Укладка Россмана

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Пример укладки Россмана, домен белка декарбоксилазы бактерии Шаблон:Нп0 (PDB ID 1G5Q) со связанным кофактором ФМН

Укладка РоссманнаШаблон:Нп0 в третичной структуре белка, который связывает нуклеотиды (в частности, кофактор НАД). Структура, состоящая из двух идентичных частей, содержит шесть почти параллельных β-листов, соединённых между собой двумя парами α-спиралей, следующих в порядке β–α–β–α–β. Поскольку каждая укладка Россманна может связать один нуклеотид, связывающий домен для динуклеотидов, таких как НАД, состоит из двух параллельных укладок Россманна. Одиночная укладка Россманна может связать мононуклеотид, например, кофактор ФМН.

Мотив назван по имени Шаблон:Нп0, который первым обнаружил и описал эту структуру как часто встречающуюся в нуклеотид-связывающих белках, таких, как дегидрогеназы[1].

В 1989 году Шаблон:Нп0 из Института Вейцмана обнаружил, что нуклеотидная последовательность для НАДФ-связывающих структур в некоторых белках отличается от мотивов, связывающих НАД[2]. Это открытие было использовано для реинжиниринга кофакторной избирательности ферментов[3].

Примечания

  1. Rao S, Rossmann M (1973). "Comparison of super-secondary structures in proteins". J Mol Biol. 76 (2): 241—56. doi:10.1016/0022-2836(73)90388-4. PMID 4737475.
  2. Hanukoglu I., Gutfinger T. cDNA sequence of adrenodoxin reductase. Identification of NADP-binding sites in oxidoreductases. (англ.) // European journal of biochemistry / FEBS. — 1989. — Vol. 180, no. 2. — P. 479—484. — PMID 2924777. [исправить]
  3. Scrutton NS, Berry A, Perham RN (1990). "Redesign of the coenzyme specificity of a dehydrogenase by protein engineering". Nature. 343 (6253): 38—43. doi:10.1038/343038a0. PMID 2296288. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month= игнорируется (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)