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Saccharimonadia

De Wikipedia, la enciclopedia libre
Saccharimonadia
Taxonomía
Dominio: Bacteria
Filo: Patescibacteria
Clase: Saccharimonadia
Albertsen et al. 2013
Orden

Saccharimonadia o Saccharibacteria es una clase candidata de bacterias[1][2]​ recientemente propuesta, previamente conocida como TM7, perteneciente al filo Patescibacteria. Mediante el estudio de muestras ambientales de ARNm se ha encontrado que los miembros de esta clase se encuentran ampliamente distribuidos por el medio ambiente. Así, se los ha encontrado en suelos, sedimentos, aguas residuales y animales. Además aparecen en muestras recogidas en hospitales.[3]​ También se ha encontrado sobre la superficie de la bacteria Actinomyces como parásito episimbionte en una muestra oral humana.[4]​ Las diversas especies tienen forma de filamentos finos o gruesos, cocos o bacilos.

Los estudios genéticos indican que Saccharibacteria es un grupo filogenéticamente diverso y que juega un papel importante en la degradación de diversos compuestos orgánicos en condiciones aerobias, reductoras de nitratos y anaerobias. El nombre dado a la clase hace referencia a su capacidad de degradación de los azúcares.[5]​ Esta clase forma parte de Patescibacteria o grupo CPR una extensa línea filogenética de bacterias recientemente descubierta.[6][7]

Probable patogenicidad

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Saccharibacteria es probablemente la única o la más importante bacteria ultrapequeña del microbioma humano. Miembros de este filo se han relacionado con enfermedad periodontal, dermatitis, fibrosis quística, vaginosis y enfermedad inflamatoria intestinal. Esta bacteria se ha obtenido mediante cocultivo conjuntamente con su huésped actinobacteriano, mostrando que Saccharibacteria podría modular la respuesta inmune.[8]

Referencias

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  1. Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, David W. Waite, Christian Rinke, Adam Skarshewski, Pierre-Alain Chaumeil, Philip Hugenholtz (2018). A proposal for a standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny. Biorxiv.
  2. Genome database. Patescibacteria.
  3. Ferrari, B., Winsley, T., Ji, M., & Neilan, B. (2014). Insights into the distribution and abundance of the ubiquitous Candidatus Saccharibacteria phylum following tag pyrosequencing. Scientific reports, 4, 3957.
  4. Xuesong He et al. 2014, Cultivation of a human-associated TM7 phylotype reveals a reduced genome and epibiotic parasitic lifestyle PNAS January 6, 2015 112 (1) 244-249; https://doi.org/10.1073/pnas.1419038112
  5. Kindaichi, T., Yamaoka, S., Uehara, R., Ozaki, N., Ohashi, A., Albertsen, M., ... & Nielsen, J. L. (2016). Phylogenetic diversity and ecophysiology of Candidate phylum Saccharibacteria in activated sludge. FEMS microbiology ecology, 92(6), fiw078.
  6. Hug, L. A., Baker, B. J., Anantharaman, K., Brown, C. T., Probst, A. J., Castelle, C. J., ... & Suzuki, Y. (2016). A new view of the tree of life. Nature Microbiology, 1, 16048.
  7. Brown, C. T., Hug, L. A., Thomas, B. C., Sharon, I., Castelle, C. J., Singh, A., ... & Banfield, J. F. (2015). Unusual biology across a group comprising more than 15% of domain Bacteria. Nature, 523(7559), 208-211.
  8. Cindy J. Castelle & Jillian F. Banfield 2018, Major New Microbial Groups Expand Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life. Perspective, Vol. 172, Issue 6, P1181-1197, 2018, DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.02.016