云南省政府是中华民国南京国民政府在云南省的最高地方行政机关。
民国17年,国民政府统一中国后,设置云南省政府治理云南。
民国24年(1935年)分昆明县置昆明市,云南省省会改置于此。
民国38年(1949年)12月9日,时任云南省主席卢汉宣布投共。
民国39年(1950年)以后,不支持卢汉投共的人员将云南省政府由昆明迁至泰国曼谷,直至民国43年(1954年)云南省政府裁撤。