ImageJ

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Это старая версия этой страницы, сохранённая 195.91.215.161 (обсуждение) в 08:11, 27 июня 2014 (→Особенности: Исправлена опечатка в слове). Она может серьёзно отличаться от текущей версии.
Перейти к навигации Перейти к поиску
ImageJ
Логотип программы ImageJ
Скриншот программы ImageJ
Скриншот ImageJ
Тип Image processing
Разработчик Wayne Rasband (NIH)
Написана на Java[1]
Операционная система Any (Java-based)
Аппаратная платформа Java Virtual Machine
Последняя версия 1.48d (28 сентября 2013) (28 сентября 2013)
Репозиторий github.com/imagej/ImageJ
Лицензия Public Domain
Сайт rsb.info.nih.gov/ij/
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе

ImageJ — это программа с открытым исходным кодом для анализа и обработки изображений. Написана на языке Java сотрудниками National Institutes of Health[2] и распространяется без лицензионных ограничений как общественное достояние. Открытый API позволяет гибко наращивать функционал за счёт подключаемых плагинов, а встроенный макроязык — автоматизировать сложные повторяющиеся действия[3]. ImageJ широко применяется в биомедицинских исследованиях, астрономии, географии и других дисциплинах, связанных с анализом изображений, в качестве альтернативы проприетарному ПО.

Плагины сторонних разработчиков охватывают широкий круг задач анализа и обработки изображений: позволяют проводить трехмёрную визуализацию в диапазоне от клеток до рентгенологических изображений[4], автоматические сравнения[5] вплоть до создания автоматизированных систем изучения, например, в гематологии[6]. Архитектура плагинов ImageJ и встроенная в программу система разработки делает эту платформу весьма популярной для работы и преподавания анализа и обработки изображений[7][8].

ImageJ может работать как онлайн апплет, загружаемое приложение. Использование приложения возможно во всех операционных системах, для которых существует Java Virtual Machine версии 1.4 или более поздней: Microsoft Windows, Mac OS, Mac OS X, Linux и Sharp Zaurus PDA. Исходный код ImageJ также находится в свободном доступе[9].

Идеолог и разработчик проекта — Wayne Rasband (Research Services Branch of the National Institute of Mental Health).

Особенности

ImageJ позволяет отображать, редактировать, анализировать, обрабатывать, сохранять и печатать 8-битные, 16-битные и 32-битные изображения. Программа может читать многие форматы изображений, такие как TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS, а также raw форматы. ImageJ поддерживает стеки — серии изображений, которые объединены в одном окне, а многопоточные трудоемкие операции могут выполняться на многопроцессорных системах в параллельном режиме. В ImageJ можно вычислять площади, статистические показатели пиксельных значений различных выделенных областей интереса на изображениях, которые выделены вручную или при помощи пороговых функций. Программа может измерять расстояния и углы. Она может создавать гистограммы плотности и рисовать профили линий. ImageJ поддерживает стандартные функции обработки изображений, такие как логические и арифметические операции между изображениями, манипуляции с контрастностью, свертки, Фурье-анализ, повышение резкости, сглаживание, обнаружение границ и медианный фильтр. Программа позволяет производить различные геометрические преобразования, такие как масштабирование, поворот или отражение. Программа поддерживает любое количество одновременно используемых изображений, ограничение связано только с объёмом доступной памяти.

История

До начала создания ImageJ в 1997 году аналогичный анализ изображений позволяла проводить бесплатная программа, известная как NIH Image, которая была разработана для компьютеров Macintosh и работала на до-Mac OS X операционных системах. Дальнейшее развитие этого кода продолжалось в направлении использования изображений SXM, вариантах специально разработанных для физических исследований изображений сканирующих микроскопов. Также была разработана Windows версия поддерживаемая Scion Corporation. Обе версии по-прежнему доступны[10].

Примечания

  1. ↑ The image_j Open Source Project on Open Hub: Languages Page — 2006.
  2. ↑ Collins TJ (2007). "ImageJ for microscopy". BioTechniques. 43 (1 Suppl): 25—30. doi:10.2144/000112517. PMID 17936939. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month= игнорируется (справка)
  3. ↑ Girish V, Vijayalakshmi A (2004). "Affordable image analysis using NIH Image/ImageJ". Indian J Cancer. 41 (1): 47. PMID 15105580.
  4. ↑ Barboriak D, Padua A, York G, Macfall J (2005). "Creation of DICOM-aware applications using ImageJ". J Digit Imaging. 18 (2): 91—9. doi:10.1007/s10278-004-1879-4. PMID 15827831.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  5. ↑ Rajwa B, McNally H, Varadharajan P, Sturgis J, Robinson J (2004). "AFM/CLSM data visualization and comparison using an open-source toolkit". Microsc Res Tech. 64 (2): 176—84. doi:10.1002/jemt.20067. PMID 15352089.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  6. ↑ Gering E, Atkinson C (2004). "A rapid method for counting nucleated erythrocytes on stained blood smears by digital image analysis". J Parasitol. 90 (4): 879—81. doi:10.1645/GE-222R. PMID 15357090.
  7. ↑ Burger W, Burge M. Digital Image Processing: An Algorithmic Approach Using Java. — Springer, 2007. — ISBN 1846283795.
  8. ↑ Dougherty, G. Digital Image Processing for Medical Applications. — Cambridge University Press, 2009. — ISBN 9780521860857.
  9. ↑ Rueden CT, Eliceiri KW (2007). "Visualization approaches for multidimensional biological image data". BioTechniques. 43 (1 Suppl): 31, 33—6. doi:10.2144/000112511. PMID 17936940. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month= игнорируется (справка)
  10. ↑ NIH Image: About. Дата обращения: 18 ноября 2008. Архивировано 20 апреля 2012 года.

Ссылки

Дистрибутивы

Для облегчения развертывания ПО, ImageJ распространяется также в составе дистрибутивов.

  • Fiji (рекурсивный акроним от Fiji is Just ImageJ): Дистрибутив ориентирован на работу с медико-биологическими изображениями. Поставляется в бинарном виде (x86, x86_64) для основных ОС (Windows, Linux, MacOS). Содержит предустановленные плагины, средство автоматического обновления, интерфейсы для скриптовых языков (см. Scripting).
  • MBF ImageJ, разрабатываемая McMaster Biophotonics Facility. Только для Windows x86.

Подключаемые модули

Программа NIH Image

Источник — https://ru.wikipedia.org/ruwiki/w/index.php?title=ImageJ&oldid=63864348