SYBR Green II

SYBR Green II
Общие
Хим. формула	C28H28IN3OS
Классификация
Рег. номер CAS	172827-25-7
PubChem	168432143
SMILES	[I-].O1C=2C=CC=CC2N(C1=CC=3C=C(SCCN(C)C)[N+](C=4C=CC=CC4)=C5C=CC=CC35)C
InChI	InChI=1S/C28H28N3OS.HI/c1-29(2)17-18-33-28-20-21(19-27-30(3)25-15-9-10-16-26(25)32-27)23-13-7-8-14-24(23)31(28)22-11-5-4-6-12-22;/h4-16,19-20H,17-18H2,1-3H3;1H/q+1;/p-1 KQXBZZLQWLZPAL-UHFFFAOYSA-M
Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное.

Серия двукратного разведения 16S и 23S рибосомной РНК (рРНК) Escherichia coli, подвергнутая электрофорезу на неденатурирующем 1 % агарозном геле, а затем окрашенная гелем для окрашивания РНК SYBR Green II

SYBR Green II — это чувствительный гелевый РНК-краситель на основе нуклеиновых кислот, который обладает яркой флуоресценцией при связывании с РНК и низким фоном в гелях. Используется с формальдегидно-агарозными или полиакриламидными гелями с использованием лазерных сканеров или стандартных УФ-трансиллюминаторов.

Свойства

SYBR Green II — это высокочувствительный краситель для постэлектрофорезного окрашивания РНК и ssDNA в агарозных или полиакриламидных гелях. SYBR Green II не является селективным для окрашивания РНК, но демонстрирует более высокий квантовый выход при связывании с РНК (~0,54), чем с двухцепочечной ДНК (~0,36). Квантовый выход флуоресценции комплекса РНК/SYBR Green II более чем в семь раз превышает выход комплекса РНК/бромид этидия (~0.07).

SYBR Green II максимально возбуждается при 497 нм, но также имеет вторичный пик возбуждения с центром около 254 нм. Флуоресцентное излучение окрашенного SYBR Green II РНК центрирована на длине волны 520 нм. SYBR Green II может использоваться с общедоступными источниками возбуждения ультрафиолетовых эпи- и трансиллюминаторов, а также ручными ультрафиолетовыми лампами.

Предел обнаружения составляет 500 пикограмм РНК на полосу в неденатурирующих гелях с просвечиванием 300 нм (до 100 пг при эпи-освещении 254 нм).

Похожие цианиновые красители

• SYBR Green
• PicoGreen (PG)
• SYBR Safe^?!
• SYBR Gold^?!
• Thiazole orange (TO)
• Oxazole yellow (YO)
• Safe-Green
• Chai Green

Литература

SYBR Green II RNA gel stain (S9305) - Datasheet

Instructions for using SYBR® Green II Nucleic Acid Gel Stain