание и улучшение русскоязычных статьей, посвященных высокопроизводительным технологиям современной биологии и методам биоинформатического анализа данных. Улучшение статьей является частью учебного процесса студентов ФББ МГУ , ФКН ВШЭ и ШБ. Этот проект в значительной степени вдохновлен аналогичным проектом в МФТИ .
Правила
Участники могут выбрать одну из статей представленных в таблице ниже или предложить статью самостоятельно, в этом случае статью необходимо согласовать с преподавателем.
Целью работы является получение статьей статуса добротной или улучшения ее статуса в ряду добротная-хорошая-избранная. Улучшение статуса автоматически обозначает получение максимального балла. Пожалуйста, ознакомьтесь с требованиями к статье и процедурой выдвижения
Над каждой статьей работают два студента: вы можете сами выбрать, с кем вы работаете над статьей.
Выбрав статью, вы должны сами вписать свои имена и ники в таблицу ниже.
Статью необходимо подготовить не позднее 24.04.2020 и прислать ссылку на нее преподавателю для проверки текста
Статья, не получившая статус, может быть зачтена в том случае, если она
Была согласована с преподавателем и выдвинута на статус добротной не позднее 03.05.2020
Все замечания, высказанные опытными участниками Википедии до 03.05.2020, должны были учтены, а необходимые исправления внесены до 12.05.2020.
Проверка будет осуществляться по состоянию на 12.05.2020
Кураторы проекта
Павел Мазин
Статьи, над которым работают участники проекта (2020 год)
Статья
Участники
Ники
Что сделать
Статус, дата сдачи
Количественный анализ экспрессии генов
улучшить структуру, расширить
Транскриптомика одиночных клеток
Потанина, Скаков
Darya Potanina
Согласовано 03.05.2020, номинировано, замечания учтены
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
Азбукина, Мыларщиков
DmitryOne
Согласовано 20.04.20, номинировано, ведется работа
ChIP-seq
Мищенко, Галкин
Prosto polinushka, Scibroth
добавить новую информацию о модификациях, обновить информацию о софте
Согласовано 18.04.2020, номинировано
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
Кучеренко
Creepyorange
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
Бартыш, Гладнева
Katyabartysh, Eva Tern
Согласовано 12.04.2020, получен статус
Энциклопедия_элементов_ДНК
Молекулярный докинг
Елизарова
evel147
Дополнить информацией из литературы и статей
Согласовано 18.04.20, номинировано
Вложенная полимеразная цепная реакция
Буян, Кравченко
Павел Крав
Перевести на русский, обязательно добавить раздел про nested PCR в основную статью Полимеразная цепная реакция и связать с новой страницей
Согласовано 29.03.2020, получен статус
Полимеразная цепная реакция в реальном_времени
Чашникова, Миронова
mimiroha
Сделать текст более структурированным, дополнить совеременной информацией про приложения, связать с ChIP и Количественным анализом экспрессии
Согласовано 12.05.2020, номинировано, замечания учтены
16S рРНК
Гусева, Юдина
Eguseva
Дополнить, дописать, зачем используется и почему, связать с релевантными страницами
Согласовано 30.03.2020, получен статус
Методы секвенирования нового поколения
Веселова, Никитин
yas0n1a, Nikkent
Дополнить, структурировать текст, добавить иллюстрации и примеры
Согласовано 23.04.2020, получен статус
Микробиом
Камышева, Шпудейко
Дополнить, структурировать текст, добавить иллюстрации и примеры
Согласовано 29.03.2020, номинировано
Предсказание структуры белка
Угольков, Васильева
Ugol24d
Дополнить - перечислить подходы, софт, etc
Согласовано 20.04.2020, номинировано
Модель замен
Довести до добротной
FASTA
Бусыгин
DaydreamingElephant
Дополнить, довести до добротной
16.04.2020, номинировано
Молекулярная эволюция
Цветков, Григорьян
Расширить
Согласовано 22.04.2020, номинировано, проигнорированы замечания
Двугибридный анализ
Серебренникова, Морозов
Дополнить, сделать более читаемой.
Согласовано 23.04.2020, номинировано, ведется работа
Нанопоровое секвенирование
Календр, Рюмина
E.caterina Ryu, Romanbioengee
Дописать про методы анализа, довести до добротной
Согласовано 14.04.2020, номинировано
Количественный анализ альтернативного сплайсинга
Ириоглов, Черкашина
Дополнить примерами, структурировать
Согласовано 24.04.2020, номинировано
Сборка Golden Gate
Зинкевич
Arsen-z
Перевести на русский и доработать
Согласовано 20.04.2020, получен статус, статья рекомендована в хорошие.
ATAC-seq
Минина
Minina
Создание новой статьи
Согласовано 05.03.2020, получен статус
Эпигеномика
Минина
Minina
Создание новой статьи
Согласовано 05.03.2020, получен статус
Пространственная транскриптомика
Козюлина, Гурылева
Создание новой статьи
Согласовано 24.04.2020, получен статус
Биоинформатика
Попов А, Селифанова М
Привести в порядок, добавить актуальную информацию
Архив
(2019 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Статья
Участники
Ники
Что сделать
Статус
Групповой анализ дифференциальной экспрессии
Маргасюк, Посицельская
Sergey Margasyuk
получен статус
Количественный анализ экспрессии генов
Николаева
согласовано, требуются стилистические правки
Транскриптомика одиночных клеток
Исаев, Карпухина
serj.hop AnnShw
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
Секвенирование РНК
Морозова
morozova_ea
обновить
согласовано, получен статус
Визуализация данных секвенирования РНК
Волынкина, Галивонджян
InnaVolynkina
Добавить новую информацию, подробнее описать, подправить битые ссылки
согласовано, получен статус
Коррекция на множественное тестирование
Матвейшина, Котюргин
Mek1314
получен статус
ChIP-seq
Сефербекова, Теплова
zairasef, AdaTeplova
добавить новую информацию о модификациях, улучшить текст, связать с поиском пиков
согласовано, получен статус
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
секвенирование экзома
Карань, Пиунова
akartar.n,
согласовано, получен статус
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
Васильева, Шагиев
Yeessa, Cyber500
получен статус
Cytoscape
Кузнецова, Максимов
согласовано, получен статус
SAMtools
Аксенова, Панова
Maribish, Nooroka
согласовано, получен статус
Предсказание генов
Борисов, Зареченская
согласовано, получен статус
Проект «Раковый геном»
Рюмин, Чаплий
ruminkd, chaplyk
согласовано, получен статус
Энциклопедия_элементов_ДНК
AutoDock
Герасева, Преображенская
Geraseva
сделать текст более читаемым, улучшить структуру
согласовано, получен статус
Молекулярный докинг
Усманов, Положинцев
Rustamusmanov973, Temasonos
Дополнить информацией из литературы и статей
согласовано
Промотор
Литвин, Радкевич
Litvinanna, Emir.radkevich
Улучшить, добавить инструменты поиска
Согласовано, получен статус
Выравнивание последовательностей
Гавриш, Авдюнина
GGleb42WP, P.avdiunina
Расширить статью, добавить информацию
согласовано, получен статус
en:Chromosome conformation capture
Калашникова, Гладкова
AKalashnikova, Gladmarine
перевести, придумать русское название
согласовано, получен статус
(2018 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Статья
Участник[и]
Ник[и]
Групповой анализ дифференциальной экспрессии
Широковских, Байкузина
Tana_shir, P.baikuzina
Транскриптомика одиночных клеток
GenBank
Фролова, Шошинова
Froltasa, GloomyArmA
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
Коррекция на множественное тестирование
Визуализация данных секвенирования РНК
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
Модель_замен
Корзина
Askorzina
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
Секвенирование РНК
секвенирование экзома
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
Cytoscape
Теплокарта
Стариков, Ефремов
Staytunedpls, Aleks.a.efremov
Генная_онтология
Желтова, Самборская
Annetezv, margarita.samborskaya
SAMtools
Интерактом
Кашко, Кудрин
Natilika,
Предсказание генов
Проект «Раковый геном»
Энциклопедия_элементов_ДНК
FAIRE-Seq
Князева, Медведева
Naguest, Mmutilda
Секвенирование древней ДНК
Шугаева, Дианкин
Talianash, Warrdeyl
Формат файлов GFF
Сафронов, Мальков
Grigorij Saf, Ne0blako
en:N50,_L50,_and_related_statistics (перевод)
Горбачева, Ильницкий
DariaGorbacheva, ilnitsky_ivan
en:Pan-genome (перевод)
Николаева, Сигорских
Daria Nikolaeva, Andrey Sigorskikh
en:GENCODE (перевод)
Очередько, Бойко
Boiko.sash, elenaoch
en:De novo transcriptome assembly (перевод)
Макарова, Волик
makarve,
(2017 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Статья
Количество студентов на статью
Участник[и]
Ник[и]
Ensembl
2
Злобин, Маслова
alex_the_evil, Valmarfgecnf
Групповой анализ дифференциальной экспрессии
2
Мотив (молекулярная биология)
2
Молдован, Пензар
Arajmob,Dmitrypenzar1996
Транскриптомика одиночных клеток
2
Адамейко, Галкин
Delfinio, Radiation7
Метод дробовика
2
Беженцев, Сахарова
Malenkaya vrednaya polymeraza, Eka_Sa
ДНК-микрочип
2
Кузнецова, Ливенский
kuznetmaria, livenskyi
TopHat
2
Березина, Валяева
Krevetkakrevetochka, Annvalyaeva
KEGG
2
Скибина Е., Волосникова М.
ES Skibina, Marinarazdvatri
UniProt
2
Дидковская Н., Санжаева У.
Nataliyadi, USanzhaeva
Белок-белковые взаимодействия
2
Хвень, Яровенко
Irishkasuperfresh, Brokoro
AutoDock
2
Белоусов, Пушкарёва
belv, opushkareva
GenBank
2
Кузнецов, Софронова
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
2
Коррекция на множественное тестирование
2
Степаков, Менделевич
, Strausyatina
Логотип последовательностей
2
Рябых, Погорельская
alexapogorelskaya
Фармакогенетика
2
Безсуднова, Мухалева
Redgzb, Bezu
MEME
2
Хачатурян, Буянова
Zyukeriya, sonya_sofia7
Атлас ракового генома
2
Швецова, Корягина
theurgeforhappiness, liluoppi
BWA (выравнивание биологических последовательностей)
1
Prosvirov Kirill
Akado2009
STRING
1
Кононкова
A_Kononkova
Визуализация данных секвенирования РНК
1
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
1
Елена Шушкевич
ElenaShush
Модель_замен
1
Поиск пиков в данных ChiP-Seq
1
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
1
Секвенирование РНК
1
Ася Стол
smartnbeautiful
секвенирование экзома
1
Дюгай Илья
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
1
Ксения Янкина
Salatcesar
Cytoscape
1
Ковальчук Михаил
kvlml
ChIP-seq
1
Ярослав Лозинский
Lozinsky.yaroslav
Теплокарта
1
Симонова Александра
alexandrevna
Генная_онтология
1
Сегодин Виталий
MC Poh
Метод присоединения соседей
1
Тихонова Полина
tikhonovapolly
Pfam
1
Мошенский Денис
loven-doo
SAMtools
1
Холина Татьяна
rainy_TK
Анализ метаболических потоков
1
Демкив Андрей
Andrey_demkiv
Байесовский подход в филогенетике
1
Худякова Ксения
khudyakova
Интерактом
1
Богдан Кириллов
Bakirillov
Позиционная весовая матрица
1
Сингх Лавприт
Preety
Предсказание генов
1
Чайников Антон
mrgutkun
Проект «Раковый геном»
1
Теванян Элен
Элен Теванян
Энциклопедия_элементов_ДНК
1
Филиппова Екатерина
edfilippova
FAIRE-Seq
1
Миронов Алексей
Секвенирование древней ДНК
1
Кунин Михаил
Формат файлов GFF
1
Ольга Васюткина
sunnymouse
(2016 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Участник[и]
Ник[и]
Статья
Комментарий
Статус
дата окончания правки
Панкевич
Pankevich-ev
STARR-seq
перевод en:STARR-seq
согласовано
Образцова, Попов
Alcedattis
Пространственное_выравнивание
перевод en:Structural_alignment
согласовано
Гафуров, Меерсон, Носикова
FBA
Анализ_метаболических_потоков
перевод, en:Flux balance analysis
согласовано
Дудина, Елисеев, Малеева
Dudinadar, Glennerad
Секретомика
перевод, en:Secretomics
согласовано
Абдрахманов, Анисимова
SunnyBeque
Метагеномика
перевод en:Metagenomics
согласовано
Галкин Фёдор
Предсказание генов
перевод en:Gene_prediction
согласовано
Босхомджиева Баина, Андреева Анна
bainabos, lazyraccoon
Интерактом
перевод en:Interactome
согласовано
Гусев, Евстафьева, Желудкевич
zheludkevich.anna
Коррекция на множественное тестирование
доведение до статуса добротной
согласовано
Нуждина Екатерина
Alezanalp
BWA (выравнивание биологических последовательностей)
создание новой статьи, применение, алгоритмы, проблемы
список литературы согласован
Беседина Лиза, Вакуленко Юля
biobesedina, vakulenko_julia
Байесовский подход в филогенетике
Перевод en:Bayesian inference in phylogeny
согласовано
Шафиков Радик
iltarn.mos
Секвенирование ДНК одиночных клеток
создание новой статьи
согласовано
Травин Дмитрий, Трушина Наталия, Козлова Мария
TravinD, Nitrushina
Баркодирование ДНК
перевод en:DNA barcoding
согласовано
Мазитова Саша
AlMazitova
Метод дробовика
перевод en:Shotgun_sequencing
согласовано
Минькина Елена
Meatargz
Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов in silico
создание новой статьи
согласовано
Тишина Соня, Федорова Алла
sonirabi, Triasteran
Множественное_выравнивание_последовательностей
перевод en:Multiple_sequence_alignment
согласовано
Марсиаль
Mahoul
Ensembl
перевод en:Ensembl
согласовано
Сутормин Дмитрий, Новикова Мария, Ежова Маргарита
sutormin94, Vadius Marie, rita501
Вызов пиков
создание новой статьи
согласовано, нет списка литературы
Кунин Михаил
mikhail_kunin
GenBank
перевод en:GenBank
согласовано
Медведев, Мамедов
D.o.medvedev, Z_Krookie
Фармакогенетика
перевод en:Pharmacogenetics
согласовано
Котлов
avkitex
AutoDock
перевод и дополнение AutoDock
согласовано
Бикметов
Bikdm
Анализ взвешенных сетей коэкспрессии генов (WGCNA)
перевод en:Weighted correlation network analysis
Согласовано
Трофимов
Предсказание функции белка
перевод en:Protein_function_prediction
не согласовано
(2015 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Участник[и]
Ник[и]
Статья
Комментарий
Статус
дата окончания правки
Алешин
Vasily msu11
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
улучшение существующей статьи
источники согласованы
Аккуратов
eakkuratov
визуализация данных РНК-сек
зачем нужно, что рисуют, примеры программ: genome browser, IGV, tablet, sashimi plot (MISO), …
источники согласованы
Галицына, Бредихин
Rilalim raordan, kerkomen
SAMtools
и формат bam/sam. зачем нужен, как пользоваться en:SAMtools
источники согласованы
Филаретов
Dragongene
Инкубатор:Sequence logo
может стоит придумать русское название en:Sequence_logo
источники согласованы
Столярова, Бутусова
taisniqm, amadreaera
Позиционная весовая матрица
en:Position_weight_matrix
источники согласованы
Клинк
GalkaKlink
Инкубатор:Групповой анализ дифференциальной экспрессии
GOstat, gorilla, goseq и т. д. Нужно придумать русское название.
Фоменко, Чаплин
lenafomenko, Chaplin_av
Инкубатор:Pfam
Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:Pfam
источники согласованы
Девяткин
AndreiDeviatkin
методы изучения редактирования РНК
секция в Секвенирование_РНК
Ланина
No.lanina
Энциклопедия_элементов_ДНК
улучшение существующей статьи
согласован перевод
Моисеева
janemoiseeva
Функциональная аннотация геномов млекопитающих
сайт проекта
Калинина, Новаковский, Елисеева
MarinaKalinina, fransilvion, julia-eliseeva
Атлас_Ракового_Генома
en:The_Cancer_Genome_Atlas
согласован перевод
Безменова, Сафина
bsshka, noraneko
Предпочтение кодонов
en:Codon Usage Bias , нужно придумать русское название
источники согласованы
Бурская, Сигалова
GreyCrow
Модель_замен
en:Substitution_model , нужно придумать русское название
источники согласованы
Артюхов, Прохорова
eugeniaprokhorova
Проект «Раковый геном»
en:Cancer Genome Project , en:COSMIC cancer database
Климчук
Olesyaklm
Инкубатор:STRING
en:STRING
Белова, Гречникова
секвенирование экзома
en:Exome Sequencing
согласован перевод
Максудов, Нафеев, Шарафиев
pipeline
(2014 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Участник[и]
Ник[и]
Статья
Комментарий
Статус
дата окончания правки
Кэп-анализ_экспрессии_генов_(CAGE)
улучшение существующей статьи
Кулешов
Maxim Kuleshov
ДНК-микрочип
улучшение существующей статьи
Источники одобрены
10.05.2014
Дворкина, Муравьева
DashaDv, Fox.fbb.msu
ПЦР в реальном времени
улучшение существующей статьи
Источники одобрены
09.05.2014
Шадрина, Захаров
Olya_ldvgr, Matvey zaharov 25
FAIRE-Seq
Источники одобрены
09.05.2014
Зотова, Акулич
Umbrella22
ChIP-seq
en:ChIP-sequencing
Источники одобрены
09.05.2014
Антоненко, Шилин
Eka-hal-lo, I.Shilin
Секвенирование древней ДНК
неандертальцы, денисовец и т. д
Источники одобрены
09.05.2014
Осипова
Elosip
Транскриптомика одиночных клеток
методы, проблемы, достижения
15.05.2014
Брильков
brilkov
Секвенирование ДНК одиночных клеток
методы, проблемы, достижения
Шехирева, Залевский
KsushaSh,Aozalevsky
Предсказание вторичной структуры РНК
en:Nucleic_acid_structure_prediction
Источники одобрены
9.05.2014
Аюпов, Андрианов
ARustam, Esquel roche
Мотивы последовательностей (ДНК, РНК и белков)
en:Sequence_motif
Шмаков, Ситник
Arxcaeli, Zaheridor
Белок-белковые взаимодействия
en:Protein–protein_interaction
Перевод
15.05.2014
Поршнев, Шашков
ShashkovS
MEME
принципы работы en:Multiple_EM_for_Motif_Elicitation
Источники одобрены
15.05.2014
Тахавеев, Кондратьев
Vakeel
Cytoscape
зачем нужен, основные применения en:Cytoscape
Источники одобрены
10.05.2014
Балакирева
TopHat
принципы работы, зачем нужен, альтернативы [1]
Источники одобрены
8.05.2014
визуализация данных РНК-сек
зачем нужно, что рисуют, примеры программ: genome browser, IGV, tablet, sashimi plot (MISO), ...
SAMtools
и формат bam/sam. зачем нужен, как пользоваться en:SAMtools
Bioconductor
en:Bioconductor
Гаранина, Гараева
irinagaranina, alice_garaeva
Теплокарта
улучшение существующей статьи
Источники одобрены
9.05.2014
Sequence logo
может стоит придумать русское название en:Sequence_logo
Позиционная весовая матрица
Position_weight_matrix
Гущина, Лунева
Gushchina
Генная_онтология
en:Gene_ontology
Источники одобрены
9.05.2014
Gene set enrichment analysis
GOstat, gorilla, goseq и т.д. Нужно придумать русское название.
Кузькина
karatuk
nj-tree
Нужно придумать русское название. Метод_присоединения_соседей
Перевод английской вики. Согласовано.
12.05.2014
Котляров
Nikmort
Коррекция на множественное тестирование
en:Multiple_comparisons_problem
Мансурходжаев, Васетенков
Tim
KEGG
Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:KEGG
Источники одобрены
11.05.2014
Абдуллаев, Абашкин
, Dmitro_Fbb
Pfam
Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:Pfam
Источники одобрены
Сернова
wild_cat_NVS
UniProt
Описание БД: история, что есть, как пользоваться. en:UniProt
Источники одобрены
08.05.2014
Шарапова, Андреянова
Yana,ekaandreyanova
Формат файлов GFF
en:General_feature_format
Источники одобрены
09.05.2014
Иванова, Цепкова
Della FeniX,
Секвенирование_РНК
улучшение существующей статьи
09.05.2014
методы изучения редактирования РНК
секция в Секвенирование_РНК
Энциклопедия_элементов_ДНК
улучшение существующей статьи
(2013 год) Статьи, над которым работали участники проекта
Участник[и]
Статья
Комментарий
Статус
Александров, Аюпов
Methyl Array
www.illumina.com
Источники одобрены
Вербицкая
Бисульфитное секвенирование
Русская статья сильно меньше английской
Перевод с английского
Анисенко, Золотарев, Галиева
Открытый хроматин
необходимо активное взаимодействие с участниками, пишущими про DNase и FAIRE
Источники одобрены
Братцева, Ибрагимов
DNase-seq
DNase I hypersensitive sites sequencing
Источники одобрены
Изотова
FAIRE-Seq
Гуляева, Козлова
Иммунопреципитация
В списке изначально был RIP-[seq, chip, etc], однако это при отсутствии статьи по иммунопреципитации это как-то преждевременно
Источники одобрены
Ярахмедов, Иванов
Профилирование РНК
Статья должна описывать основные типы анализа клеточной РНК сгруппированные по ее (РНК) типу: по биологическому типу: polyA/not-polyA, short, microRNA, non-coding RNA, etc.; по локализации: цитоплазма, ядро, ядрышко и т.д. - см варианты в ENCODE.
Джумашев, Коннова
Кэп-анализ экспрессии генов
Cap analysis gene expression
Источники одобрены
Калинина
ДНК-микрочип
Существующая статья совсем маленькая
Источники одобрены
Карпов, Евсютина
Секвенирование спаренных концов
Необоходимо написать общую статью про PET и добавить разделы или отдельные статьи про RNA-PET (Карпов) и про DNA-PET (Евсютина)
Источники одобрены
Карпова
Секвенирование РНК
RNA-seq
Источники одобрены
Дзама, Маллохассани
Альтернативный сплайсинг
Существующая статья совсем маленькая.
Источники одобрены
Кирюхина
ChIP-seq
необходимо взаимодействие с авторами статьи про иммунопреципитацию
Лопатина
Определение конформации хромосом
en:Chromosome conformation capture
Источники одобрены
Максимычев
ChIA-PET
en:ChIA-PET
Источники одобрены
Журавлева, Нафеев
Позиционирование нуклеосом
Источники одобрены
Золотарева, Рябичко
Протеомика
Должны быть описаны основные варианты масс-спек анализа протеомов.
Источники одобрены
Караваева, Тухбатова
Профилирование репликации
Repli-chip, Repli-seq
Источники одобрены
Кузнецов
Двугибридный анализ
Источники одобрены
Маслова, Миссарова
Методы секвенирования нового поколения Высокоэффективное секвенирование
Небольшая статья про просто секвенирование уже есть. Следует либо дополнить ее, либо написать новую. В последнем случае надо не забыть добавить ссылку на статью про секвенирование. Необходимо взаимодействие с участниками, пишущими про отдельные методы
Источники одобрены
Медведева, (Ширшиков отказался)
Illumina/Solexa_method
Существует статья про компанию, нужна про принцип метода.
Мигур, Пятницкий
SOLiD
Источники одобрены
Мукосей, Лапшин
Helicos Biosciences
Источники одобрены
Никулина
Polony sequencing
Источники одобрены
Потанин
Ion semiconductor sequencing
Источники одобрены
Нарайкина, Шелякин
Одномолекулярное секвенирование в реальном времени
Источники одобрены
Борисевич
Нанопоровое секвенирование
Источники одобрены
Попков, Сапунов
Картирование коротких ридов
надо подумать над названием
Источники одобрены
Свистунова, Солдатов
Инкубатор:Количественный анализ экспрессии генов
Источники одобрены
Синицын, Ступников
Количественный анализ альтернативного сплайсинга
Источники одобрены
Сливко-Кольчик, Танас
differential (two samples) analysis of gene expression and alternative splicing
надо написать разделы в Количественный анализ экспрессии генов и Количественный анализ альтернативного сплайсинга . Рекомендуется объединить усилия с участниками, пишущими про time series.
Источники одобрены
Червонцева, Тетерина
time series analysis of gene expression and alternative splicing
Дописать необходимые разделы в Количественный анализ экспрессии генов и Количественный анализ альтернативного сплайсинга . Необходимо обратить внимания на все сложные модели (кроме попарных сравнений) а не только на временные зависимости. Рекомендуется объединить усилия с участниками, пишущими про парные сравнения.
Источники одобрены
Чернецова, Труханов
Однонуклеотидный полиморфизм
дописать саму статью и добавить методы поиска
Источники одобрены
Шерстюк, Чуклина, Мухина
Полногеномный поиск ассоциаций
Так как на русском статьи про GWAS нет, то стоит начать с нее, а "SNP imputation" сделать разделом или отдельной страницей - в зависимости от объема.
Источники одобрены
Давтян
Предлагается примкнуть к группе пишущей про GWAS
Балычев
Выравнивание последовательностей
en:Sequence alignment
Перевод с английского