反转录转座子：修订间差异

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2019年1月5日 (六) 18:01的版本

反转录转座子（retrotransposon）又稱“反座子”（retroposon）。 反转录转座子是由RNA介导转座的转座子的元件，在结构和复制上与反转录病毒（retrovirus）类似，只是没有病毒感染必需的env基因，它通过转录合成mRNA，再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座，每转座1次拷贝数就会增加1份，可以增強自己的基因組。因此，它是許多真核生物中数量最大的一类可活动遗传成分。在植物中特别丰富，它们是核DNA的一个主要组成部分。在玉米的基因组49-78％是反转录转座子^[1]，而在小麦中包含约90％的基因组重复序列和68％的转座子^[2]。在哺乳动物中，几乎有一半的基因组（45％至48％）包含转座子或残余转座子。人类基因组有大约42％反转录转座子，而DNA转座子约占2-3％^[3]。

反转录转座子的两大类

反转录转座子可以分成两大类：

一类是LTR反转录转座子，包括Tyl-copia类和Ty3-gypsy类转座子，是具有长末端重复序列(long terminal repeats，LTR)的转座子，这也是反转录病毒基因组的特征性结构，这类反转录转座子可以编码反转录酶(Reverse transcriptases)或整合酶(integrases)，自主地进行转录，其转座机制同反转录病毒相似，但不能像反转录病毒那样以自由感染的方式进行传播，高等植物中的反转录转座子主要属于Tyl-copia类，分布十分广泛，几乎覆盖了所有高等植物种类。
另一类是非LTR反转录转座子，包括LINE(long interspersed nuclear elements，长散布核元件)类、SINE(Short interspersed nuclear elements，短散布核元件)类、复合SINE转座子类，没有长末端重复序列(non-long terminal repeats，non-LTR)，自身也没有转座酶或整合酶的编码能力，需要在细胞内已有的酶系统作用下进行转座。

所有反转录转座子都有一个共同特点，就是在其插入位点上产生短的正向重复序列。

参见

參考

^ SanMiguel P, Bennetzen JL. Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons (PDF). Annals of Botany. 1998, 82 (Suppl A): 37–44.
^ Li W, Zhang P, Fellers JP, Friebe B, Gill BS. Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome. Plant J. November 2004, 40 (4): 500–11. PMID 15500466. doi:10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x.
^ Lander ES, Linton LM, Birren B; et al. Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature. February 2001, 409 (6822): 860–921. PMID 11237011. doi:10.1038/35057062.
^ 关于病毒可能帮助人类进化的问题. [2009-07-06].

[SanMiguelandBennetzen-1] SanMiguel P, Bennetzen JL. Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons (PDF). Annals of Botany. 1998, 82 (Suppl A): 37–44.

[LiandGill-2] Li W, Zhang P, Fellers JP, Friebe B, Gill BS. Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome. Plant J. November 2004, 40 (4): 500–11. PMID 15500466. doi:10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x.

[Landeretal-3] Lander ES, Linton LM, Birren B; et al. Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature. February 2001, 409 (6822): 860–921. PMID 11237011. doi:10.1038/35057062.

[4] 关于病毒可能帮助人类进化的问题. [2009-07-06].

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 [[File:Retrotransposons.png|thumb|right|440px|反转录转座子（左下）生命周期的简化表示]]
-'''反转录转座子'''（retrotransposon）与“'''反座子'''”（retroposon）不同，反转录转座子具有[[逆转录酶]](RT), 而反座子没有。 是由RNA介导转座的[[转座子]]的元件，在结构和复制上与[[反转录病毒]]（retrovirus）类似，只是没有病毒感染必需的[[env基因]]，它通过转录合成mRNA，再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座，每转座1次拷贝数就会增加1份，可以增強自己的基因組。因此，它是許多[[真核生物]]中数量最大的一类可活动遗传成分。在植物中特别丰富，它们是核DNA的一个主要组成部分。在[[玉米]]的基因组49-78％是反转录转座子<ref name=SanMiguelandBennetzen>{{cite journal |author=SanMiguel P, Bennetzen JL |title=Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons |journal=Annals of Botany |volume=82 |issue=Suppl A |pages=37–44 |year=1998 |url=http://aob.oxfordjournals.org/cgi/reprint/82/suppl_1/37.pdf}}</ref>，而在小麦中包含约90％的基因组重复序列和68％的转座子<ref name=LiandGill>{{cite journal |author=Li W, Zhang P, Fellers JP, Friebe B, Gill BS |title=Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome |journal=Plant J. |volume=40 |issue=4 |pages=500–11 |pmid=15500466 |doi=10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x |url=http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x|date=November 2004}}</ref>。在哺乳动物中，几乎有一半的基因组（45％至48％）包含转座子或残余转座子。人类基因组有大约42％反转录转座子，而DNA[[转座子]]约占2-3％<ref name=Landeretal>{{cite journal |author=Lander ES, Linton LM, Birren B, ''et al.'' |title=Initial sequencing and analysis of the human genome |journal=Nature |volume=409 |issue=6822 |pages=860–921 |pmid=11237011 |doi=10.1038/35057062 |url=http://www.nature.com/nature/journal/v409/n6822/full/409860a0.html|date=February 2001}}</ref>。
+'''反转录转座子'''（retrotransposon）又稱“'''反座子'''”（retroposon）。 '''反转录转座子'''是由RNA介导转座的[[转座子]]的元件，在结构和复制上与[[反转录病毒]]（retrovirus）类似，只是没有病毒感染必需的[[env基因]]，它通过转录合成mRNA，再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座，每转座1次拷贝数就会增加1份，可以增強自己的基因組。因此，它是許多[[真核生物]]中数量最大的一类可活动遗传成分。在植物中特别丰富，它们是核DNA的一个主要组成部分。在[[玉米]]的基因组49-78％是反转录转座子<ref name=SanMiguelandBennetzen>{{cite journal |author=SanMiguel P, Bennetzen JL |title=Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons |journal=Annals of Botany |volume=82 |issue=Suppl A |pages=37–44 |year=1998 |url=http://aob.oxfordjournals.org/cgi/reprint/82/suppl_1/37.pdf}}</ref>，而在小麦中包含约90％的基因组重复序列和68％的转座子<ref name=LiandGill>{{cite journal |author=Li W, Zhang P, Fellers JP, Friebe B, Gill BS |title=Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome |journal=Plant J. |volume=40 |issue=4 |pages=500–11 |pmid=15500466 |doi=10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x |url=http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x|date=November 2004}}</ref>。在哺乳动物中，几乎有一半的基因组（45％至48％）包含转座子或残余转座子。人类基因组有大约42％反转录转座子，而DNA[[转座子]]约占2-3％<ref name=Landeretal>{{cite journal |author=Lander ES, Linton LM, Birren B, ''et al.'' |title=Initial sequencing and analysis of the human genome |journal=Nature |volume=409 |issue=6822 |pages=860–921 |pmid=11237011 |doi=10.1038/35057062 |url=http://www.nature.com/nature/journal/v409/n6822/full/409860a0.html|date=February 2001}}</ref>。
 == 反转录转座子的两大类 ==