Команда была основана в 1990 году первым президентом ЦСКАВиктором Мурашко[2], как филиал ФК ЦСКА[3], но из-за нехватки средств клуб просуществовал недолго. В 1991 году команда ЦСКА провела первые международные матчи с командами «Монако» (2:1), «Людвигсбург» (4:1) и «Акрополис» (3:1)[2]. На высшем уровне в чемпионате России играл в 1992—1993 годах. Высшее достижение — девятое место в 1993 году.
Вторая попытка создания ЦСКА была в 2014 году[4]. Команда взяла старт в первой лиге и заняла 7-е место среди восьми участников зоны «Запад».
В 2015 году, после распада «Зоркого», на вакантное место в высшем дивизионе стала претендовать «Россиянка», решившая заявить в элиту команду, составленную из игроков дублирующего состава и «УОР-Россиянки». Так как две «Россиянки» в одном дивизионе руководство чемпионата не допустило, клуб подал заявку как ЦСКА[5]. В 2016 году женский футбольный клуб ЦСКА был восстановлен. Первый матч возрождённая команда провела 29 апреля 2016 года против «Чертаново» (1:1)[6].
13 июля 2017 года женская команда ЦСКА вошла в структуру ПФК ЦСКА[7]. 24 сентября того же года на стадионе «Электрон» в Великом Новгороде ЦСКА с минимальным счётом обыграл «Чертаново» в финальном матче Кубка России и завоевал первый трофей в своей истории[8]. 16 марта 2018 года команда провела первый международный матч с белорусским клубом «Минск» (1:2)[9][10].
Дмитрий Саблин—70%[1]
Максим Зиновьев — главный тренер
Кулистан Боташева
«Флора»en
Санкт-Пёльтен
