Бактериородопсин
| Бактериородопсин | |
|---|---|
 Bacteriorhodopsin trimer | |
| Идентификаторы | |
| Символ | Bac_rhodopsin |
| Pfam | PF01036 |
| InterPro | IPR001425 |
| PROSITE | PDOC00291 |
| SCOP | 2brd |
| SUPERFAMILY | 2brd |
| TCDB | 3.E.1 |
| OPM superfamily | 6 |
| OPM protein | 1vgo |
| Доступные структуры белков | |
| Pfam | структуры |
| PDB | RCSB PDB; PDBe; PDBj |
| PDBsum | 3D-модель |
 Медиафайлы на Викискладе | |
Бактериородопсин - светочувствительный белок, подобный зрительному родопсину человеческого глаза, встречающийся в бактериях (например, в галобактериях). Отностся к мембранным белкам, основная функциях которого провести протон через мембрану.
Состав белка
Трансмембранная часть бактериородопсина сложена из 7 регулярных -спиралей, идущих от одного до другого края мембраны, а одинокая -шпилька и все нерегулярные участки цепи (соединяющие спирали-петли) выходят из мембраны. Сидящие на -спиралях гидрофобные группы обращенны “наружу” к липидам (тоже гидрофобным) мембраны. Полярные же группы (их немного) обращены внутрь очень узкого канала, по которому идет протон.
Процесс переноса протона через мембрану
Протонная проводимость осуществляется при содействии прикрепленной внутри пучка спиралей молекулы кофактора – ретиналя. Он перекрывает центральный канал бактериородопсина. Поглотив фотон, ретиналь переходит из trans- в cis- форму. При этом он изгибается и переносит протон с одного конца семиспирального пучка на другой. А потом ретиналь разгибается и возвращается назад, но уже без протона.
Литература
- А.В. Финкельштейн, О.Б. Птицын, "Физика белка", 2002