Действие фильма происходит между первой и второй частью. Санта-Клаус по вине «Мадагаскарской» компании, принявшей его за Красного Ночного гоблина, терпит аварию и попадает на Мадагаскар, в результате потеряв память. Алекс, Марти, Мелман, Глория, Шкипер, Ковальски, Рядовой и Рико берут на себя доставку подарков детям. Взяв в качестве оленей команду пингвинов, ребята доставляют все подарки и затем летят обратно на остров, предпочтя спасти праздник вместо возвращения домой. Снова попав в Санту, они возвращают ему память, и оказывается, что они доставили не все подарки. Санта улетает их доставлять, заодно убрав Джулиана из списка плохих. Затем Джулиан бьёт Алекса кокосом по голове, в результате чего тот сам теряет память.
