Молодёжную карьеру Манолас всю провёл в столичном АЕК. В нём же он и провёл всю свою профессиональную карьеру. 3 февраля 1978 года Стелиос дебютировал в матче против Кастории (1-1) и стал опорой в обороне «АЕК» до выхода на пенсию. Последний матч был против «Ксанти». Он был капитаном АЕК в течение 19 лет. Манолас был в списке интересов у португальского «Порту» и французского «Монако», он сказал: «Я никогда не покину клуб, потому что я люблю его, и я хочу провести тут всю свою карьеру»[3]. Считается лучшим защитником в истории АЕКа[4].
Греция
