反转录转座子:修订间差异
外观
删除的内容 添加的内容
小 取消Wenlongtian (对话)的编辑;更改回PhiLiP的最后一个版本 |
Easterlies(留言 | 贡献) →參考: 增加或调整分类 |
||
(未显示26个用户的48个中间版本) | |||
第1行: | 第1行: | ||
[[File:Retrotransposons.png|thumb|right|440px|反转录转座子(左下)生命周期的简化表示]] |
|||
{{Copyvio| |
|||
url=*http://www.foodmate.net/topic/171/12/50149.html| |
|||
'''反转录转座子'''(Retrotransposon),又譯'''逆轉錄轉位子'''<ref>{{Cite web|url=https://terms.naer.edu.tw/detail/889c9d61657934121ae9ccb52c197dd1/?startswith=zh|title=反轉錄轉位子;逆轉錄轉位子 retrotransposon|website=樂詞網|access-date=2023-02-23|archive-date=2023-02-23|archive-url=https://web.archive.org/web/20230223185825/https://terms.naer.edu.tw/detail/889c9d61657934121ae9ccb52c197dd1/?startswith=zh|dead-url=no}}</ref>,是由RNA介导转座的[[转座子]]的元件,在结构和复制上与[[反转录病毒]](retrovirus)类似,只是没有病毒感染必需的[[env基因]]。它通过转录合成mRNA,再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座,每转座1次拷贝数就会增加1份,可以增強自己的基因組。因此,它是許多[[真核生物]]中数量最大的一类可活动遗传成分。在植物中特别丰富,它们是核DNA的一个主要组成部分。在[[玉米]]的基因组49-78%是反转录转座子<ref name=SanMiguelandBennetzen>{{cite journal |author=SanMiguel P, Bennetzen JL |title=Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons |journal=Annals of Botany |volume=82 |issue=Suppl A |pages=37–44 |year=1998 |url=http://aob.oxfordjournals.org/cgi/reprint/82/suppl_1/37.pdf |access-date=2009-07-06 |archive-date=2009-09-29 |archive-url=https://web.archive.org/web/20090929072729/http://aob.oxfordjournals.org/cgi/reprint/82/suppl_1/37.pdf |dead-url=no }}</ref>,而在小麦中包含约90%的基因组重复序列和68%的转座子<ref name=LiandGill>{{cite journal |author=Li W, Zhang P, Fellers JP, Friebe B, Gill BS |title=Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome |journal=Plant J. |volume=40 |issue=4 |pages=500–11 |pmid=15500466 |doi=10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x |url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x |date=November 2004 |access-date=2022-10-21 |archive-date=2022-10-21 |archive-url=https://web.archive.org/web/20221021070615/https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x |dead-url=no }}</ref>。在哺乳动物中,几乎有一半的基因组(45%至48%)包含转座子或残余转座子。人类基因组有大约42%反转录转座子,而DNA[[转座子]]约占2-3%<ref name=Landeretal>{{cite journal |author=Lander ES, Linton LM, Birren B, ''et al.'' |title=Initial sequencing and analysis of the human genome |journal=Nature |volume=409 |issue=6822 |pages=860–921 |pmid=11237011 |doi=10.1038/35057062 |url=http://www.nature.com/nature/journal/v409/n6822/full/409860a0.html |date=February 2001 |access-date=2009-07-06 |archive-date=2009-08-03 |archive-url=https://web.archive.org/web/20090803024952/http://www.nature.com/nature/journal/v409/n6822/full/409860a0.html |dead-url=no }}</ref>。 |
|||
m=6 |
|||
}}[[User:江湖大虾仁|<span style="color: #007FFF;">'''蝦米'''</span>]]※[[User talk:江湖大虾仁|飛鴿傳書]] 2009年6月24日 (三) 03:06 (UTC)<div id="copyvio" style="display:none;"><!-- 本模板調用由 {{subst:Copyvio/auto|url=*http://www.foodmate.net/topic/171/12/50149.html}} 自动产生。--> |
|||
反轉錄轉座子與反座子 (retroposon) 較為相似,然而兩者的主要區別為反轉錄轉座子具有反轉錄酶,而反座子沒有。 |
|||
== 反转录转座子的两大类 == |
|||
反转录转座子可以分成两大类: |
|||
* 一类是LTR反转录转座子,包括Tyl-copia类和Ty3-gypsy类转座子,是具有[[长末端重复序列]](long terminal repeats,LTR)的转座子,这也是[[反转录病毒]]基因组的特征性结构,这类反转录转座子可以编码反转录酶(Reverse transcriptases)或整合酶(integrases),自主地进行转录,其转座机制同反转录病毒相似,但不能像反转录病毒那样以自由感染的方式进行传播,高等植物中的反转录转座子主要属于Tyl-copia类,分布十分广泛,几乎覆盖了所有高等植物种类。 |
|||
* 另一类是非LTR反转录转座子,包括LINE(long interspersed nuclear elements,长散布核元件)类、SINE(Short interspersed nuclear elements,短散布核元件)类、复合SINE转座子类,没有长末端重复序列(non-long terminal repeats,non-LTR),自身也没有转座酶或整合酶的编码能力,需要在细胞内已有的酶系统作用下进行转座。 |
|||
所有反转录转座子都有一个共同特点,就是在其插入位点上产生短的正向重复序列。 |
|||
== 参见 == |
|||
* [[转座子]] |
|||
* [[转录]] |
|||
* [[分子生物学的中心法则]] |
|||
== 參考 == |
|||
{{Reflist|2}} |
|||
{{重复序列}} |
|||
[[Category:可动遗传因子]] |
|||
[[Category:分子生物学]] |
|||
[[Category:非编码DNA]] |
2024年9月13日 (五) 06:55的最新版本
反转录转座子(Retrotransposon),又譯逆轉錄轉位子[1],是由RNA介导转座的转座子的元件,在结构和复制上与反转录病毒(retrovirus)类似,只是没有病毒感染必需的env基因。它通过转录合成mRNA,再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座,每转座1次拷贝数就会增加1份,可以增強自己的基因組。因此,它是許多真核生物中数量最大的一类可活动遗传成分。在植物中特别丰富,它们是核DNA的一个主要组成部分。在玉米的基因组49-78%是反转录转座子[2],而在小麦中包含约90%的基因组重复序列和68%的转座子[3]。在哺乳动物中,几乎有一半的基因组(45%至48%)包含转座子或残余转座子。人类基因组有大约42%反转录转座子,而DNA转座子约占2-3%[4]。
反轉錄轉座子與反座子 (retroposon) 較為相似,然而兩者的主要區別為反轉錄轉座子具有反轉錄酶,而反座子沒有。
反转录转座子的两大类
[编辑]反转录转座子可以分成两大类:
- 一类是LTR反转录转座子,包括Tyl-copia类和Ty3-gypsy类转座子,是具有长末端重复序列(long terminal repeats,LTR)的转座子,这也是反转录病毒基因组的特征性结构,这类反转录转座子可以编码反转录酶(Reverse transcriptases)或整合酶(integrases),自主地进行转录,其转座机制同反转录病毒相似,但不能像反转录病毒那样以自由感染的方式进行传播,高等植物中的反转录转座子主要属于Tyl-copia类,分布十分广泛,几乎覆盖了所有高等植物种类。
- 另一类是非LTR反转录转座子,包括LINE(long interspersed nuclear elements,长散布核元件)类、SINE(Short interspersed nuclear elements,短散布核元件)类、复合SINE转座子类,没有长末端重复序列(non-long terminal repeats,non-LTR),自身也没有转座酶或整合酶的编码能力,需要在细胞内已有的酶系统作用下进行转座。
所有反转录转座子都有一个共同特点,就是在其插入位点上产生短的正向重复序列。
参见
[编辑]參考
[编辑]- ^ 反轉錄轉位子;逆轉錄轉位子 retrotransposon. 樂詞網. [2023-02-23]. (原始内容存档于2023-02-23).
- ^ SanMiguel P, Bennetzen JL. Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons (PDF). Annals of Botany. 1998, 82 (Suppl A): 37–44 [2009-07-06]. (原始内容存档 (PDF)于2009-09-29).
- ^ Li W, Zhang P, Fellers JP, Friebe B, Gill BS. Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome. Plant J. November 2004, 40 (4): 500–11 [2022-10-21]. PMID 15500466. doi:10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x. (原始内容存档于2022-10-21).
- ^ Lander ES, Linton LM, Birren B; et al. Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature. February 2001, 409 (6822): 860–921 [2009-07-06]. PMID 11237011. doi:10.1038/35057062. (原始内容存档于2009-08-03).