Впервые команда была основана в 1990 году, как филиал ФК ЦСКА[1], но из-за нехватки средств клуб просуществовал недолго. На высшем уровне в чемпионате России играл в 1992—1993 годах. Высшее достижение — девятое место в 1993 году.
Вторая попытка создания ЦСКА была в 2014 году[2]. Команда с таким названием взяла старт в Первой лиге и заняла 7-е место среди восьми коллективов-участников зоны «Запад».
В 2015 году, после распада «Зоркого», на вакантное место в высшем дивизионе стала претендовать «Россиянка», решившая заявить в элиту команду, составленную из игроков дублирующего состава и «УОР-Россиянки». Ну а так как две «Россиянки» в одном дивизионе стало бы перебором, клуб подал заявку как ЦСКА[источник не указан 2485 дней]. Первый матч возрождённая команда провела 29 апреля 2016 года против «Чертаново» (1:1)[3].
В чемпионате 2016 ЦСКА пришел к финишу пятым, опередив только «Кубаночку».
13 июля 2017 года женская команда ЦСКА вошла в структуру ПФК ЦСКА[4]. 24 сентября того же года на стадионе «Электрон» в Великом Новгороде ЦСКА с минимальным счётом обыграл «Чертаново» в финальном матче Кубка России и завоевал первый трофей в своей истории[5]. 16 марта 2018 года команда провела первый международный матч с белорусским клубом «Минск» (1:2)[6][7].
Татьяна Чёрная
Александр Григорян
Александр Григорян (2018—н. в.)
Ленская, 
