保守性替换
外观
保守性替换(英语:Conservative Replacement或Conservative Substitution),或称保守性突变(英语:conservative mutation、保留性突变、保存性突变、保守突变、保守替换等,是指性状相近的氨基酸分子之间的替换,其中的性状包含分子的离子性、疏水性和分子量等。[2][3]与之相对的,激进替换(英语:Radical Replacement 或Radical Substitution)则是指物理化学性质非常不同的氨基酸所产生的相互替换。[2]
天然编组基因的氨基酸仅有20种,其中部分氨基酸彼此性状相似。例如,亮氨酸和异亮氨酸均为脂肪族化合物,极具疏水性;天冬氨酸和谷氨酸均小而带负电等。氨基酸的保守性替换比起非保守性替换影响一般较小,这一点在自然界中可以观测到:非保守性替换往往造成各种异常,更容易被自然选择淘汰,故而在自然界中保守性突变更为常见。根据R基团的性质,氨基酸往往依照下表方式分类:
类型 | 氨基酸 |
---|---|
脂肪族 | 甘氨酸, 丙氨酸, 缬氨酸, 亮氨酸, 异亮氨酸 |
水合或含硫/硒 | 丝氨酸, 半胱氨酸, 硒半胱氨酸, 苏氨酸, 甲硫氨酸 |
环状 | 脯氨酸 |
芳香族 | 苯丙氨酸, 酪氨酸, 色氨酸 |
碱性 | 组氨酸, 离胺酸, 精氨酸 |
酸性及酰胺类 | 天冬氨酸, 谷氨酸, 天冬酰胺, 谷氨酰胺 |
参见
[编辑]参考资料
[编辑]- ^ Clustal FAQ #Symbols. Clustal. [8 December 2014]. (原始内容存档于2016-10-24).
- ^ 2.0 2.1 Zhang, Jianzhi. Rates of Conservative and Radical Nonsynonymous Nucleotide Substitutions in Mammalian Nuclear Genes. Journal of Molecular Evolution. 2000-01-01, 50 (1): 56–68 [2019-01-06]. ISSN 0022-2844. doi:10.1007/s002399910007. (原始内容存档于2018-09-06) (英语).
- ^ Dagan, Tal; Talmor, Yael; Graur, Dan. Ratios of Radical to Conservative Amino Acid Replacement are Affected by Mutational and Compositional Factors and May Not Be Indicative of Positive Darwinian Selection. Molecular Biology and Evolution. 2002-07-01, 19 (7): 1022–1025 [2019-01-06]. ISSN 0737-4038. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a004161. (原始内容存档于2018-09-06) (英语).
外部链接
[编辑]- Graur, Dan. Radical and Conservative Amino-Acid Replacements. Judge Starling. 3 August 2015 [2018-03-11]. (原始内容存档于2018-12-13).