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消毒是利用化學品或其他方法消滅大部份微生物，使常見的致病細菌數目減少到安全的水平。然而，與殺菌相比，部份細菌苞子、過濾性病毒、肺結核菌及真菌等都有機會未能消滅。
消毒通常用於日常生活所接觸的事物，如地板、餐具，在醫療上則只可用於一些體外的工具（如探熱針）。
消毒的方式一般可使用酒精、甲醛、氨水、漂白水、碘液甚至是沸水浸洗，也有使用紫外光進行消毒的。
