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使用者討論:靖天子/存檔9

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Merry Christmas!!!

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冠狀病毒模板與RaTG13

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I have just finished translating template {{Coronavirus}} from Chinese to English.

I like this template, compared with "Human coronaviruses", which I just REDIRECT to "Coronaviridae", Its a DeAnthropocentrism template.--Htmlzycq（留言） 2020年12月24日 (四) 16:28 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：感謝閣下翻譯這個模板，當初創建這個模板正是感到人們對感染人類以外動物的冠狀病毒（或者更廣泛來說，流行病學、疫情以外關於冠狀病毒的病毒學知識）關注太少了。剛剛無意間發現英文版也有人寫了RaTG13，便詳細擴充了RaTG13病毒。英文版竟連冠狀病毒的5' UTR、3' UTR、甚至3'UTR上的一個結構都自成一條目，真是絕了，希望今年有空時能在中文版將這些條目全部寫完，並重寫母條目冠狀病毒，不過與Covid-19直接相關的條目因為容易被政治污染，我就不碰了。--Wikimycota~🍄 2021年1月4日 (一) 09:29 (UTC)[回覆]

是在下先把閣下的中文版RaTG13翻譯為英文的，後來他們幾乎重寫了條目，畢竟英語不是母語，有很多語法問題 囧rz……--Htmlzycq（留言） 2021年1月4日 (一) 09:33 (UTC)[回覆]


I have created template {{Coronavirus genomes}} in enwiki. Do you have any suggestions for improvement?--Htmlzycq（留言） 2021年1月5日 (二) 02:48 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：感謝閣下貢獻（不愧是「模板控」）。粗看一下，membrane protein連到一般的膜蛋白去了，這個連結還是去掉的好（應該沒有辦法為冠狀病毒的M蛋白單獨寫一篇條目），outer membrane protein連到細菌的外膜蛋白去了（同上，這個也去掉比較好），非結構蛋白不同冠狀病毒歧異性很大，命名方式也都不同，難以概括，目前唯一有條目的NS3是連到HCV的，不是冠狀病毒的，關於冠狀病毒的NS，我想應該有蠻多是有建立成條目的價值（例如SARS1/2的ORF8，這個可以大書特書），但目前都沒有條目，可以等到有條目建立再放上去。
希望今年能在中文版將這些病毒學條目一一建立。題外話：中文版被埃及阿拉伯語趕超了？--Wikimycota~🍄 2021年1月5日 (二) 07:23 (UTC)[回覆]

在下建立這個模板只是先試一下，想改的還有很多，比如在這次大流行中這麼重要的spike protein英文至今都是重定向到Peplomer沒有獨立條目，這不應該啊，還有S蛋白的RBD，在下認為也有獨立條目的必要。

題外話：是的，埃及阿拉伯語20年初就開始瘋漲，2萬起步一年內突破100萬，11月初趕超了中文版，另外，9月烏克蘭語版超過了葡萄牙語版，與中文的差距也從2016年的24萬縮小到10萬，更多見Wikipedia:統計/與鄰近條目數量的語言版本比較存檔--Htmlzycq（留言） 2021年1月5日 (二) 09:09 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：確實RBD有獨立條目的價值，另外許多特定冠狀病毒的輔助蛋白（有研究闡明功能的幾個ORF）應該也能獨立成跳目，例如ORF8 in SARS, ORF3 in SARS等，另外還可以寫一篇冠狀病毒的輔助蛋白統整介紹不同冠狀病毒的輔助蛋白。閣下還有這方面的寫作計畫嗎？
一年增加100萬....跟瑞典語一樣是刷物種嗎？去年增加的條目大都是機器人刷出來的？--Wikimycota~🍄 2021年1月6日 (三) 09:07 (UTC)[回覆]

沒有，感覺在下沒有這個能力，在下在英文建立的條目基本上都是stub。

題外話：好像刷了很多人物，和阿拉伯語一樣，估計是同一批人幹的--Htmlzycq（留言） 2021年1月6日 (三) 13:26 (UTC)[回覆]

問一下刺蝟冠狀病毒和東北刺蝟冠狀病毒HKU31在Merbecovirus（支系C）中的親緣關係是最近的嗎？如果是，那該條目似乎應該和英文條目一樣，移動到「刺蝟冠狀病毒1」，而原條目可像鼠冠狀病毒（MCoV）一樣作為這一類的總稱當然，要有文獻支持這樣命名--Htmlzycq（留言） 2021年1月6日 (三) 15:39 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：是，這兩個應該是最近的，刺蝟冠狀病毒1是前者，東北刺蝟冠狀病毒HKU31沒有別名（好像也無人跟進研究），這兩個相似度只有79.6%，以冠狀病毒的慣例90%以上才被視為同種。剛發現英文版跟德文版都把Rat Coronavirus獨立成條了，這個應該跟小鼠的是同種。還有Letovirinae，這個亞科是單型的，不知為何英文版條目是以亞科為標題，而非病毒（雖然後來我引用了去年介紹的太平洋鮭魚病毒，但那篇僅是提到發現了與MLeV類似的病毒，沒有提及是否視為同種，或發表為新種，而且在您補充前英文版也沒有人注意到這個鮭魚病毒的存在）當初我就很想在英文版把它移動到MLeV，因為單型的單元應該用最下級的階層命名，也想過在Wikidata請求合併，但考量到在Wikispecies兩者還是不同的entry，不知道怎麼做。--Wikimycota~🍄 2021年1月7日 (四) 05:06 (UTC)[回覆]

誠如閣下用戶頁所說，英文維基上也充斥着不少過時的內容，之前的Letovirinae就是一例，相信隨着更多的對海洋生物病毒的探索，會有更多的勒託病毒被發現。MCoV這邊，感覺 Mouse hepatitis virus 和 Rat Coronavirus 都應該算作 Murine coronavirus 下的「subspecies」，而 Sialodacryoadenitis virus 和 Parker's rat coronavirus 應該算作「Strain」，龍泉羅賽鼠冠狀病毒的信息應該也可以加入Rat Coronavirus條目了。另外，Wikidata里很難合併的，即使物種名和異名都會有兩個entry--Htmlzycq（留言） 2021年1月7日 (四) 06:43 (UTC)[回覆]

英文版{{Coronavirus}}又給改成屬-亞屬的格式了，而且還是以字母順序排序，看來Ypna他們只接受ICTV的命名，但在下覺得這樣與Coronaviridae這個頁面的點列式列表無異，相比之下閣下的模板更方便看出各個支系之間的關係。--Htmlzycq（留言） 2021年1月8日 (五) 12:27 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：真不知為何這麼搞，ICTV收錄新種病毒的速度是很慢的，而且經常有漏，像Pacific salmon nidovirus這種只是論文中稍微提及的刪掉就算了，至少經論文在無爭議的期刊上正式發表、命名的病毒應該都充分符合關注度才是。重寫模板的人編輯摘要給出"rewrote entire template for taxonomic consistency and proper formatting"，不曉得是不是沒有看懂原本的模板是反映支序分類關係，而認為僅是未經整理的inappropriate formatting......--Wikimycota~🍄 2021年1月8日 (五) 20:43 (UTC)[回覆]

在下覺得像229E-like、NL63-like 這樣的分類名明顯好於 Duvinacovirus、Setracovirus 這樣不知所云的ICTV亞屬名，而且結構化的排布也很好反映了兩者相近的親緣關係，但他們要是以ICTV為權威，看來也只能這樣了--Htmlzycq（留言） 2021年1月9日 (六) 02:52 (UTC)[回覆]

RmYN02等

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另外，英文維基上有人覺得RmYN02符合關注度可以創建，見en:User_talk:ScrupulousScribe#about_RmYN02--Htmlzycq（留言） 2021年1月16日 (六) 11:14 (UTC)[回覆]

這位用戶他建立條目了，見en:RmYN02。另外有個問題，en:Bat SARS-like coronavirus WIV1和en:SHC014-CoV哪個離SARS-COV-1更接近？--Htmlzycq（留言） 2021年1月16日 (六) 17:27 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：WIV1可能近一些，用RBD做出的演化樹WIV1比SHC014更接近SARS[1][2]（WIV1非常接近Rs3367），但沒有找到全基因組下去比的，加上可能還有基因重組，我覺得真實關係難說，只能說都很接近。正好我有打算在中文版寫RmYN02、SHC014跟ZC45的條目，這幾個病毒株都有一定關注度，RmYN02是去年剛發現、跟covid相似度僅次於RaTG13且做出演化樹甚至可能比它更接近covid，SHC014是石正麗曾經拿來做可以感染人類細胞的重組病毒引起一陣風波，ZC45是閆麗夢聲稱covid人工製造的來源株。--Wikimycota~🍄 2021年1月16日 (六) 21:57 (UTC)[回覆]

謝謝閣下又寫了Rc-o319病毒，另外，記得在下在一篇文章中看到SARSr-CoV這個「種」下發現的病毒，可以明顯的分為三支，人SARS-COV-1和人SARS-COV-2分別位於其中兩支，假設這個分支系統被新的發現繼續鞏固，這個「種」是否將來會分為此三個「亞種」？--Htmlzycq（留言） 2021年1月18日 (一) 16:44 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：冠狀病毒好像不常使用亞種的概念，只會稱是不同病毒株，種的概念則是以複製酶保守區相似度90%來界定。我看到的文章都是只有分成SARS-CoV-1與SARS-CoV-2兩支，閣下記得另一支包含哪些病毒嗎（還是能不能找到那篇論文）--Wikimycota~🍄 2021年1月18日 (一) 17:06 (UTC)[回覆]
@Htmlzycq：找到了，是不是這篇，第三支是BtKY72與BM48-31兩種蝙蝠病毒。--Wikimycota~🍄 2021年1月18日 (一) 17:38 (UTC)[回覆]

嗯，那篇文章應該是時間上晚於這篇的一篇文章，那個時候剛剛被命名為SARS-COV-2。其中，第三支應該是包括BtKY72與BM48-31兩種以及其它多種病毒的一支，分化點早於SARS-COV-1和SARS-COV-2的分化，但貌似複製酶保守區相似度仍在90%以上。不過可能由於沒有產生可感染人類的病毒，所以很多文章的系統樹並沒有把這一支算進去吧。--Htmlzycq（留言） 2021年1月18日 (一) 18:29 (UTC)[回覆]

  1. 是的，根據PMID:31296683這篇發現的文章，BtKY72可能是在非洲國家發現的第一種β-冠狀病毒，應該有足夠關注度。
  2. 根據PMID: 32699095，PMID：33219796這兩篇文章，用基因組的不同片段建樹，BtKY72與BM48-31所在的這一支，有時候在SARS-COV-1和SARS-COV-2的分化點之前分出來，有時候插在他兩之間，但三者都很明顯的單支，沒有crosstalk。
  3. 臨時先把拉爾夫·S·巴里克這個stub建立了，看了年初有人寫的[3]，感覺他的故事可以多寫一些。--Htmlzycq（留言） 2021年1月19日 (二) 12:04 (UTC)[回覆]
@Htmlzycq：大概看了下PMID: 32699095是比較各病毒株S蛋白和各物種ACE的結合，好像沒有提到支序分類？33219796這篇全基因組去做的樹中BM48-31插在他倆中間（更接近SARS-1，但clade的分數只有64），相較之下我上面連結的那篇也是拿全基因組做樹，BM48-31是在最基部（分化點早於SARS-1與2的分化點），結果不太一致（否則我會在條目中畫支序圖），可能是33219796分析的病毒株比較少造成，另外可惜它沒有把RmYN02加進去比較。
另外剛才研究了一下這個「第三支」，有些新發現，從BM48-31的那篇發現了一支"Ghana-348"，是2009年這篇所發表（僅有RdRP保守區序列，未有全基因組序列），這支本身不被視為SARSr-CoV，而是SARSr-CoV的姊妹群，比HKU9更接近SARSr-CoV，這樣它地位有可能接近蹄蝠乙型冠狀病毒浙江2013，兩者關係令人好奇。而2009年還有另一篇發表了許多肯亞的SARSr-CoV（也未有全基因組序列，僅有RdRP保守區），雖然演化樹的解析度不高難以判讀（甚至Betacoronavirus都不成單系群了），但粗看之下這些有可能也是SARSr-CoV中比較基部的演化支，可能地位也跟BtKY72類似。不過有完整基因組定序的應該只有BtKY72和BM48-31，兩者我都會盡量寫成條目（我自己對病毒關注度的門檻是具有完整序列，且論文中有特別段落介紹，所以一篇發表數十種病毒的論文，大概會有數種有寫的價值）。前幾天看2020.12.18石正麗在專欄中說"(Rc-o319) is the first full-length genome sequence of bat sarbecovirus reported in an Asian country other than China"，我還相當疑惑為何要強調"Asian"，追到這裡才知道應該就是歐洲、非洲有BM48-31和BtKY72的緣故，可惜絕大多數文章都不提了，這些中國以外的病毒株對重構SARSr-CoV的演化史應該是非常有幫助的，不知道除了上述這些，閣下還有沒有看過哪些中國以外的SARSr-CoV（穿山甲病毒應該也是，畢竟那穿山甲是從南洋走私到中國，不是原產在中國，幾個月前Nature也有文章提及柬埔寨發現了接近SARS-2的RdRP序列，但尚未發表）--Wikimycota~🍄 2021年1月20日 (三) 02:11 (UTC)[回覆]
@Htmlzycq：ZC45病毒與ZXC21病毒，這次是您們浙江的，這兩個是疫情爆發時唯二已知與SARS-CoV-2在同一支的病毒，其他都是之後才發表的，所以去年爆紅了....--Wikimycota~🍄 2021年1月20日 (三) 06:48 (UTC)[回覆]

謝謝，其實舟山和台北到我家直線距離都是300公里，就是一個有跨海大橋一個沒有，ZC45去年爆紅了一下，但風頭迅速被穿山甲病毒蓋過去了 囧rz……

BtKY72與BM48-31兩種所在的這一支（這裡在下「原創研究」一下，暫時把它稱為SARS-COV-3），現有的發現地基本上位於歐洲非洲，和SARS-COV-1、SARS-COV-2的主要發現地，華南及東南亞（在下認為算是一個地理區）有着「地理隔離」，因此應該是較早分離出來的基部的演化支，其獨立演化過程中，應該沒有與1、2發生重組。部分序列樹顯示的SARS-COV-3插在它兩之間的可能是樣本量少造成的偏誤？ --Htmlzycq（留言） 2021年1月20日 (三) 10:05 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：對，可能是樣本數較少所致（如我上則留言所說，PMID：33219796使用的樣本較少）。最近越是研究，越發對SARSr-CoV的演化史感到好奇，並對為何SARSr-CoV是在東洋區（即華南與東南亞）、而非其他地方發生輻射演化感到百思不得其解，可惜沒有查到任何類似的研究（估計關心的人太少，而且中國以外地區對SARSr-CoV的研究、調查相當不足），我想要回答這個問題，應該還得對蝙蝠的生物地理學有相當了解。這些資訊對於阻止下一次的疫情爆發應該相當重要（剛好閣下使用SARS-CoV-3，有些不吉，彷彿這「第三支」不讓另外兩支專美於前，在20X0年迸出了一個SARS-CoV-3又造成一番疫情）。
下一篇我便打算寫穿山甲冠狀病毒。待疫情結束，閣下應該來台灣一遊。--Wikimycota~🍄 2021年1月20日 (三) 22:49 (UTC)[回覆]

謝謝邀請，話說「不讓另外兩支專美於前」的可能性還真有 囧rz……，畢竟它分布範圍這麼廣，看了保加利亞那篇論文，好像大多數蝙蝠在地中海南北都有分布，不知道在保加利亞和Kenya之間還有多少未知在等着人們去探索。關於對於阻止下一次的疫情爆發，在下記得石正麗20年的一次網絡演講中提到了她認為的有可能演化出感染人類的支系應該是重組變異最多的幾個，另外在下想起了[4]一文中的Ralph S Baric，沒有他在02年及更早先對冠狀病毒的前瞻性研究，中國的科學家就不會這麼快認識到「非典」是冠狀病毒引起的，如果沒有在03年爆發了非典，可能他會轉行成為一個游泳教練，可以說是相互成就吧。不過石正麗和Ralph S Baric這二位現在變成了某些「陰謀論」的主角了 囧rz……

關於「穿山甲冠狀病毒」，感覺和ZC45病毒與ZXC21病毒不一樣，ZCZX兩者關係非常近，目前沒有發現舟山以外的病毒，但是廣東截獲的和廣西截獲的很明顯關係不近，兩者之間有其它的蝙蝠病毒在，說明東洋區的蝙蝠與穿山甲之間發生了多次相互傳播的事件，估計以後會有很多「穿山甲冠狀病毒」發現，建議條目在將來可以寫成類似於蝙蝠攜帶的病毒的綜述形式--Htmlzycq（留言） 2021年1月21日 (四) 03:53 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：作為從事基礎科學研究的人，我對基礎科學不受重視的情形深有體會（在維基百科好像也是如此），閣下有興趣繼續擴充Baric的條目嗎？可參考這篇（有提到他非常擅長游泳，可惜沒講到他一度撐不下去要去當游泳教練...）。
穿山甲冠狀病毒除了去年3月這篇發表的廣西、廣東型，至少還有[5][6][7]，其中PMID: 31652964是唯一一篇疫情前發表的，雖無完整序列，但可見穿山甲冠狀病毒相當多樣，甚至可能包含alphacoronavirus, deltacoronavirus的成員。而另外三篇都是疫情後發表的，這三篇的病毒應該很接近，都是RBD和SARS-CoV-2相似度極高（關鍵位點完全吻合），都是廣東廣西海關截獲的穿山甲，但都沒有把他篇的pangolin-cov拿來相互比較，看來條目不好處理，需要思考一下。
蝙蝠攜帶的病毒這個條目相當重要，百科性很強，在英文版是優良條目，等這些SARSr-CoV處理完，希望能將英文版完整翻譯。--Wikimycota~🍄 2021年1月21日 (四) 06:23 (UTC)[回覆]

聊聊其他的

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擴充Baric的條目還是留給其他維基人吧，在下最近想儘可能多的建立一些學者條目，哪怕是一個小條目，也可以幫助其他人。說道這個，懷念一下被錯誤封禁的User：鏡海水手，當年我是這麼問他為什麼要寫這麼多科學家小條目的時候，他說圖方便快速建立一些。

User_talk:靖天子/存檔4#關於那個用戶的禁封，User_talk:Jinghaishuishou#這到底是怎麼回事！？

最近建立了好幾個獎項等科學家有關列表如劉易斯·托馬斯獎、美國科學促進會主席等，還能看到他當年所寫的學者小條目--Htmlzycq（留言） 2021年1月21日 (四) 11:16 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：我簡單擴充了Baric的條目，中文維基百科的科學家條目確實非常缺乏，記得我寫過一些真菌條目，內文提到近十位科學家，清一色全部沒有條目、一片綠色連結.....那位是武漢大學的朋友吧，轉眼間竟已七年了，閣下當年說維基有點「萬馬齊喑」，然而現在中文維基的社群環境又不知比當年惡化幾倍了，虧得閣下多年不輟寫作大量生物與化學條目。也看到我早已無力更新的Portal:生物學/新進條目，很高興這兩年在閣下長期努力之下又持續運作。--Wikimycota~🍄 2021年1月21日 (四) 21:13 (UTC)[回覆]

Baric已經提報DYK，另外Portal:生物學/新進條目現在在下也無力更新了，有幾位不斷更新動物物種的維基人在接力，雖然忽略了其它生物領域，但也算是一件幸事了--Htmlzycq（留言） 2021年1月21日 (四) 23:09 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：感謝提名，剛剛又多擴充了一些。一個小發現：剛疑惑為何2002那篇MHV cDNA的研究文中僅說 "In this study we report the first reverse genetic system for a group II coronavirus, MHV-A59"，後來查到在Baric成功組裝MHV的cDNA前，已經有人組裝了TGEV與IBV的cDNA（[8][9]），分別屬group I與group III。
有注意到來了幾位專門寫恐龍、古生物的維基人，恐龍領域多年來出了幾位專精的編者，算是中文維基百科的生物條目中難得比較多人關注的。--Wikimycota~🍄 2021年1月21日 (四) 23:42 (UTC)[回覆]
是的，其實十年前的也是有幾位專門寫恐龍的維基人，許多Wikipedia:模仿專題/英語維基典範條目#非鳥恐龍里的優良條目是他們當年寫的。--Htmlzycq（留言） 2021年1月22日 (五) 05:07 (UTC)[回覆]
@Htmlzycq：穿山甲冠狀病毒。仔細閱讀[10]的全部數據後我對演化樹中有Pangolin-CoV屬於Deltacoronavirus與Alphacoronavirus的演化支感到相當懷疑，認為這應該是樣本數過少造成，這篇文章自己附上的blast結果也認為那些病毒是與SARSr-CoV相似，且他們隔年的新文章[11]也只主張有一種SARSr-CoV。所以我認為已知的穿山甲冠狀病毒應該通通屬於SARS-CoV，條目中還是使用了分類框，當然它們彼此並不構成一個單系群，中間穿插有蝙蝠病毒，因此特別畫出演化樹讓讀者參考。穿山甲病毒被不同研究組多次發現，彼此間又缺乏比較（像是Pangolin-CoV-2020可能根本跟GD是相同的），資訊紛亂，實在是不太好寫的一篇條目。
看了閣下的連結，感到古菌可能是在下有興趣翻譯的（但短期應該還是寫冠狀病毒為主），至於那一堆菇類的FA對讀者的幫助感覺不大，我倒不是很有興趣寫--Wikimycota~🍄 2021年1月23日 (六) 02:44 (UTC)[回覆]

謝謝閣下的貢獻，由於維基不能原創研究，就算Pangolin-CoV-2020根本同GD相同也要等今年出一些綜述性文章後，維基再來跟進引用。 另外，在下把Rc-o319病毒加上去了，畢竟是目前明確的SARS-COV-2里最遠的一支。

古菌，相當重要的基礎條目，在下13年的時候擴充過一點點，把「new domain」翻譯為「新域的誕生」，近年來看到英文條目有了一些變化，比如分類樹等，該跟新了。--Htmlzycq（留言） 2021年1月23日 (六) 04:11 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：WIV病毒。這大概是SARSr-CoV中最重要的，英文版整個寫偏了，除了第一句話之外通通離題......閣下如有關於古菌條目的編寫計畫，我也可以幫忙。--Wikimycota~🍄 2021年1月23日 (六) 09:03 (UTC)[回覆]

(？)疑問條目名不應該是WIV1病毒嗎？

應該是閣下有什麼計劃，在下也可以幫忙才對

去年年中開始，在下基本上把哲人石叢書等翻譯、創建的叢書條目作者寫了個stub，見User talk:Ma3r#關於叢書類型條目的探討，在下想繼續下去，世紀人文系列叢書里的作者是一個很大的工程，--Htmlzycq（留言） 2021年1月23日 (六) 10:40 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：糗了，漏了個1，補上了。這麼多作者看來是浩大工程。--Wikimycota~🍄 2021年1月24日 (日) 04:40 (UTC)[回覆]
@Htmlzycq：YNLF 31C病毒與YNLF 34C病毒。我原以為這兩個應該是ORF8跟SARS最接近的，相似度超過八成了，不料[12]竟發現潛藏在資料庫中的兩個中華菊頭蝠病毒株ORF8和SARS的幾乎相同，大出我意料之外，這其實幾乎把原論文提出SARS-1是Rf, Rs兩種蝙蝠中SARSr-CoV重組而來的假說給毀了，偏偏兩篇沒有互引，也沒有其他文章引用比較，受限於原創研究而不能在條目中寫太多。
查閱大量資料後感到SARSr-CoV的資料相當零散，沒有完善的綜述性文章概括所有重要內容，只好讓在下斗膽在中文維基百科發揮此功能。另外關於閣下之前詢問WIV1與SHC014和SARS-1的相似度，根據[13]這篇確實是WIV1略高0.2%，但這篇新發表的WIV16病毒跟SARS-1相似度96%，應是目前已知跟SARS-1最相似的（不計果子狸的話），這些在下都會盡快建立完善。--Wikimycota~🍄 2021年1月24日 (日) 10:05 (UTC)[回覆]

條目數量

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嗯，之前在和Ma3r討論的時候是把寫書籍條目作為「三步走」的「第三步」的，但後來發現自己寫作者條目stub越寫越順利（都形成固定的套路了）就想快點都建起來。另一個原因是這些作者中文譯名都是有來源的，直接用譯者給出的就行了，不會像寫其他人需要「原創譯名」，其實在下這段時間裡寫了《病毒星球》、《致命伴侶》這些書裡給出的病毒學家、細菌學家等學者的stub也是因為譯者給出了譯名，不需要「原創」。

預測一下，2021年越南語、日本語的條目數量都應該會超過LSJbot當年搞大的瓦瑞瓦瑞語，中文版應該會在2022年初--Htmlzycq（留言） 2021年1月24日 (日) 10:10 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：（在下前一則留言湊巧與閣下編輯衝突了，好像沒有ping到）至今仍對當年基金會放任、甚至公開鼓勵這類用機器人刷條目的做法感到不解，那幾個小語種維基也算是毀了。特別是物種條目，中文至今都未能清完當初錯誤、重複的條目。記得當年我們還在與越南語互相追趕，現在居然他們領先這麼多去了--Wikimycota~🍄 2021年1月24日 (日) 10:39 (UTC)[回覆]

原來基金會還公開鼓勵過bot？真是大開眼界。

雖然沒搞懂阿拉伯語和埃及阿拉伯語編者之間的關係，但在下這樣推測：在那幾位人肉機器人把阿拉伯語刷過百萬條目後，被阿語版社群「趕走」了，之後他們轉戰埃及阿拉伯語刷了百萬以上條目，直到數據庫暫時性「枯竭」，不知道埃及阿語版接下來會有什麼動作。

越南語也是14年刷過百萬條目的，不過中文版也沒什麼好驕傲的，當年也是刷過條目，見{{Milestone}}--Htmlzycq（留言） 2021年1月24日 (日) 16:13 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：好像是某次年會上講的，非但不考慮將那些小語種打回原型，還大加表揚了一番，不過我也是從別人處聽說。記得埃及阿拉伯語版當初連是否獲准設立都吵了一陣子，現在居然都超過中文版了。話說回來，當年我們先後跟越南語、瑞典語和宿霧語大戰，真是一段熱血的時光，雖然我沒有能力操縱機器人參與，但每天看到客棧裡大家為了同一目標討論分工的氛圍，包括好幾位彼此不合的維基人都攜手合作，讓我更加體會到維基百科合作的精神，不過現在社群分裂至此，大概沒機會再看到類似的場景了....
關於{{SARSr-CoV}}，有關注度的條目快寫完了（HKU3病毒這種很久以前發表的病毒實在非常難寫），其他關注度不足以成條的病毒株應該有上百個，思考了一下後我打算在SARSr-CoV條目中以列表的形式介紹，包括長度、發表時間地點、宿主與特徵簡述，如能順利寫完應該會是一篇篇幅龐大的特色列表。--Wikimycota~🍄 2021年1月25日 (一) 00:20 (UTC)[回覆]

謝謝閣下貢獻，之前閣下把HKU1寫到了三十幾，唯獨少了3，在下還以為沒有這個編號的病毒呢

列表的形式記錄關注度不足的病毒株這個想法很好，希望能成為特色列表。--Htmlzycq（留言） 2021年1月25日 (一) 04:19 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：不好找，HKU3應該是第一個被發現的蝙蝠SARSr-CoV，發表時都還沒有命名，全文找不到HKU3這個名稱，只叫做bat-SL-CoV。這個列表我目前構想，是先以幾個段落的文字介紹2003年以來至今SARSr-CoV的研究史，包括重要的幾篇研究，和幾個特別重要的病毒株，列表的部分欄位應該包括名稱、宿主、樣本採集時間、採集地點、發表時間、序列長度、有完整序列與否、成功分離與否、序列與SARS-CoV（或SARS-CoV-2）的相似度以及註腳。--Wikimycota~🍄 2021年1月25日 (一) 06:34 (UTC)[回覆]

路過

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顧名思義，路過。這就是神仙打架嘛 Orz —— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年1月26日 (二) 03:09 (UTC)[回覆]

@Ericliu1912：沒看懂，哪裡打架啦？--Htmlzycq（留言） 2021年1月26日 (二) 10:39 (UTC)[回覆]
我也知道這個詞用的不好，要說的話應該是「神仙討論」，但顯然原創用詞不會有人看得懂（ —— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年1月26日 (二) 14:08 (UTC)[回覆]
@Ericliu1912：沒事。剛發現，原來英文版的菊頭蝠科最近成為了特色條目了，有一段整理了其SARSr-COV的數量，見en:Horseshoe bat#Coronaviruses --Htmlzycq（留言） 2021年1月26日 (二) 14:11 (UTC)[回覆]
英文維基百科的優質內容產製速度血洗本地啊，生物學方面算是本地相對落後的一個領域。多虧有靖天子閣下等人奮力撐著門面。—— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年1月26日 (二) 14:14 (UTC)[回覆]
  • @Ericliu1912、Htmlzycq：感謝，第一次聽到這個詞。不過「撐著門面」還不敢當，門面應該是生物學中比較重要、點閱率高的基礎條目，中學課本就會介紹的概念，這些「門面」不幸在中文維基百科中大多質量很低，過去雖曾有許多獲選優特條目（例如個人印象很深刻的光呼吸），但2012左右通通被撤銷了，那些條目的主編也早已離開維基百科。我個人寫「門面」的優特條目大概只有5條左右（真菌、白色念珠菌、管胞、糊粉層、巴爾小體），還有很多我希望能寫成優特的，包括古菌、轉錄、轉譯、核糖體、tRNA、mRNA、rRNA、miRNA、RNA、RNA世界.....只是這些大都需要原創編寫，而需要長期規劃整理。
  • 計算病毒株數目我覺得不一定能反映多樣性，畢竟有的毒株彼此高達99%相似也被視為不同的，可能某篇研究多採了幾隻蝙蝠就多幾個病毒株了。說到蝙蝠，這麼多年來我好像沒看過任何一位維基人寫蝙蝠的條目，也沒印象有在DYK見過，打開翼手目分類表，大部分是紅字，藍字也全部都是小作品，大概放幾年都不會有人寫，可能等得哪天有對蝙蝠有興趣的「神仙」加入才能改善。--Wiki SL-CoV🦠 2021年1月26日 (二) 20:25 (UTC)[回覆]

en:Template talk:Coronaviridae，Ypna 建議我們中文也該改成他那樣的，該怎麼和他解釋好呢？--Htmlzycq（留言） 2021年1月27日 (三) 16:09 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：我上去留言向他解釋了。另外英文版把gamma跟delta完全搞反了，不但模板裡寫反，很多條目裡也寫反，這錯誤實在是......看了編輯紀錄，不知道是不是ICTV網站上寫反了（我打不開ICTV網站上的分類表）。
倒是有一點收穫，就是發現了幾個漏寫的鳥類病毒（有些是去年剛發表），例如鴨冠狀病毒2714、鵝冠狀病毒CB17，哎真是永遠沒有寫完的一天。--Wiki SL-CoV🦠 2021年1月27日 (三) 21:22 (UTC)[回覆]

看了一下ICTV沒搞錯，Ypna搞錯了。另外，他用的NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b、Myodes coronavirus 2JL14也全都是ICTV里的物種名--Htmlzycq（留言） 2021年1月28日 (四) 02:09 (UTC)[回覆]

ICTV等

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  • @Htmlzycq：打擾了，能不能幫我看下ICTV網站（不知為何我用任何瀏覽器都顯示錯誤頁面），gammacoronavirus現在是不是分成五個物種（Avian coronavirus, Avian coronavirus 9203, Duck coronavirus 2714, Beluga whale coronavirus SW1與Goose coronavirus CB17）？網站上有提供支序圖或其他分類資訊嗎？謝謝。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 01:28 (UTC)[回覆]

是的，ICTV的分類系統裡，gamma分為三個亞屬，五個種，和當前英文版一致，其中 Avian coronavirus 是 Igacovirus 的「模式種」--Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 01:40 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：感謝，我將擴充鳥類冠狀病毒條目至優良條目。火雞的看來也被歸入9203了。最基群是鯨豚那隻嗎？看到有文章說CB17是Igacovirus（三個鳥類病毒物種）的姊妹群。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 01:58 (UTC)[回覆]

ICTV的分類里，都是三個三個並列，看不出來誰是基群--Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 02:10 (UTC)[回覆]

在下有這種感覺：和最新文獻中給出的分類系統相比，英文維基更傾向於使用已有的網絡數據庫給出的分類系統，哪怕數據庫本身已經有點過時，比如在下之前在和Boghog討論的{{轉錄因子與細胞內受體}}中的Paired box (3.2)等分類編號來自於TRANSFAC數據庫，見en:User_talk:Boghog中的About_{{Transcription_factors_and_intracellular_receptors}}

PS:96%是個挺神奇的病毒全基因組相似度，SARS-COV-1和WIV16病毒，SARS-COV-2和RaTG13病毒，OC43和牛冠狀病毒--Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 03:21 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：恐怖唷，不知道這3-4%是不是某個很難變異出來、感染人類所需的關鍵元件（ORF8?），一旦越過這最後一道關卡人類就淪陷了（好像在講Great Filter（英語：Great Filter））
用資料庫的好處是簡明、編輯門檻低、好維護，但如果有人對這個領域很熟悉（Ypna應該也是病毒學的專家）人為去抓文獻可以得到比較豐富的結果。
另外感謝閣下創了MALAT1，還有興趣寫其他基因嗎？我特別喜歡lnRNA，有機會可以擴充。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 06:14 (UTC)[回覆]

在下覺得應該不是Great Filter（英語：Great Filter），而只是採樣密度的問題，隨着田野調查的深入，應該會發現相似度更高的不能感染人的病毒，除非MERS等一系列別的也卡在96%

PCGEM1、His-1、MALAT1、H19這幾個，是在陳潤生院士的公開課第三集中看到的，見[14] --Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 06:46 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：是的我是開玩笑的 囧rz……，應該是取樣誤差所致，跟MERS最接近的是祖魯棕蝠冠狀病毒，沒有做全基因組定序，但看RdRP的差異，兩者應該還是差蠻遠的。期待哪天能發現跟SARS-CoV-2相似度99%的病毒。
閣下工作之餘還看公開課，並將所學寫成條目，要是有更多生物學者這麼做就好了。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 18:50 (UTC)[回覆]

鼠冠狀病毒已幫閣下提名DYK，另外，大鼠冠狀病毒是單系群嗎，還是和穿山甲冠狀病毒一樣的復系群？能做一個M-CoV內部的系統樹嗎？--Htmlzycq（留言） 2021年2月5日 (五) 01:21 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：感謝閣下提名，冠狀病毒寫到一半發現這條還有許多內容能寫。小鼠跟大鼠的應該都是單系群，但大鼠中SDAV跟帕克有可能不是（有人認為帕克只是SDAV的一型），不過沒有看到有人做鼠冠狀病毒之下各株的演化樹。浙江那兩支鼠病毒的位置也很不清楚（不同區段做出的結果不同），Puffinosis是污染的機率很高（真是感染鳥類就有趣了）。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月5日 (五) 06:18 (UTC)[回覆]
  1. 明白了閣下對DYK 應該只上一次的想法，不過在下覺得wiki上關於科學的內容應該多多宣傳才是。
  2. 在下感覺Puffinosis應該是污染吧，畢竟1982年的實驗，如果放在今天，應該會先來一次組織RNA測序，看看有沒有冠狀病毒RNA。
  3. 突然發現HKU24也是在大鼠中發現的病毒，那大鼠冠狀病毒這個條目未來應該改為對「所有能感染大鼠的冠狀病毒」的綜述性質條目。
  4. 結合A支系大部分都在齧齒動物（鼠類、兔類），估計有好多次傳播到大鼠的事件，待以後看看怎麼寫吧。
  5. 「可能是起源於鼠類，而非蝙蝠」 這樣表達感覺不妥，畢竟整個α、β冠狀病毒都是起源於蝙蝠，這樣表達會讓讀者以為此病毒的演化路徑無關蝙蝠，「早先就傳播到齧齒動物」、「在齧齒動物中長期獨立演化」（還是閣下來組織語言吧）

--Htmlzycq（留言） 2021年2月5日 (五) 07:30 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：
    1. 確實，科學條目少得可憐，不成比例，DYK跟優特條目經常半條科學條目都沒有，過去一直想推廣專業人士進來寫，多年來的感想還是我自己動手寫最快。不過說到這我倒是突然想到，閣下是不是之前有召集身邊的人合寫生物條目過？
    2. 是的，後續也無人研究了，但是個挺吸引人的假說（原論文聲稱只有患病鳥類組織感染的小鼠中可以分出病毒，其他小鼠中沒有），畢竟gamma跟delta都有外溢到哺乳類，alpha跟beta外溢到鳥類也是可以想像的。
    3. 是的，感染大鼠中的冠狀病毒有三：1.MCoV下的所有大鼠冠狀病毒、2.HKU24、3.alpha的鹿城褐家鼠冠狀病毒，小鼠的則有二：1.MCoV下的MHV、2.乙型冠狀病毒1型的龍泉黑線姬鼠冠狀病毒（LAMV）。但後面幾種幾乎無人討論，文獻中提到"Rat Coronavirus"、"Mouse Coronavirus"還是都只在討論MCoV底下的。如果之後有更多種病毒發現，可以將大鼠冠狀病毒獨立寫成綜述條目。兔也有類似狀況，除了HKU14外至少有兩株很早就發現但無人研究的冠狀病毒。
    4. 確實可能有此誤解，還是您想得周到，我稍微調了一下，您看能不能再調。可惜這個假說提出時就只是一筆帶過，寫太多怕有原創研究的感覺--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月5日 (五) 09:29 (UTC)[回覆]

鼠類的冠狀病毒

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在下還有個問題，在A支系中，ICTV給出的是五個物種，en:Myodes coronavirus 2JL14應該在系統樹的哪裡？--Htmlzycq（留言） 2021年2月5日 (五) 15:04 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：閣下不提的話我還不知道有這病毒，一查發現很有意思，是來自這篇文章[15]，這篇是大規模鼠類病毒的survey，沒有深入探討冠狀病毒，但發現了支序A大量的鼠類病毒（Fig.5)，感染包括不同屬的許多物種（不只大鼠與小鼠），2JL14在beta-CoV-1的那一支，不考慮基部那個HJL2015的話樹型還是MCoV, HKU1 以及 beta-CoV-1兩大支，比起HKU24那篇只發現一種就宣稱支序A共祖是鼠病毒，這篇的結果才真正說明了這點。
另還有兩點讓我驚喜的：1.AlphaCoV那邊有許多跟鹿城鼠病毒相關的，表示這不是孤例，AlphaCoV那裡真的有一大支跳到了囓齒類；2.Alpha基群是一個在西藏鼩鼱發現的病毒，馬上讓我想起之前寫過的文成鼩鼱病毒，在演化樹上也是AlphaCoV的基群，看來這也不是孤例。可惜這篇作者並未引用文成病毒那篇。
ICTV獨列2JL14是我不太能理解的，2JL14的位置並不特別特殊。這些病毒株本身根本沒有任何介紹，應該是不符合關注度的，寫了2JL14，就沒理由不寫另外20幾個病毒株的條目，真的要寫的話寫成「鼠類的冠狀病毒」（Coronavirus in rodents）比較合理。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月6日 (六) 10:16 (UTC)[回覆]

謝謝閣下指出了這篇文章，這篇文章中冠狀病毒的內容是Figure 5a 與 Figure S6，分別以RdRp和S蛋白建立的系統樹只不過鹿城褐家鼠冠狀病毒沒有在S蛋白樹中列出，HKU24在RdRp樹中也標紅了讓人難找，寫作的時間應該晚於User_talk:靖天子/存檔8#有關冠狀病毒里提到的HKU24和鹿城褐家鼠冠狀病毒發表的時間，但早於文成鼩鼱病毒（WESV）的發表時間[16]MCOV中的LRLV和β1CoV中的LAMV在這篇文章中分別標為「longquan-708」和「longquan-343」？

貌似無論RdRp還是S建樹，與OC43關係最近者都不是牛冠狀病毒，牛冠狀病毒只是全基因組與OC43最近嗎？還是β1CoV中有其它更近的？

文成鼩鼱病毒（WESV）與這篇文章提出來的Shrew-CoV/Tibet2014的關係不知道後來有沒有人做過？

這篇文章裡和鹿城褐家鼠冠狀病毒最近的是福建省發現的RtRl-CoV/FJ2015，這麼近的距離，估計真的是 in situ evolution --Htmlzycq（留言） 2021年2月6日 (六) 15:51 (UTC)[回覆]

再看了一遍，doi:10.1016/j.virol.2014.10.017文章的RdRp樹中，明明龍泉羅賽鼠冠狀病毒（LRLV）和HKU1是最接近的，為什麼又說LRLV belong to the established species murine coronavirus，而ICTV里HKU1是單獨一個species的？

閣下的「鼠類的冠狀病毒」（Coronavirus in rodents）的想法在下覺得確實有意義，在下試着先在沙盒裡寫了一點點，不過感覺很快就會碰到「原創研究」。

最後，ICTV把2JL14獨列的原因估計是它是完成全基因組的12個之一，而且RdRp相似度剛好小於90%一點點。--Htmlzycq（留言） 2021年2月6日 (六) 16:54 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：沒有人做文成鼩鼱與西藏2014的關係，文成那篇發表於2017年8月，大規模鼠病毒研究是2018年10月，且後者內文還特別強調了西藏鼩鼱的特殊演化地位，可惜沒有引用前者一起討論，看起來西藏跟浙江中間應該還有大量鼩鼱病毒才是（剛發現鼩鼱原來跟嚙齒目關係是很遠的）。
LRLV的地位用不同區段建樹結果不同，有時更接近MCoV，有時更接近HKU1（RdRP是跟HKU1分成一群），其中龍泉708可能是兩支鼠病毒重組產生，所以我在鼠冠狀病毒中使用比較有彈性的描述，形容它跟MCoV、HKU1都很接近，但是作者選擇將其歸入MCoV，估計是當時不知HKU1有鼠病毒，根據大規模鼠病毒研究結果，LRLV（龍泉708）應該是在HKU1這一支（因為地位模糊我就沒有畫在演化樹上了），LAMV（龍泉343，龍泉黑線姬鼠冠狀病毒）確實在betaCoV1那一邊，但跟HKU24和其他鼠病毒成一支，跟其他betaCoV1沒那麼近，看起來不應該算betaCoV1的一株，否則兔HKU14跟HKU24也都能歸入betaCoV1了我一開始真的因為紅字漏看了HKU24跟LAMV。現在冠狀病毒這麼火紅，期待能再有幾篇這樣的大規模調查研究（特別是中國以外的）出來。
OC43跟馬、牛關係估計都很接近，也是不同區域做的結果不同，不知道是不是也有重組發生（但目前看到文章都咬定OC43是直接從牛分家）
「鼠類的冠狀病毒」，可以alpha、beta分段，alpha講鹿城那一支，beta至少有MCoV、HKU1-like、HKU24/LAMV-like三支，然後再一節講演化（確實有點原創總結的感覺）。同理還有「蝙蝠的冠狀病毒」、「鳥類的冠狀病毒」。
順帶一提，鼠冠狀病毒經過這幾天擴充，感覺足夠典範條目了，打算在優良條目之後提出，閣下認為這個條目還有沒有哪些內容可以寫的？--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月6日 (六) 22:03 (UTC)[回覆]

有沒有這種可能，LRLV（龍泉189、370、708）、LAMV（龍泉343）發表時，HKU1、14都已經發表了，但是ICTV並未更新，其A支系中，給出的只有兩個物種：β1-COV 和 M-COV，所以那篇文章就暫時放入了這兩個？--Htmlzycq（留言） 2021年2月7日 (日) 01:10 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：我覺得挺有可能的，畢竟ICTV比較常用「物種」的概念，文中說established species確有可能是指ICTV認定的。不過HKU1早在2005年就發表，這也拖太久了。另外今天偶然發現了一個閣下應該會有興趣的列表：en:Royal Society of London Michael Faraday Prize，感覺閣下會有興趣撰寫此條目以及上面的科學家。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月7日 (日) 07:54 (UTC)[回覆]

鳥類的冠狀病毒

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  • @Htmlzycq：謝謝閣下建立了倫敦皇家學會邁克爾·法拉第獎，寫完後應可評選特色列表，其中有位獲獎者Nick Lane是我相當崇拜的演化學家，他的書可說是我生物學的啟蒙之一。我打算開始寫鳥類冠狀病毒，這個條目閣下建議該如何處理，應該只收錄現ICTV定義的Avian Coronavirus（包括一些IBV病毒株、一些鴨病毒株[17]），將Avian coronavirus 9203（包含Turkey Coronavirus跟一些IBV的病毒株）跟Duck coronavirus 2714另立條目，還是將這些都寫在同一條目中？這些病毒分類相當混亂，Duck coronavirus 2714那一支也包含許多名為Avian Coronavirus XXXX的病毒--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月7日 (日) 21:47 (UTC)[回覆]

不敢當，不敢當，能像劉易斯·托馬斯獎一樣把坑填完就行了，話說這兩個都是科普類的獎項，有好多人獲獎者重複的

感覺「鳥類的冠狀病毒」和Avian coronavirus、IBV的處理方式可能要像鼠這樣處理：

綜述性條目 ICTV定義的物種 模式株
鳥類 鳥類的冠狀病毒 禽冠狀病毒 禽傳染性支氣管炎病毒
英文 Coronavirus in birds Avian coronavirus, A-COV Avian infectious bronchitis virus, IBV
鼠類 鼠類的冠狀病毒 鼠冠狀病毒 鼠肝炎病毒
英文 Coronavirus in rodents Murine coronavirus, M-COV Mouse hepatitis virus, MHV
  1. 「鳥類的冠狀病毒」，可以gamma、delta分段，gamma里似乎除了Cegacovirus，都是鳥類的？
  2. 「禽冠狀病毒」里可以一筆帶過以Avian coronavirus 9203為模式株的另一個ICTV定義的種，主要介紹該種下各個株
  3. IBV建議還是移動回原條目名，順便吐槽一下英文維基對這裡的處理："Avian coronavirus (IBV) is a coronavirus that infects birds, causing the associated disease avian infectious bronchitis (IB). "讓人一頭霧水

另外，閣下不先把冠狀病毒提報DYK嗎？還沒上過，再不提報要過期了 --Htmlzycq（留言） 2021年2月8日 (一) 06:05 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：鼠肝炎病毒我沒有另立條目，直接寫在鼠冠狀病毒裡面，閣下的意思將禽冠狀病毒（Avian Coronavirus、ICTV的那個種）與傳染性支氣管炎病毒（IBV）分成兩個不同條目嗎？這裡比鼠類更難處理是因為MHV至少通通是從屬於M-CoV之下的，但IBV不同的株系分散在Avian Coronavirus以及Avian Coronavirus 9203這兩個物種中，另一點是Duck coronavirus 2714下的許多病毒株又叫做Avian Coronavirus XXXX（[18]此篇Fig.1有清楚的演化樹）。如果分開的話，禽冠狀病毒跟禽冠狀病毒9203就只講分類，傳染性支氣管炎病毒才介紹病毒機制與疾病？另一種處理方式是只寫一個條目禽冠狀病毒，將Avian Coronavirus, Avian Coronavirus 9203跟Duck coronavirus 2714的分類，下面各病毒（包括IBV、火雞病毒、鴨病毒的分子機制流行病學研究歷史）都包含在內。
是的，gamma只有Cegacovirus是哺乳類，有一點讓我感到意外的是，原本以為鯨豚這支是從某個鳥類病毒外溢過去，應該散落在鳥類支系中，但Cegacovirus其實是整個gamma的基群，在演化史上是個有趣的課題。
DYK只有中間不要中斷超過7天都行的，我這裡還有許多內容可以迅速的「打將」（不知道閣下下不下棋，借用圍棋術語）--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月8日 (一) 07:05 (UTC)[回覆]

原來IBV和Avian Coronavirus的關係這麼複雜，在下感覺IBV作為條目應該就寫作為模式株的 NC 001451 的發現與研究，至於 KY 805845 、 MK 937829 這些分類在9203里的一筆帶過吧

如同這篇文章指出的發現了多個鳥類冠狀病毒物種，在下覺得根本問題是RdRp同一性大於90這個單一標準過於武斷，導致2JL14、9203等奇怪的物種名

在下是贊成分開條目的，但是禽冠狀病毒跟禽冠狀病毒9203最好先緩一緩不寫，估計2020年的這篇文章之後，ICTV會更新gamma和delta的種屬分類，現在可以先把（包括IBV、火雞病毒、鴨病毒的分子機制流行病學研究歷史）都包含在 Igacovirus 或鳥類的冠狀病毒條目內。

PS:[19]這篇文章裡，2018b版的ICTV分類，gamma還只有兩個亞屬兩個種。

PS2: 想到一個綜述性條目避免「原創研究」的方法，[20]里 dual-published both in the journal and Wikipedia --Htmlzycq（留言） 2021年2月8日 (一) 11:42 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：在下認為ICTV短期內應該不會更新gamma的物種數了，雖然那篇文章提出應該多列鴿子與鵝的兩病毒物種，但兩者都缺乏完整序列，感謝這篇文章的作者詳細介紹了整個鳥類冠狀病毒複雜的分類狀況，我感覺現在文獻中人類之外冠狀病毒的綜述文章相當缺乏。

MHV的文獻很多分別介紹不同病毒株（MHV-JHM、MHV-A59、MHV-3）的，不過IBV的文獻好像都是將其視為一體介紹，很少有專門介紹NC001451、KY805845等專門株系的（不過我還也沒開始細找），但IBV本身又是個複系群，加上鴨冠狀病毒很長一段時間被視為A-CoV，在下感覺如您所說，建一個Igacovirus的條目把這三個物種全部包含在內是最適合的（IBV、火雞病毒、鴨病毒、ACoV、ACoV9203都重定向到這條目），之後若有餘力再寫鳥類的冠狀病毒（綜述文章，包含gamma與delta的），但以Igacovirus為這一大型條目名稱又感覺有點彆扭。
閣下提供「談冠色變」的文章，裡面有許多有意思的中文名，像「普氏蹄蝠冠狀病毒Zhejiang2013」「黃鼠冠狀病毒HKU24」，要不要把這些條目移動到相應名稱？
Whoa! 感謝閣下提供PloS Wiki，看起來太有趣了，感覺比在中文維基寫條目有趣多，我都快跳槽了，不過我挺驚訝為何多年來文章這麼少，PloS Genetics與PloS Computational Biology各約十篇左右，PloS One則一篇都沒有，這可是全世界的作者啊，不曉得是不是他們審稿很嚴，還是大多數科學研究者不會像我倆這樣業餘去鑽研一個主題....--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月8日 (一) 23:53 (UTC)[回覆]

翻譯與譯名問題

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如果有發表文獻支持，那還是移動吧，貌似「China Rattus」在中國大陸被稱為「黃鼠」？同時感覺在下18年開的某菌菇譯名的玩笑，最後導致閣下對社群某些事物心灰意冷，實在不好意思啦

跳槽應該算不上吧，畢竟可以草稿里中英文雙向並進嗎，吐槽一下自己在英文寫的很多stub條目都沒有翻譯到中文，主要也是人名譯名問題

PloS Wiki 上應該可以用類似 HKU1-related coronavirus 這樣的符合慣例的「原創」分類名吧--Htmlzycq（留言） 2021年2月9日 (二) 04:02 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：剛剛移動了HKU24與浙江2013的標題，這篇中文文章還是有許多類似「魯布巴特蜜環菌」的譯名，果蝠屬（Rousettus）給翻成了「盧塞圖斯蝠」，伏翼屬（Pipistrellus）給翻成「皮皮斯特勒斯蝙蝠」這樣荒謬的名字，看到這些我不禁想起閣下當年開玩笑說如果有人想在中文維基建立「魯布巴特蜜環菌」，他首先需要發表一篇中文論文使用此名，再到中文維基來移動名稱.......不過我對中文維基的社群不再抱持希望，其實是社群長期沈淪退化使然，大概到我退選管理員才完全絕望，跟譯名事件沒有直接關係。看看現在的中文維基，社群沉痾、體制僵化，眾人以方針指引為利劍刺向彼此，新手被非常粗暴地對待....說到「跳槽」的話題，不瞞您說，我確實有在考慮將重心移到英文版，例如把自己在中文寫的優特翻譯到英文版，或在英文版寫出優特後再自己翻譯過來。
還是別說這些不開心的了，說些有趣的。剛翻查HKU24時看到這篇[21]，delta居然都外溢到鼠類去了，看完讓我更加覺得在PloS Wiki上寫"Coronavirus in rodents"是個好點子，不知道PloS Genetics或PloS One會不會有興趣收錄這樣的文章；還有這篇[22]（這篇的主題其實相當符合PloS Topic Article的內容形式），竟有在海豹中發現alpha與gamma CoV的紀錄。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月9日 (二) 23:08 (UTC)[回覆]

謝謝閣下分享文章，說說在下的幾點發現

1. PLOS ONE並不是沒有發表於enwiki的文章，不過只有一篇en:Dicke model在下完全看不懂在說什麼 囧rz……

2. 感覺"Coronavirus in rodents"是個很重要的話題，雖然沒有文獻明說，但目前的數據很明顯指出HKU1、HECV-4408和OC43都是傳播到人的以鼠類為 reservoir 的冠狀病毒，不過傳播途徑不同：

HKU1 HECV-4408 OC43
來源 某支接近LRLV的鼠冠狀病毒 某支接近LAMV/HKU24的鼠冠狀病毒 某支接近LAMV/HKU24的鼠冠狀病毒
中間宿主 可能沒有 β1冠狀病毒中的牛冠狀病毒 某支β1冠狀病毒
影響 可能大範圍傳播過 個例 大範圍傳播
受體 9-O-Ac-Sias 9-O-Ac-Sias 9-O-Ac-Sias

3. frontier上的那篇mini review的篇幅相對PLOS Topic Pages短了一些。個人感覺，其實mini review的篇幅更適合維基百科，如果"Coronavirus in rodents"要寫到PLOS Topic的篇幅，像上面傳播到人的鼠類冠狀病毒內容也要寫進去了，還有地理分布等。

4. α1CoV的姊妹群被叫做α2CoV，這有足夠的參考文獻支持嗎？如果這樣命名形成慣例的話，那β1CoV的在鼠類的冠狀病毒中的姊妹群也可以被叫做β2CoV了？

--Htmlzycq（留言） 2021年2月10日 (三) 04:11 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：PloS Topic Article這樣的平台應該好好對科研人員推廣才是，應該比WikiJournal的吸引力高多了。是的，鼠類在此扮演的角色很關鍵，且考慮到人類接觸老鼠的機率遠大於接觸蝙蝠的機率，這樣的傳播事件應該發生了很多次，只是因不造成嚴重疾病而不為人知罷了。

α2CoV的命名來自[23]，不知道"Murine Coronavirus"的定義會不會擴大到包含整個Embevirus的鼠病毒。
在這裡存放一些昨晚查到有關鼠病毒的文章或資料庫中的序列[24][25][26][27]（unpublished）[28]（unpublished），如果有機會寫"Coronavirus in rodents"所需的文獻，我會繼續收集，閣下如有發現遺漏的也歡迎貼在這裡。目前看來鼠病毒的主要支序應該是清楚了，Alpha一支（鹿城等），Beta三支（M-CoV、HKU1-like、HKU24-like，但後者有可能再細分），沒有明顯地域性（有兩篇是歐洲樣本），但樹形每一篇有些許差異，我有機會可以自己用軟體將所有序列跑一遍試試（畢竟可以明目張膽的原創研究了）。另外兔HKU14那邊也有許多接近的兔病毒，且alpha也有一支兔病毒（跟古老文獻中發現的兔腸道病毒吻合）。此外鼩鼱病毒也是alpha的一支，應該位在比較基群（仍有分歧），雖然非嚙齒類，許多文獻把它跟鼠一起討論。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月10日 (三) 22:03 (UTC)[回覆]

[29]剛報道的一個SARS-COV-2相關的東南亞蝙蝠病毒。感覺可以在"Coronavirus in rodents"里順帶介紹兔病毒和鼩鼱病毒，一個宿主親緣關係近，一個生活習性近（在我這外行人看來是這樣）。另外，法國的那篇文章，裡面列出的好多系列都沒見過，看來在下之前看文章的地域性太重了--Htmlzycq（留言） 2021年2月11日 (四) 03:19 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：感謝閣下分享，竟又有SARS2相關的出現，想必今年還會再有，希望我都能如期寫完。那篇法國的文章中使用的許多序列是僅有上傳到NCBI，未有相應發表文章的，這些序列我正在NCBI收集，有些來自兩三個最後沒有發表鼠類研究，有些是其他齧齒動物中發現的孤例（飛鼠、豪豬、裸鼴鼠），不清楚是偶然的外溢還是確實在野外存在此病毒，這些零星序列可在Coronavirus in rodents中可列出一表格整理。兔與鼩鼱也可用一「相關病毒」之類的段落概括。感覺能寫的內容相當充足，在下認為已經可以寄信給PloS Genetics或PloS One負責Topic Article的人詢問他們是否對這樣的文章有興趣。
另外一點離題的：剛剛寫了賀歲條目王氏水牛，換換口味，這篇文章不知道閣下能不能打開，記得知網以前可免費預覽幾頁，現在好像不行了（如果要付費的話就不麻煩了）。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月11日 (四) 08:41 (UTC)[回覆]

新春快樂！！！

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祝閣下新春快樂！！！

在家不能打開cnki，如果在學校應該可以，話說在下前幾天在PloS Genetics的編輯里留言問了關於一個圖片的改進問題en:User_talk:Evolution_and_evolvability#about_this_image--Htmlzycq（留言） 2021年2月11日 (四) 09:43 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：新春快樂！待閣下有空時看看（不急），如果內容沒什麼重要的，也沒什麼能寫在條目中的新資訊就不用了，如果有少許資訊閣下認為能在條目補充就直接編輯條目吧，如果資訊量多複雜，看能不能發送至我的郵箱（我用於維基百科的專門郵箱：wikimycota@gmail.com），或用網路存儲空間分享給我，看閣下方便哪種方式都可以，感謝啦！
這位editor竟是活躍數年的維基人，我寫信問問他對Coronavirus in rodents的想法，待有回覆再通知閣下。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月11日 (四) 19:28 (UTC)[回覆]

關於RaTG13，一個好消息是，這一個月內被翻譯成法語等多個語言；一個壞消息是，‎Alexbrn將‎Phylogenetics一節都刪去了，原因似乎是「生物醫學條目不能只有一手來源」？--Htmlzycq（留言） 2021年2月12日 (五) 16:29 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：這有點胡鬧了啊....他移除的內容只是RaTG13跟SARS2的相似度、SARS跟SARS的相似度、RmYN02跟SARS的相似度，WP:非原創研究：已發表且可靠的第一手來源（如由大學出版社或主流報紙發表）可能可以使用於維基百科，但應小心謹慎，以避免濫用。對第一手來源的任何解釋都需要可靠的第二手來源的相同解釋加以支持。如果沒有第二手來源，第一手來源只能用於描述性斷言），以這種新發表的物種（病毒）而言，勢必得主要使用第一手來源（發表物種的論文）撰寫，單純客觀的事實（外觀、各項數據、序列相似度）可以直接敘述，牽涉到提出理論解釋的（根據實驗結果提出的假說、作者認為的演化過程）則應小心使用，例如加上「作者認為」「有學者提出」「可能」等字眼，但相似度.....come on
退一萬步說，發表RaTG13的原始論文已被多篇其他論文引用，有多篇論文提及RaTG13和SARS2的相似度為96.2%，引述那幾篇論文至少（在佐證這句話上）可算是第二手來源，如果非要等到有綜述性文章提到這個數字才能寫入，太不現實了。
另外，驚覺英文版有人寫了RacCS203，點進去看果然是閣下。中文版也有打算寫嗎？--Labyrinthulomycetes🦠 receptor 2021年2月13日 (六) 00:33 (UTC)[回覆]

中文暫時沒打算寫，只是試一下英文維基對最新文章報道的病毒株系的反映，果然被加了個{{one source}} 囧rz……--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 00:49 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：[30][31]加進去吧，我認為這反映的是整個維基的制度正在僵化，沒想到英文版也有這樣的情形。RacCS203病毒的中文條目我有空時寫吧，這幾天分心跑去寫水牛了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月13日 (六) 07:41 (UTC)[回覆]

奇怪，加上的這兩個來源也會被戴上：use of deprecated (unreliable) source 標籤--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 08:44 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：希望只是觸發標籤吧，不要真來個人把那兩個來源移除了.....閣下知道英文維基怎麼規範在物種條目中使用第一手來源嗎？對於大量冷門、無人關注的物種，可能除了最初發表的文獻就再也無人提及了（相信機器人刷的物種條目有相當多是這樣的），這些英文維基都怎麼處理，是不是又畫蛇添足地加上一些本身也是取自原始論文的資料庫作為來源--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月13日 (六) 09:40 (UTC)[回覆]

不知道，英文維基給在下的感覺是不歡迎這一類冷門物種條目。--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 09:49 (UTC)[回覆]

是每日郵報被列為了不可靠來源，已有用戶過來刪除了，另外，今天終於把上次說的《病毒星球》裡提到的科學家（有英文條目的）給建立了stub，順帶瞎翻譯了兩個來自西班牙語的胡安·曼努埃爾·加西亞-魯伊斯和馬克·戈特施林和兩個研究所古斯塔夫·魯西研究所 喬治·艾萊瓦研究所。--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 11:53 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：恭喜閣下又成一大功，剛好我懂點西班牙語，晚點看能不能稍微擴充，當作翻譯練習...--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月14日 (日) 03:02 (UTC)[回覆]

再論鳥類冠狀病毒

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@Htmlzycq：這幾天又思考了一下棘手的鳥冠狀病毒，其實綜述條目鳥類的冠狀病毒（Coronavirus in birds）是可以寫的，這個與鼠的不同，有許多文章以此為主題探討，介紹gamma與delta中的鳥病毒，我想這篇可大量介紹所有鳥病毒的研究歷史，有寫到優良條目的潛力。另外gamma的每個物種都獨立條目：Avian Coronavirus、鳥冠狀病毒9203、鴨冠狀病毒2714、鵝冠狀病毒CB17、鯨豚冠狀病毒，IBV的病毒學內容在Avian Coronavirus條目中介紹，重定向到Avian Coronavirus；火雞病毒在鳥冠狀病毒9203中介紹，重定向到鳥冠狀病毒9203。不過Avian Coronavirus的中文名不知要取什麼好，鳥冠狀病毒？感覺很容易跟綜述條目「鳥類的冠狀病毒」混淆。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月15日 (一) 06:58 (UTC)[回覆]

在下贊成禽冠狀病毒，見上表，另有[32]這樣的文獻將ICTV的Avian Coronavirus譯為「禽冠狀病毒」當然，把「禽冠狀病毒」當作丙丁中可感染鳥的籠統介紹的文章也有--Htmlzycq（留言） 2021年2月15日 (一) 09:08 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：ok，感謝閣下提供這篇，這樣禽冠狀病毒（物種）跟鳥類的冠狀病毒（綜述文章）應該比較不會混淆，也可在條目第一行另用模板註明。英文文章中也有一堆Avian Coronavirus拿來當丙丁鳥病毒籠統介紹的。冠狀病毒這主條目寫到快吐了....--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月15日 (一) 11:26 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：先寫了沒有爭議的雁冠狀病毒CB17。剩下的有兩個問題

  1. 可能要麻煩閣下幫我看看ICTV 2019 release中把gamma分為三個亞屬五個種，報告中有沒有介紹這樣區分的依據，還有每個種分別包含哪些病毒株，還是這些資訊皆沒有提供？
  2. Avian 9203跟Duck2714都是ICTV在整支中有點隨意地選了一個病毒株作為物種名（而且ICTV本身沒有給出演化樹，使用這套新分類系統的文章我只找到兩篇[33][34]，主要資訊都是依賴第一篇，第二篇介紹gamma的文段非常詭異，把火雞、珠雞的病毒都給當物種了，9203變成只包含野鳥病毒，這應該不符合ICTV的分類）。這樣Avian 9203跟Duck2714的條目中，是否應該介紹這些在其他水鳥中發現，過去地位未定，現在被歸入這兩種的病毒？（ex，某年中國發現哪些鴨鵝的病毒，歐洲發現哪些燕雀的病毒，美國發現哪些巨嘴鳥的病毒.......2020通通給歸入Duck2714），這樣的處理有沒有原創研究疑慮？
  3. 火雞冠狀病毒本身可能就不是單系群（[35]至少歐洲跟北美的有異，再考慮其他地區，可能差別更大，跟IBV根本是沒有明確分別的），但FEMS Microbiology的綜述文章只有分析火雞的一個病毒株NC010800，就把火雞冠狀病毒都歸入9203這個物種裡（(i) AvCoV that comprises some genotypes of IBV, (ii) AvCoV 9203 that similarly comprises some genotypes of IBV and turkey coronavirus；Fig.2右上也只在9203那畫了火雞，比其他種鳥胖了一倍），真實情況應該是有些病毒株屬於Avian，有些病毒株屬於9203，但因為沒有研究去交叉分析所有火雞病毒株和IBV的關係，我如果這樣寫又成原創研究了....好像我自己寫一篇review投稿到期刊被刊出後，再來維基百科寫，才能避開這種問題
  4. 順便吐槽個，查goose coronavirus，出來都是加拿大鵝這家服飾品牌因為疫情營收下降的新聞；查turkey coronavirus，出來都是土耳其的新冠疫情。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月17日 (三) 22:25 (UTC)[回覆]

在ICTV里暫時沒找到分類命名的說明。畢竟2019 release中給出太晚了，參考這裡的gamma三亞屬五種的只有FEMS Microbiology和JVR的兩篇文章也很正常，就以FEMS Microbiology里給出的樹為準好了。turkey coronavirus估計和IBV一樣都不是單系群，個人感覺如果要寫條目，就介紹最早發現的那一株/或者是研究最全的那一株。

順便吐槽個，六種完全沒有親緣關係的豬冠狀病毒，這篇文章也能寫這麼一大段，占了全文三分之一，可能原因是投的是獸醫學雜誌Journal of Veterinary Research吧，人家可能更關心畜產的病害情況。在維基里，估計建立一個豬冠狀病毒的消歧義頁就夠了--Htmlzycq（留言） 2021年2月18日 (四) 02:54 (UTC)[回覆]

序列分析

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@Htmlzycq：去年便在Nature的評論文章上看到柬埔寨有未發表的SARS-CoV-2相關蝙蝠病毒，現在已經出現在biorxiv了[36]，這個大概93%。目前比較近的幾支病毒發現處：雲南、泰國、柬埔寨，感覺武漢很可能不是第一現場。
豬冠狀病毒我給做了個表格，您看看如何。另外昨天寫229E的受體丙氨酸氨肽酶，發現infobox好幾個欄位顯示錯誤，剛剛上客棧技術版提問了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月21日 (日) 01:26 (UTC)[回覆]

那個表格挺好的，一目了然。在下不才，這幾天才剛學會了用MEGA畫系統發育樹。不知道RshSTT200和RacCS203都放進進化樹會怎麼樣。--Htmlzycq（留言） 2021年2月21日 (日) 03:37 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：我則更加不才，去年就下載了MEGA，但完全還沒開始用......之後開始摸索，如果有問題再向您請教。不知閣下有沒有興趣乾脆原創研究一篇「SARS-CoV-2 related coronaviruses」(SC2r-CoVs，RacCS203那篇已使用這個名稱)，加入比較所有SARS-CoV-2相關的病毒（目前無人完整比較過），用MEGA畫樹，再綜合比較各株異同，發表成PloS Topic Article。待閣下發表，我就當作可靠來源在中文維基畫樹，放入每個病毒的條目中--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月21日 (日) 08:28 (UTC)[回覆]

閣下謙虛了，應該閣下先把文章發表了，在下再在各個stub里引用閣下的系統樹，話說閣下有給PloS Topic那邊的編輯郵件嗎？--Htmlzycq（留言） 2021年2月21日 (日) 09:10 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：上個月弄了個abstract就給忘了....這兩天我趕緊來搞。剛順手把"SARS-CoV-3"的兩株寫了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月21日 (日) 11:55 (UTC)[回覆]

RmYN02的29671nt的完整序列閣下可以找到嗎？在下發給閣下郵箱裡的都是NCBI上找的SARS-CoV的ORF1ab的序列，但NCBI上只找到RmYN02的ORF1ab的部分序列--Htmlzycq（留言） 2021年2月24日 (三) 06:48 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：
  1. 可以，研究了一下發現這個序列應該是作者怕人搶了credit，沒放上NCBI，只發表在GISAID（個人實在不認同GISAID這種太過保護作者權利，阻止public access的系統），我上去註冊了，等核准後我應該能找到這個完整序列。另外發表在biorxiv上的柬埔寨蝙蝠病毒RshSTT182, RshSTT200應該也能在GISAID上找到。
  2. 閣下能收到我的回信嗎？前幾天您的email不知為何給系統分到了spam folder，不知是不是網易郵件跟gmail的問題。
  3. 發現這篇[37]，這個Zaria CoV是SARSr-CoV的外群，已經跟浙江2013一起被歸入Hibecovirus了[38]，另外還有一些去年在加彭發現的蝙蝠病毒[39]，還有Ghana343那一堆病毒，都是感染蹄蝠屬蝙蝠，這一塊（SARSr-CoV的相似病毒與基群）感覺是文獻中特別缺乏的部分，資料零散，閣下如寫這個主題的topic article，這部分應該可寫成相當精彩的內容。
  4. 一個與生物無關的，感謝閣下創了彼得·R·L·布朗，大學時我讀過他的The World of Late Antiquity，受限於背景知識而不太好讀，但挺有收穫。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月24日 (三) 21:36 (UTC)[回覆]

Wikipedia Asian Month 2020 Postcard

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Wikipedia Asian Month 2020
Wikipedia Asian Month 2020

Dear Participants and Organizers,

Kindly remind you that we only collect the information for Wikipedia Asian Month postcard 15/02/2021 UTC 23:59. If you haven't filled the Google form, please fill it asap. If you already completed the form, please stay tun, wait for the postcard and tracking emails.

Cheers!

Thank you and best regards,

Wikipedia Asian Month International Team, 2021.01

能否幫助改善紫絨絲膜菌

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在巡查時看到了這篇條目，感覺問題很多，但因為我對真菌不是很精通，只能做一些格式上的修正，能否請您花些時間再做一些校正，謝謝。--クオン·千の海を越えて·夢か……現なのか？ 2021年1月11日 (一) 10:06 (UTC)[回覆]

發現原因了，[40]這是愛丁堡大學的學生作業。--Htmlzycq（留言） 2021年1月16日 (六) 02:53 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：這您都能找到....佩服佩服，沒想到現在維基作業都能跨語言了，我原以為作者應該不懂中文，但看頁面中的名字似乎是華人（不知為何修課學生幾乎全是華人，可能這個翻譯學程是專門從事中英文間的翻譯？）不過他們的課程已於1/15結束，編者應該也不會再管這些條目了。--Wikimycota~🍄 2021年1月16日 (六) 07:45 (UTC)[回覆]

請問閣下「Cystidium」一詞如何翻譯為好？（「間胞」如何？）以及，在下是一名喜愛真菌的編輯新手，所寫內容想必錯誤不少，還請閣下及時指正--TheWindGrahame（留言） 2021年1月18日 (一) 13:40 (UTC)[回覆]

果仁蜜餅送給您！

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感謝撥空提點及建議鄙人關於北美紅橡的修改方式。 赤羽蒼玄（留言） 2021年1月27日 (三) 07:35 (UTC)[回覆]

給您的星章！

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友善星章
感謝 閣下一年來提點我關於植物學條目的編寫要點。

祝 閣下牛年快樂、事事順心！ 赤羽蒼玄（留言） 2021年2月11日 (四) 11:38 (UTC)[回覆]

給您一一隻山羊！

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祝前輩新年快樂！都是科研人咱就不說客套話了，祝前輩今年多發文章吧：）

クオン·千の海を越えて·夢か……現なのか？ 2021年2月11日 (四) 16:10 (UTC)[回覆]

新年快樂！

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新年快樂！
祝閣下新年快樂，萬事如意！感謝您過去一年來對中文維基百科的貢獻！—— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年2月11日 (四) 19:52 (UTC)[回覆]

要發送此消息，請使用{{subst:User:和平奮鬥救地球/HNY|選填賀詞}}。

一杯咖啡送給您！

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謝謝閣下的祝賀，您也是多年來筆耕不輟、在生物學領域貢獻甚大，對我而言這也是專業度更高的學問，我也自認是比不上閣下對維基編寫的嚴肅態度近期還因黑歷史的碩論來源問題被抽掉一個GA。

麥克阿瑟是卡了很久的條目，在我深入去了解後才發現其西南太平洋戰略複雜的難以描述，也希望盡早將它完成。現在的用戶名稱則是因為有人向我表示太長才改掉的 囧rz……。

扯太遠了，謹祝閣下今年能牛年鴻運，萬事如意。 Aizag（留言） 2021年2月12日 (五) 21:09 (UTC)[回覆]

牛年快樂！

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牛年快樂！
送您一個雲南特產——牛虎銅案！您過贊了，我現在覺得寫條目對得起自己就好，雲南有太多可以寫的內容，也不知何時能沉澱足夠的知識編寫一省條目，我儘量。祝您來年闔家幸福、研究工作順利、論文必過。同為異鄉遊子，您也保重！--河水|滇 2021年2月15日 (一) 21:52 (UTC)[回覆]

給您一個星章！

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作家星章
如果中文維基百科都是像閣下這樣認真、勤奮、謙遜、有判斷力的維基人，那該多好啊。 三獵（留言） 2021年2月16日 (二) 06:33 (UTC)[回覆]

又有新的關於Letovirinae的信息

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見[41]，英文維基里有人更新了。

另外，在下郵件里又發了新的subgroupA系統樹和fasta文件，這次把那個鼠類大規模調查的也放進去了。--Htmlzycq（留言） 2021年3月1日 (一) 09:19 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：多謝，果然如閣下預測，更多Letovirus陸續發現了，我猜魚類和兩生類的會分別成為一物種。鼠類病毒樹看起來很完善了，abstract已寄出，就等PloS Genetics的編輯回覆（不知道大概要等多久）。
在寫ACE2的過程中，發現一篇相當重要的文章[42]，這篇的結論非常有意思（ACE2為受體的性狀在Sarbevirus為多次起源）。最重要的是他們發表了三個新的非洲蝙蝠序列，屬於"SARS-CoV-3"這支，過去這支是只有BtKY72跟BM48-31的，加上了這三個後畫出來的結果，這一支居然不再是基群，反倒是SARS-CoV-2成了基群，不知閣下怎麼看這個結果。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月3日 (三) 01:02 (UTC)[回覆]
  1. 記得之前就有一個文章推測過冠狀病毒利用ACE2可能是多次起源，屬於趨同演化。從各個Simplot-Query圖看，S基因也是突變最快的，有選擇壓力在。
  2. 在畫鼠類的Embecovirus冠狀病毒演化樹過程中，感覺還是用ORF1ab的全序列最牢靠，僅僅用其中的RdRp會導致許多置信度很小的分支出現。
  3. 這篇文章中，"SARS-CoV-3"這支是虛線，估計作者也認為此條分支排序於此置信度不高吧。想來SARS-CoV 1、2、3這三支應該在很短的時間內就逐個分離出來了。

--Htmlzycq（留言） 2021年3月3日 (三) 08:18 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：確實這個clade可信度不高，這個樹是nsp12去畫的，如果拿整個ORF1ab去畫應該能有更穩定的結果。要是SARS-CoV-2真的是基群，那東洋區的地域分布與ORF8的起源都變成多次了。我個人對於為何要以ACE2為受體，而非其他千萬種膜蛋白也相當有興趣。
PloS topic投稿指示提供的email是整個PloS Genetics期刊編者的email，不是專門負責topic article的，等一兩週如果還沒有回應，感覺可以直接到英文維基聯絡那位負責topic article的用戶。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月3日 (三) 21:18 (UTC)[回覆]

在下的wikidata討論里，有人這樣提問

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Are you really sure that this zhwiki article describes the Hedgehog coronavirus 1, instead of the Erinaceus coronavirus? Both English and Persian Wikipedias are describing the first, not the second. --Liuxinyu970226 (留言) 01:06, 5 March 2021 (UTC)


在下是這樣認為的，閣下當前的條目應該移動到刺蝟冠狀病毒1，目前發現的刺蝟冠狀病毒還只有1和HKU31兩種，接下來有可能發現更多，估計可以改成穿山甲冠狀病毒一類的條目。

  • @Htmlzycq：確實這裡也可以分成具體病毒株的條目，以及關於刺蝟病毒的綜述條目，研究了一下發現刺蝟冠狀病毒的多樣性很低，只有歐洲一個種，東亞一個種（這兩個發表後也只有幾個新序列陸續再發出，應該也都不是新種），都屬於Marbecovirus，倒是發現個有意思的：EriCoV從宿主那偷了一個基因過去[43]。關於條目命名，不知道Hedgehog coronavirus 1這個名字是怎麼來的（好像又是ICTV自己取的）？原始論文是叫EriCoV，HKU31的文章以全名（BetaCoV Erinaceus/VMC/DEU/2012）稱之，上面這篇剛發表的文章也是稱其為ErCoV。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月5日 (五) 20:03 (UTC)[回覆]

原來是ICTV起的名字啊，就好像上次的2JL14一樣，那要看接下來別人的論文引用是用EriCoV還是Hedgehog coronavirus 1了，之後再決定中文條目名要不要移動。順便@Liuxinyu970226： --Htmlzycq（留言） 2021年3月7日 (日) 15:57 (UTC)[回覆]

有點理解了，它是以每月提報的格式，把tree of life領域中，所有新條目推薦、優特評選的內容群發給這一領域的維基人。

中文可以這樣：1，擴大，把生物化學與分子生物學等等內容都囊括進來，以服務更多維基人；2，改造，從Portal:生物學/新進條目入手，改造為類似這樣的模式？--Htmlzycq（留言） 2021年3月8日 (一) 00:35 (UTC)[回覆]

關於tree of life的Newsletter報導，中文版應該可以涵蓋所有生物學、醫學的內容（畢竟本來內容、編者都不多），以Portal:生物學/新進條目為基礎，每三個月或半年整理通過評選的生物條目，如果有題材可以寫短文介紹維基百科上生物條目的發展（例如上期英文版的報導，介紹一個存在十幾年的hoax taxon被刪除），另外專訪活躍寫作生物條目的維基人，做成像英文版一樣的Nesletter給有興趣的人訂閱。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月8日 (一) 01:55 (UTC)[回覆]

加油！希望閣下與其他維基人能夠為本地維基百科新聞又添一生力軍。—— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年3月16日 (二) 16:27 (UTC)[回覆]

連Avian Coronavirus 9203都鬧雙胞

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@Htmlzycq：雲南再+1[47]，此外發現了跟廣西穿山甲病毒接近的蝙蝠病毒。Fig.3A的演化樹應包含目前所有已知病毒株了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月19日 (五) 07:39 (UTC)[回覆]

謝謝，不知道在下從en:RaTG13的系統樹一節整理出來的en:Template:SARS-CoV-2 related coronavirus接下來該整改成什麼樣的格式。--Htmlzycq（留言） 2021年3月19日 (五) 16:23 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：有點棘手，這篇文章畫出的樹形（全基因組、RdRP與ORF1ab）都與原本的差很多，廣東廣西的穿山甲冠狀病毒（加上新發現3個跟穿山甲接近的蝙蝠病毒）竟然成了單系群，或許得再過一兩年待更多病毒株發現才會有一個穩定的樹形。
剛才沒事找事，創立了Portal:病毒，不知道閣下有沒有興趣參與製作。現在英文版用的系統很方便，各欄位隨機輪播，基本上把各欄位的列表項目（比如數篇精選病毒、數篇疫情、數篇傳記、數篇療法）建好後，除新聞外不用太多後續維護，不像之前Portal:真菌那些欄位一掛就掛了快十年...--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月22日 (一) 00:53 (UTC)[回覆]

之前幾天生活瑣事太忙了，個人電腦又送修多次，沒有及時在wiki和郵件上回復閣下。看到了閣下似乎有點灰心，不過閣下已經「盡人事」了，冠狀病毒也成為，這在各語言wiki都缺少生物學貢獻者的情況下已經非常難得。Coronavirus in rodents閣下打算先再投PloS One試試？Wikijournal of Science又是怎麼一個模式？在下不熟悉

--Htmlzycq（留言） 2021年3月24日 (三) 06:54 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：沒事，大概現實中壓力太大，而且連寫三條大篇幅的條目太累了，本來是覺得中文維基上對生物條目的關注實在太少，但冠狀病毒得以高票通過優良條目也令受到很大的鼓勵，或許大家還是喜歡看到我寫這類條目。我打算再投PloS One，不過得等我現實中的事物先緩緩。Wikijoural是維基學院自辦的一個期刊（但是正經期刊，有impact factor的，當然影響力不能跟PloS等相比），也是同行評審後發布成英文維基的條目。
Portal:病毒已經建立完成，各欄位都有10-25個不同條目可輪播展示，每幾個小時（或點擊頁面中的清除快取）便會更換。建立各欄位的過程中看了中文維基病毒條目的概況，實在是慘不忍睹，除了一些疾病條目的導言因為過去有台灣醫學計畫的人在寫，其他條目不是小作品，就是掛滿維護模板的問題條目。其實2005年左右便有一位知名維基人專司病毒條目，當年甚至連生物分類的infobox都不存在，他得自己用html畫出表格，寫作了大量病毒的條目，如今超過15年大部分條目都沒有任何改善，大都只列出過時屬名、種名就完事了；content bias也相當嚴重，人類以外的動物病毒極少，植物病毒、噬菌體跟感染其他生物的病毒基本上完全不存在（真菌病毒除外），連植物病毒都是紅連。這裡列出優特條目幾乎都是幾位維基人孤狼硬戰的成果，相關條目的質量完全不成比例。比對英文版跟德文版，真不知中文何時才能至少把基礎的條目大致都寫到丙級。--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年3月24日 (三) 18:17 (UTC)[回覆]

在下感覺，中文維基生物條目除了人少以外，還有中文領域本身資料較少。這幾天在家看馬克·萊納斯的《科學之種：我們為什麼深深地誤會了轉基因》，順便寫了約瑟夫·謝爾等幾個促進植物轉基因技術早期發展的科學人物的STUB，發現被譽為「father of plant virology」的馬普植物育種所的首任所長Erwin Baur（德語：Erwin Baur）連中文譯名都找不到。

PS: 整合蛋白重定向到整合素的這個黑鍋應該在下來背才是 囧rz……，在下13年創建整合素這個條目時，只看到有整聯蛋白這個另一譯名，整合蛋白通常都是指整合膜蛋白，不過不知道什麼緣由，在下15年又建立了重定向到整合素的整合蛋白，在2020年整合膜蛋白建立後沒有及時修正重定向。--Htmlzycq（留言） 2021年3月25日 (四) 01:23 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：許多生化分生名詞的中文翻譯相當混亂，如閣下所說，中文的生物資料太少了，或者說以中文寫成、有學術水準的生物（科學）資料太少，當我試著查詢一些生物名詞、人名卻完全找不到中文資料時，便常感嘆這某種程度上反映了中文是一種相當「落後」的語言，當然不能夠與英文這種國際通用語相比，但跟德文、法文、俄文相比也是相形見絀，我身邊的人大多認為生物專有名詞、論文翻譯成中文便難以看懂，改善這種情況也是我參與維基百科的初衷之一。
昨天寫了安尼魯·康特，病毒本身或是疾病的條目若沒有生物、醫學背景應該真的難以編寫，我認為這真的得去大學、研究機構招募更多人進來才能改善，但此類相關人物、書籍、大眾文化條目（也包括馬克·萊納斯等）應該是比較好寫的。Erwin Baur這種找不到的話可以名跟姓分開查（歐文·鮑爾），再沒有就得找外語譯音表了。--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年3月26日 (五) 01:06 (UTC)[回覆]

與維基相關的討論，應該通通在站內公開

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認同閣下的想法，在這裡「從我做起」，把郵件內容複製上來，總不能「作法不自斃」嗎？隱去郵箱--Htmlzycq（留言） 2021年4月6日 (二) 08:43 (UTC)[回覆]

靖天子:冠狀病毒我先提到DYK與GA了，不過尚未寫到自己心中完全滿意的程度，屆時再提至FA。最近在維基與現實上還是比較挫折的，PloS Genetics給拒了，ACE2直接提到FA評選又乏人關注，比較灰心。 時 間： 2021年03月17日 04:10 (星期三)

On Mon, Mar 8, 2021 at 10:49 PM 靖天子 wrote:

上週末我私信了Thomas Shafee，剛剛得到回覆，他說正在與其他editors商議，其他editor對主題的審核比較嚴格，必須非常切合PloS Genetics期刊收錄的範圍，讓我再等等。 期望新冠的熱點能增進他們收錄的意願，如果最後他們決定不收，Dr. Shafee建議改寫到Wikijournal of Science（他是主編），不過我計畫還是先問PloS One（這個沒有明確範圍總該收了吧）

On Mon, Mar 1, 2021 at 3:59 AM 靖天子 wrote: 感謝，這個成果跟新的Letovirus都太有意思了，於是我一不做二不休，熬夜將abstract寫完寄出（已cc閣下）

On Mon, Mar 1, 2021 at 1:16 AM htmlzycq wrote: 這次加入了Comparative analysis of rodent and small mammal viromes to better understand the wildlife origin of emerging infectious diseases那篇文章裡有全基因組的


htmlzycq:感覺還是Coronavirus in Rodents要緊一些，SARSr-CoV (or SC2rCoV)感覺近一兩年會有很大變化，估計現在有不知道多少個小組在華南以及東南亞尋找它們了。

最近不知道是牆還是什麼原因wiki老是斷，特別是在點編輯的時候，普通的瀏覽到還行。

彼得·R·L·布朗是在下最近在看本村陵二的《地中海世界與羅馬帝國》（講談社世界史系列2），中譯本的推薦序里將他和彼得·R·L·布朗以及瑪麗·比爾德的作品《SPQR》比較，在下就看看中文維基上對這二位是否已有介紹

發現自己之前看過的紀錄片《相約古羅馬》就是比爾德的編劇並主持，然後發現相約古羅馬、《SPQR》、瑪麗·比爾德三個條目是16、18、20年由在下在內的不同維基人建立的，三者之間似沒有內部連結，一笑

彼得·R·L·布朗，這個名字某種程度上也算是「原創譯名」了，那位維基人移動後就更加「原創譯名」了。在下不喜歡用某某某 （歷史學家）這樣的消歧義方式，覺得這樣把人「扁平化」了，而更喜歡用中間名來為英美同名同姓人物消歧義，比如肖恩·M·卡羅爾 和 肖恩·B·卡羅爾，直到連中間名也無法消歧義

在 2021-02-25 16:45:38，靖天子 寫道：


跟您確認一下，PloS Topic Article的主題，目前似乎有兩個可寫，一個是Coronavirus in Rodents, 另一個是evolution of SARSr-CoV (or SC2rCoV)，目前先詢問一個？

On Wed, Feb 24, 2021 at 5:18 PM htmlzycq wrote: 收到，謝謝，閣下辛苦了

在 2021-02-24 15:05:44，靖天子 寫道：

抱歉抱歉，我看到您剛才留言才知道您有來信（不知為何被系統分到spam folder了.....） 序列我這幾天有空時找找，找到的話發給您

這幾天實驗不太順利一直耽擱.....這禮拜我便會發abstract給plot topic，屆時會cc您

On Mon, Feb 22, 2021 at 8:35 AM htmlzycq wrote: 靖天子，你好！我是HTMLZYCQ。


這邊qiang好像又高了一些，維基百科又上不去了，下午上的時候試了把剛學的用MEGA畫的穿山甲冠狀病毒ORF1ab的樹傳到了維基上，但放上去之後感覺太難看了，囧


附上了mdsx文件以及做的兩個圖，閣下看看能不能改好看一點

zxc45那兩個的沒找到，RmYN02的ORF1ab在NCBI上只有片段？


最後，這是我投稿專用郵箱，給plos tropic 項目的編輯發郵件時能轉我一份嗎？我想看看具體的思路，找找自己能幫上忙的地方

關於冷門國家的科學家

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最近繼續給《科學之種》裡提到的科學家消紅鏈，在非洲那一章碰到了坦桑尼亞植物病毒學家約瑟夫·頓谷魯，Joseph Ndunguru，抱着試試看的心態在Wikidata搜一下有沒有條目，居然英文的還真有。

說實話Ndunguru這樣的詞，真不知道怎麼發音，根據類似《病毒星球》這樣的科普書寫科學家小條目，一個好處是譯名有來源，書中至少給出了姓氏的譯名。

不用像在下當年給 John canton 編了一個「約翰·坎通」的譯名，主要是各種外語譯音表中都找不到，只好自己根據發音編一個「雅」一點的了

同時在線也發現其實英文維基里 Kinvidia 等用戶創建了許多非洲的學者/科學家，限於譯名，沒辦法跟進，可惜了--Htmlzycq（留言） 2021年4月9日 (五) 04:31 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：迦納的語言契維語（Twi）簡稱tw，契維語維基百科網址是"tw.wikipedia.org"[48]，因為很多人以為是台灣版，還特地在首頁做了個橫幅請台灣用戶注意這裡不是「台灣的維基百科」，我猜這個版本的很多點閱可能都是來自台灣.....WP:外語譯音表中沒有Twi，可能可以退而求其次用同語族（大西洋-剛果語族）的Wikipedia:外語譯音表/斯瓦希里語，Nd這樣的輔音可能是翻成「恩德」，作為語言愛好者我挺想以後學一門非洲語言。
看了下這位用戶創的條目，確實都是相當有價值的內容，非洲相關內容多不受英美等主流媒體關注，非洲當地的來源網站又不穩定，實在相當難寫。--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年4月10日 (六) 00:40 (UTC)[回覆]
（坦桑尼亞的語言是斯瓦希里語，可以直接用中文維基的外語譯音表，提到迦納是因為那位用戶是迦納人，寫的很多是迦納條目，如果能翻譯一些過來對中文維基有很大的幫助）

冠狀病毒暫時沒有什麼建議，另外，類似於en:IL17A#Notes這裡的{{Academic-written review}}是什麼樣一種模式？--Htmlzycq（留言） 2021年4月17日 (六) 08:44 (UTC)[回覆]

日語版條目數量已經超越越南語版，即將超越瓦瑞瓦瑞語

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算不算是人類維基人同機器人維基搏鬥的一場勝利？開玩笑的--Htmlzycq（留言） 2021年4月23日 (五) 02:07 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：好事，但日文版的質量實在有點.....中文是不是又快被阿拉伯文超了啊，而且後面幾種語言似乎都開過機器人，會不會突然就跌出20名外了。
我打算從現在開始，將所有缺乏或仍為小作品的分子生物學的基礎條目全部掃完（User:靖天子/Molecular Biology Sweep），僅寫首段，但希望能根本地改變分生/遺傳學條目嚴重缺乏的情形。--Labyrinthulomycetes🧬 2021年4月23日 (五) 06:00 (UTC)[回覆]
我前天點開了最近更改，發現日文似乎編輯頻率和我們差不多，40分鐘500筆編輯的樣子（英文是6分鐘內500筆），所以質量和中文也許半斤八兩？阿拉伯語最近沒有看到開機器人，倒是埃及阿拉伯語有人（非機器人）靠一己之力刷條目（大多為人物條目）超越中文。--Googol19980904（留言） 2021年4月26日 (一) 15:17 (UTC)[回覆]
@Googol19980904：編輯深度大概跟我們差不多，但日文版專業條目的質量不怎麼樣，且一般缺乏腳註、很多條目以條列式撰寫而未組織成文，許多條目有日本中心的問題，當然這只是我偶爾點開幾條生物條目來看的印象，除英文版外質量比較好的版本我認為是德文跟俄文，特別是俄文的生物條目做得很好。閣下每天創建許多條目是很大的工作量啊，而且涉及領域很廣，我挺好奇您是怎麼挑條目來寫的，其中有許多是重要度很高的條目，例如植物病毒。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年4月27日 (二) 02:00 (UTC)[回覆]
大部分都是幾句話，畢竟有些是學術類條目，我也不是那個專業的，不過翻譯條目的話看懂英文維基的首段應該沒太大問題。有總比沒有好，建好條目讓有興趣的人來擴充，畢竟很多人不會或不懂得如何創建條目。至於條目領域，那基本上就是所見即所寫。相當多的條目是來自於平時的聊天.....--Googol19980904（留言） 2021年4月27日 (二) 03:11 (UTC)[回覆]
@Googol19980904：我把植物病毒給寫了，可能是我寫過條目中難度數一數二的，英文版的來源都因為過時而幾乎不能用。以後如果還有寫生物學條目，可以列入Portal:生物學/新進條目中。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年4月27日 (二) 23:36 (UTC)[回覆]

慚愧，閣下把在下也列為了「一隻手數得過來」的幾個人之一。在下當初進入維基的初衷就是覺得中文維基分生條目太缺乏了，不過有Shakiestone建立的一系列EC模板，讓在下有了先建立一系列導航模板，再根據模板一個個寫條目，哪怕只寫首段就好，共勉--Htmlzycq（留言） 2021年4月23日 (五) 09:25 (UTC)[回覆]

日語版條目數量已經超越瓦瑞瓦瑞語版，埃及阿拉伯語版已經超越越南語版。之前看了埃及阿拉伯語版和阿拉伯語版新建的一些條目，貌似是各種人名，不知道最近埃及版新建的是什麼--Htmlzycq（留言） 2021年4月29日 (四) 12:12 (UTC)[回覆]

@Googol19980904：「有總比沒有好，建好條目讓有興趣的人來擴充，畢竟很多人不會或不懂得如何創建條目。」在下也是這樣想的，共勉。--Htmlzycq（留言） 2021年4月29日 (四) 12:12 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：[51]"For example, Gray and his colleagues recently searched for undiscovered coronaviruses in people sick with pneumonia — and quickly found one. The team screened about 400 samples from pneumonia patients in Sarawak in Malaysia. They found at least four people infected with a new coronavirus that likely came from an animal."東洋區應該經常發生冠狀病毒（昨天發現連m6A都沒有條目，現在打到一半又發現病毒溢出都沒有條目.....我去寫好了）--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年5月3日 (一) 18:44 (UTC)[回覆]

重複序列

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  • @Htmlzycq：在下覺得{{重複序列}}這個模板挺怪的，首先模板把「重複序列」跟「轉座子」視為平行關系，後者應該屬於前者才對，還有把gene conversion放在interspersed repeat的子項目，據我所知interspersed repeats包含的範圍應該跟transposon是一樣的？某基因重複而發生gene conversion的情況感覺不能算是一種interspersed repeat。另外，retrotransposon跟retroposon需要分兩個條目嗎？這兩個詞應該幾乎在文獻中被當作一樣的了，英文en:retroposon提到有人把「沒有LTR的retrotransposon」（SINE跟LINE）合稱為retroposon，又有人將retroposon定義為不編碼RT的retrotransposon，沒有明確分界，寫成兩條目可能使人混淆。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年5月8日 (六) 08:16 (UTC)[回覆]

真的不懂 囧rz……，transposon這一塊估計是在下當初分子生物學課程上最沒理解的一塊內容。英文維基里較早的版本把轉座子納入重複序列子項目的子項目。 另外，似乎是Howard Temin在區分retrotransposon跟retroposon？--Htmlzycq（留言） 2021年5月9日 (日) 09:06 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：模板我稍微改動了一下。Retrotransposon跟retroposon的區分應該因人標準不同，retroposon用的情況很少。我也覺得英文早期的版本比較合理。今天寫LTR反轉錄轉座子跟內源性反轉錄病毒讓我幾乎抓狂，文獻中混用兩者的狀況非常嚴重（例如人類的LTR-retrotransposon很多都直接被稱為retrovirus），很多文章語焉不詳（找不到夠新又夠全面的綜述文章），英文版就更是全篇迷迷糊糊，慘啊。好在剩下一條DNA transposon，等我過幾天幹掉之後這方面的基礎條目就算掃完了。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年5月9日 (日) 09:19 (UTC)[回覆]

又有報道新SARS-related病毒

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石正麗女士最新的BioRxiv預印本：「Identification of a novel lineage bat SARS-related coronaviruses that use bat ACE2 receptor」

報導了RaTG15等8個病毒株，是sars-1與sars-2之外的SARS-related lineage。但可惜的是，沒有把肯尼亞到保加利亞的BM48-31、BtKY72那一批被我們稱為「sars-cov-3」也納入系統樹（倒是納入了ZJ2003等），所以不知道RaTG15是不是和「sars-cov-3」一支。--Htmlzycq（留言） 2021年5月26日 (三) 06:04 (UTC)[回覆]

一個令人高興的事，法語維基百科有A1AA1A等用戶改進了SARS-CoV-2模板，並建立了RacCS203等多個條目--Htmlzycq（留言） 2021年5月26日 (三) 14:35 (UTC)[回覆]

拿唄，就是快半年了，可能需要更新（就等那幾篇BioRxiv預印本publish了）

在下想要不要先在英文裡建立SARS-CoV-1 related模板，把WIV1、WIV16、HKU3、SHC014病毒--Htmlzycq（留言） 2021年6月12日 (六) 04:01 (UTC)[回覆]

英文版的en:Template:SARS-CoV-1 related coronavirus已經寫好了，樹形參考[54]這篇文章，順便都放進去了英文en:Severe acute respiratory syndrome–related coronavirus條目中，還聯絡了法文維基的A1AA1A用戶，他說下周就翻譯為法語。--Htmlzycq（留言） 2021年6月13日 (日) 06:23 (UTC)[回覆]

另外，還看見了用戶夏瑾涼安把閣下主編的果子貍SARS冠狀病毒、鼠冠狀病毒、凱氏帶搬運到了英文--Htmlzycq（留言） 2021年6月13日 (日) 06:28 (UTC)[回覆]

前幾週有看到這幾篇被翻譯到英文版，挺好的，逆向輸出。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月13日 (日) 08:49 (UTC)[回覆]

另外， Rm1 · Rf1 · Rs672 這三個病毒應該在 SARS-CoV-1 related 這個系統樹的哪裡？--Htmlzycq（留言） 2021年6月13日 (日) 14:52 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：抱歉忘了回，看了下SARS-1支系的樹有點棘手，每篇文章樹形都不同，比較新起且涵蓋多數病毒株的是[55]（但160B33並非基群），另外還可參考[56][57]，我感覺綜合比較之下，Rm1跟Rf1可以放在同支，Rs672應該當成{SARS, WIV1, SHC014, WIV16}的姐妹群，Rp3就更不清楚了，應該跟YNLF_31C接近，但具體位置不好說。
另外（我猜閣下也已經注意到了）很高興看到A1AA1A在法文維基也開始寫這些SARS1與2變種的條目，以及上週上線的這篇文章[58]，RpYN06相似度僅次於RaTG13，但樹形不太穩定啊，不知為何英文版模板決定把它畫成{SARS-CoV-2, RaTG13}的外群，感覺只是依照相似度數字高低排列，沒什麼依據（文章中貌似並沒有長這樣的樹）。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月19日 (六) 05:15 (UTC)[回覆]

把RpYN06畫成{SARS-CoV-2, RaTG13}的外群是在下做的，因為RpYN06這篇文章的全基因組樹形和別的文章有些不太一樣，所以只能當成是外群，待進一步的文章分析吧

SARS-1支系的樹，在下都不知道怎麼畫了，先把16BO133和JTMC15病毒畫在一起？--Htmlzycq（留言） 2021年6月19日 (六) 09:20 (UTC)[回覆]

用MEGA自己畫了一下SARS-1系統樹

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截至2021年1月 (2021-01)，SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹：

 
 
 
 

BtCoV HKU3 與SARS-COV相似度87.9 % · 中華菊頭蝠 · 香港、中國廣東 （2004年採集、2005年發表、2010年又發表若干新病毒株）[1]

 
 

Rm1

 
 
 
 
 

Rf1 87.8 % · 馬鐵菊頭蝠 · 中國湖北宜昌 （2004年採集、2005年發表）[2]

 
 
 

16BO133 85 % · 馬鐵菊頭蝠 · 韓國全羅北道 （2016年採集、2019年發表）[3]

 
 

JTMC15 85 %

 
 

JL2012 85 %

 
 
 
 
 
 
 

LYRa11 90.9 % · 中菊頭蝠 · 中國雲南保山 （2011年採集、2014年發表）[4]

 
 
 
 

Rp3 92.6 % · 皮氏菊頭蝠 · 中國廣西南寧 （2004年採集、2005年發表）[2]

 
 

Rs672

 
 
 
 

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 馬鐵菊頭蝠 · 中國雲南祿豐 （2013年採集、2015年發表）[5]

 
 

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 馬鐵菊頭蝠 · 中國雲南祿豐 （2013年採集、2015年發表）[5]

 
 
 
 
 
 

SHC014 95.4 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 （2011年採集、2013年發表）[6]

 
 

WIV1 95.6 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 （2012年採集、2013年發表）[6]

 
 
 

WIV16 96.0 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 （2013年採集、2016年發表）[7]

 
 
 
 

果子貍SARS冠狀病毒 99.8 % · 果子狸 · 中國廣東[1]

 
 

SARS-CoV 100 %

 
 
 
 
 
 
 

SARS-CoV-2 79 %

 
  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人類病毒 
參考文獻
  1. ^ 1.0 1.1 Xing‐Yi Ge, Ben Hu, and Zheng‐Li Shi. BAT CORONAVIRUSES. Lin-Fa Wang and Christopher Cowled (編). Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases, First Edition.. John Wiley & Sons. 2015. 
  2. ^ 2.0 2.1 Li, W. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391. 
  3. ^ Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea.. Virus Genes. 2019, 55 (4): 545–549. PMC 7089380 可免費查閱. PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w. 
  4. ^ He B, Zhang Y, Xu L, Yang W, Yang F, Feng Y; et al. Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in China.. J Virol. 2014, 88 (12): 7070–82. PMC 4054348 可免費查閱. PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14. 
  5. ^ 5.0 5.1 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15. 
  6. ^ 6.0 6.1 Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013, 503 (7477): 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. PMC 5389864 可免費查閱. PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711. 
  7. ^ Yang XL, Hu B, Wang B, Wang MN, Zhang Q, Zhang W; et al. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus.. J Virol. 2016, 90 (6): 3253–6. PMC 4810638 可免費查閱. PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15. 
  • @Htmlzycq：Good Job!這是全基因組下去畫的嗎？結果跟今年初那篇一樣16BO133不是基群，反而是HKU3、Rm1、Rf1這些相似度更高的更早分家，這點相當有意思啊，照理說16B0133、JTMC15、JL2012這幾株一來與SARS的相似度最低，二來地理上最遠（吉林與韓國，都在東洋區之外），真不知生物地理學上是怎麼演化的，可能整個東北亞還有很多不為人知的SARSr-CoV，只是過去研究者都未曾涉及，只把注意力放在華南西南一帶。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月21日 (一) 05:36 (UTC)[回覆]


是用全基因組下去畫的，和上述還有一點點不一樣，SARS-CoV與SHC014更近，WIV1和WIV16為一支，圖已經發給閣下的郵箱了

16B0133、JTMC15、JL2012這一支全位於吉林與韓國，而且在下的比較顯示其與SARS-CoV的相似度在85%以上，沒有之前報道的82%，與之最接近的Rf1也位於「華西南」之外的湖北 --Htmlzycq（留言） 2021年6月21日 (一) 05:56 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：多謝。這個圖中的SHC014 (MT308984)是Mutant SARS coronavirus Urbani clone SARS-Urbani-MA_SHC014-spike，好像是Ralph Baric做的SARS-CoV骨架、SHC014刺突融合病毒，也就是除了spike來自SHC014之外，其他序列都是來自SARS-CoV Urbani的，不知道我的理解有沒有錯誤，可能是因此才跟SARS-CoV變成一個clade。SHC014的完整序列應該是這個：[59]
看來SARS1基部的那幾株還不是很明朗，不知道是有哪些先分出去，還是像閣下的結果這樣整支包括HKU3、160OB33、Rf1、Rm1在內都一起分出去。不知閣下有沒有看過關於冠狀病毒生物地理學的文章（我並沒有找到過），感覺是很有意思的課題。這篇顯示除吉林那株外，河北陝西山西還各有一株SARSrCoV，不知道會不會也是這一支的。看這篇文章還有幾個有趣的發現：原來台灣也發現過SARSr-CoV（CYCU‐R9/TW/2013），可惜只定了RdRp，挺好奇這一株的位置；圖中標出了南海諸島讓我一開始以為南沙上都有SARSr-CoV，仔細看才發現根本沒有....；以及陝西跟山西的英文就差多一個a。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月21日 (一) 23:22 (UTC)[回覆]


前幾天找了22個SARS-COV-1、WIV1的近源序列，用MEGA花了二十幾個小時跑ALIGN，又花了十幾個小時跑PHYLOGENY，結果電腦崩潰了，什麼都沒保存住 囧rz……

不過根據SARS-COV-1、WIV1、WIV16、SHC014這四五個的complete gemone跑的樹，當前的樹的這一塊是對的--Htmlzycq（留言） 2021年6月25日 (五) 10:40 (UTC)[回覆]

冠狀病毒國際前沿研究與創新論壇

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會議通知 |冠狀病毒國際前沿研究與創新論壇 閣下有沒有興趣投個摘要？--Htmlzycq（留言） 2021年6月28日 (一) 16:49 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：有意思，我思考一下，您投嗎？
看了最近的條目數統計趨勢，貌似再一個月我們應該能一次超過瓦瑞瓦瑞跟越南語這兩個當年用機器人刷的版本？漏看了一個0，還早.....--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年6月30日 (三) 20:09 (UTC)[回覆]

還是您來投吧，在下最近時間不多，不知閣下想要投哪個內容，可以郵箱同時發我。年初估算過中文應該2022年超過機器人--Htmlzycq（留言） 2021年7月1日 (四) 04:01 (UTC)[回覆]

會議聯繫人劉博士剛好是在下碩士期間的同屆同學，問他他說這個會相對來說還是比較開放，沒那麼大的難度--Htmlzycq（留言） 2021年7月1日 (四) 15:14 (UTC)[回覆]

有位德語維基人問閣下一些關於Ralph S. Baric來源的問題，見在下英文的討論頁 --Htmlzycq（留言） 2021年7月1日 (四) 15:34 (UTC)[回覆]

[60]這個視頻的前半段是劉博士介紹自己的研究

另外，法語維基里，系統樹改成了以RdRp的--Htmlzycq（留言） 2021年7月5日 (一) 05:11 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：最近也比較忙，而且沒想到有關於這個論壇五大主題的摘要，大概先不投了，關於之前被拒的那個「鼠類冠狀病毒」，在下還是想等有空時（估計年底）試試看PloS One的Topics Article。這幾天有空時我得趕緊去回覆那位德語維基人，以及更新Baric的條目。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年7月5日 (一) 09:46 (UTC)[回覆]

辛苦！--Htmlzycq（留言） 2021年7月5日 (一) 10:34 (UTC)[回覆]

[61] Susan R. Weiss的講課視頻，有中譯--Htmlzycq（留言） 2021年7月20日 (二) 07:04 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：多謝分享，以前聽他的演講有提到自己做的領域過去都乏人問津（類似Baric實驗室本來都要倒了），他都打算退休，但去年時勢造英雄，一夕爆紅，發覺大家都開始重視他做的東西 囧rz……。這系列課程是專門開給中國觀眾的嗎？
我挺推薦This Week in Virology，很好的節目，深入淺出，特別有幾集講病毒起源、駁斥實驗室洩漏說的。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全掃 2021年7月24日 (六) 06:16 (UTC)[回覆]

那應該是賓夕法尼亞大學的公開課程，不是專門開給中國觀眾的，Susan R. Weiss是講者之一，剛好第六講第七講是她，我看着名字這麼熟悉，想起閣下寫過她的條目，就轉過來了，應該還有後續，中文還沒譯全，說實話，這譯者還是比較搞怪的 --Htmlzycq（留言） 2021年7月24日 (六) 09:16 (UTC)[回覆]

《維基人》2021年3月 第十四期

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給您的星章！

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作家星章
感謝您接受《維基人》的採訪！—— Eric Liu 創造は生命（留言．留名．學生會） 2021年3月2日 (二) 15:24 (UTC)[回覆]

Re:ACE2已經寫完

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謝謝祝福。

謝謝有關ACE2的編輯, 等我看完後, 可以提供生物非專業人士的意見。--Wolfch (留言) 2021年3月4日 (四) 06:31 (UTC)[回覆]

有關首段的「SARS-CoV與SARS-CoV-2和ACE2結合的能力應為多次起源，可能與病毒的重組有關。」,　不太清楚「多次起源」意思，意思是這些病毒在發展過程中, 各因為不同的原因而發展了和ACE2結合的能力嗎？--Wolfch (留言) 2021年3月4日 (四) 09:44 (UTC)[回覆]
@Wolfch：我做個比喻（實際情況更複雜，我假想一個比較單純的情況），假設一個家族有10種病毒，都是從同一個祖先所衍生而成，這10種病毒都可以與ACE2結合，那很可能這10種病毒的共同祖先也是能與ACE2結合的（或者這個共同祖先不能與ACE2結合，10種病毒是各自分別獲得這樣的能力，但這個機率就比前者低許多）；假如有9種病毒可以和ACE2結合，1種不行，那麼有兩種可能：10種病毒的共祖可以與ACE2結合，但有1種自己喪失了這個能力，或者共祖不能與ACE2結合，有9種病毒分別各自獲得這個能力（機率比前著低很多）；假如是只有2種病毒可與ACE2結合，另外8種不行，那就比較可能是共祖不能與ACE2結合，這2種病毒是後來各自獲得了結合力（另一種情況是共祖可與ACE2結合，但有8種病毒都喪失了結合力，但機率就低許多）
SARS-CoV和SARS-CoV-2就接近上面的第三種情況，它們與ACE2結合的能力應該是趨同演化的結果，所以說是多次起源的。所以「這些病毒在發展過程中，各發展了和ACE2結合的能力」是對的，但「原因」應該是一樣的（為了感染細胞）--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月4日 (四) 10:13 (UTC)[回覆]
說明的很清楚，謝謝，我想一下有沒有其他的詞可以代替「多次起源」。--Wolfch (留言) 2021年3月4日 (四) 10:42 (UTC)[回覆]
@Wolfch：我稍微改寫了這句話，去掉了「多次起源」。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月4日 (四) 19:03 (UTC)[回覆]

Re:‎Portal:病毒

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謝謝您對醫學翻譯計劃的肯定，我會將訊息轉給計劃的負責人，謝謝您。--Wolfch (留言) 2021年3月22日 (一) 23:32 (UTC)[回覆]

有關醫學翻譯計劃貢獻，又有提報過DYK的病毒相闗條目, User:Koala0090提供的資料如下：

  • 醫學翻譯計劃曾在2015年擴充過流行性感冒條目，之後在2017年提報過DYK, 同年也通過優良條目和典範條目評選。
  • 普通感冒條目在2012年曾經DYK通過，醫學翻譯計劃後來也在2018年擴充過普通感冒條目（因此DYK的版本和醫學翻譯計劃沒有什麼關係）

不過上述條目都是和病毒有關疾病的條目，不是介紹病毒的條目，不知是否符合portal:病毒的需求？謝謝 --Wolfch (留言) 2021年3月23日 (二) 08:54 (UTC)[回覆]

Re

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術業有專攻而已。

長期以來研究數理化生醫學的文獻資料絕大多數是英語文獻，甚至日語文獻都遠遠超出漢語數倍。

人的精力有限，鑽研這些學科的同時做不到仔細衡量漢語措辭，往往只能按英語用詞習慣來寫，寫出來的姑且算「科學式」漢語吧。然而漢語就是漢語，之所以有科學式漢語，不過是漢語沒學到家只用根據英語、口語生造措匯乃至句式。

舉個可能很多人會覺得不可思議的例子。查教授的小說我覺得很了不起，這不僅是因為情節、想象，更是文筆。從《越女劍》到《鹿鼎記》，全書沒有「進行」，沒有「XX性」，沒有「在少林寺」這類開頭，也沒有「最XXX之一」，甚至完全沒有「之一」，沒有「主義」，沒有「作出了很大的貢獻」，沒有「成功」。很多人會認為這是學科差異，我不覺得，我覺得這是漢語學沒學到家的問題。

只舉一例，漢語本來連男女都不分，哪來的性。但科學界寫文章，世間萬物的所有特點就像電腦文件「屬性」選項，有數以萬計的複選框一個個選就行，似乎漢語原有的形容詞不管用，其實都是沒學到。「永久居民身份證」，「永久」是形容詞，形容後面的居民身份證非常通順，便要故做姿態寫成「永久性居民身份證」；某種疾病會傳染，非要說某種疾病「有傳染性」，傳染病要叫「傳染性疾病」，極易傳染、容易傳染、不易傳染、不傳染，偏要寫成「傳染性極強、傳染性很強、傳染性不強、傳染性為零」，似乎這樣就更有「科學性」般。流行感冒要叫「流行性感冒」，很專業要說很有專業性；他的看法、建議言之有物、腳踏實地、一針見血、說到點子上……非要說「很有建設性」；不可能、可能、有可能、很可能就顯得「不科學」，要改成「可能性為零（沒有這個可能性）、有這個可能性、可能性很大」，「紀念建築」非要寫「紀念性建築物」。總而言之，除「性別」、「個性」這類辭彙，漢語稍算入門的都不會寫出XX性這種詞。

極力建議參考余光中的《中文的常態與變態》，我的總結還遠不如他全面。

當然，我上述的看法估計只對大陸人有意義，因為就我的觀察不管香港還是台灣，在這方面做法相反。

最後重申，這只是術業有專攻，能在數理化生醫領域貢獻，漢語學不到家又有什麼要緊，再說我也沒見過這些領域年輕一代的專業人士有誰在乎。--7（留言） 2021年3月28日 (日) 03:01 (UTC)[回覆]

評論得好！身為台灣人，常覺得對漢語的無力！但，先不論政策面，光就自小學習開始，就肩負學漢英兩種語言的負擔，更何況漢語的語法，個人覺得大家並不重視，實在難以回天！再者，漢語也是有其缺陷的，只能靠政策逆轉其弱點，就如1920年發布的《通令採用新式標點符號文》。 --yyfroy 2021年4月17日 (六) 05:30 (UTC)

給您的星章！

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作家星章
了不起的創作！ yyfroy 2021年4月17日 (六) 04:57 (UTC)

卡氏帶

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靖天子您好，許久不見，感謝您一直以來對生物條目的無私貢獻。想請問，您最新提報DYK的卡氏帶發育段落的第二段第一句寫到「卡氏帶蛋白蛋白為膜蛋白」，請問這是單純的冗字嗎？因為不知道原本想表達什麼所以我沒有動他。--Yrr933!(留言) 2021年4月17日 (六) 14:20 (UTC)[回覆]

@yrr933!：好久不見！是的，多了蛋白二字，感謝您指出。很高興看到您又開始編輯，且正就讀微免生藥相關的科系，都十年了.....最近有打算寫作哪些條目嗎？--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年4月17日 (六) 18:12 (UTC)[回覆]

送您的腺嘌呤核苷三磷酸

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送您的腺嘌呤核苷三磷酸
為您對科學條目的熱忱和毅力。 安憶Talk 2021年6月11日 (五) 04:42 (UTC)[回覆]

能否幫助改善條目吐魯番花條蛇

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您好呀，我在試着寫新發現的物種吐魯番花條蛇（User:HaziiDozen/沙盒/4），但不確定二名法定名人的部分是不是這麼寫。對條目內容我也不是很自信是否概括全面了。希望能得到幫助，如果有錯誤或者遺漏請告訴我或者直接修改都可以。謝謝～～～🙏🙏--認為久坐對腰不好並強烈建議大家躺着編輯維基百科的HaziiDozen（留言） 2021年6月16日 (三) 08:33 (UTC)[回覆]

同行評議邀請（？） 腺相關病毒

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您好，我最近嘗試寫了一下腺相關病毒，但畢竟隔行如隔山，我現在（包括過去）研究的方向和病毒學相去甚遠，因此覺得條目質量很一般。如果您有興趣，是否願意提一些建議，做一些改善呢？--クオン·千の海を越えて·残夢 2021年7月9日 (五) 12:40 (UTC)[回覆]

給您的星章！

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不倦星章
編輯維基百科條目的過程往往既孤獨又繁瑣，許多人有知識、能力卻未必有心力持續奉獻，而您卻長期持續為生物學領域條目做出貢獻。謹此表達欽佩之意。 燈火闌珊處（留言） 2021年7月13日 (二) 08:51 (UTC)[回覆]

請問如何分辨Ganoderma lucidum與Ganoderma lingzhi的幼小子實體？

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靖天子您好！2012年的一篇文獻(Cao, Y., Wu, S. H., & Dai, Y. C. (2012). Species clarification of the prize medicinal Ganoderma mushroom 「Lingzhi」. Fungal Diversity, 56(1), 49-62.)認為，原產於中國的靈芝與作為靈芝屬模式種的亮蓋靈芝（ Ganoderma lucidum ）並非同一物種，應當單獨定種為Ganoderma lingzhi 。文章還提到Ganoderma lingzhi 成熟子實體的菌管口顯黃色，而產自歐洲的Ganoderma lucidum 菌管口為白色；但是否有通過觀察區分兩者的幼小子實體的方法？

以及如果可以，請問您可否幫助分辨該幼小靈芝子實體屬於何種(2021.6.8攝於北京大學鏡春園)？

十分感謝！

--TheWindGrahame（留言） 2021年8月3日 (二) 10:28 (UTC)[回覆]

  • @TheWindGrahame：讀了這篇文章，另外找到這篇[62]，好像都沒有提到區分幼小子實體的方法，兩者外形太接近，要成熟後才可勉強區分（菌孔顏色、形狀、子實體上有黑色條帶與否）。不過既然是在北京大學看到的，我猜是G. lingzhi的機率比較大？G. lingzhi主要分布於亞洲，G. lucidum主要分布於歐洲，但是中國也有G. lucidum（原本被歸為G. tsugae，但Cao 2012已將G. tsugae處理成G. lucidum的異名），所以不能完全肯定是G. lingzhi。--Mesomycetozoea🧬 2021年8月4日 (三) 05:48 (UTC)[回覆]
  • @靖天子：謝謝！另外還請問五棱散尾鬼筆（Lysurus mokusin）與中華散尾鬼筆（Lysurus mokusin f. sinensis（Lloyd）Kobayasi）的區分？英文Wiki那邊給出的是中華散尾鬼筆「 having a head that was more angular and conical at the top」（更稜角分明，頂部顯圓錐形）因為沒有查到原文獻（英文Wiki那邊給的 Kobayasi Y. (1938). "Hymenogastrineae et Phallineae". In Nakai T, Honda M (eds.). Nova Flora Japonica. Tokyo, Japan: Sanseido Co. p. 52.）所以不太理解......TheWindGrahame（留言） 2021年8月8日 (日) 16:13 (UTC)[回覆]
  • @TheWindGrahame：那份文獻是日文的（小林義雄. ヒメノガスター亜目及スツポンタケ亜目. 大日本植物誌. 東京: 三省堂. 1938 （日語）. ）確實網路上找不到。英文版條目中引的另一個文獻Seok 2005則說

This taxa is very similar to Lysurus mokusin Fr. f. mokusin, but different from it in having the longitudinal angular-conic top of head."

另外查到另一份中文文獻（圖力古爾、李玉. 吉林省担子菌补记(四). 吉林農業大學學報. 2003, 25 (1): 41-44. ），其中提到

本種有時作為Lysurus mokusin (Pers.)Fr.的變型, 即Lysurus mokusin (Pers.)Fr.f. sinensis(Lioyd)Kobayasi , 與原變型L.mokusin (Pers.)Fr. f.mokusin 的區別在於後者頭部的爪形托臂不結合形成尖細的咀。也有人主張將L.sinensis 合併到L.mokusin 中

這樣看來，兩者的差別非常微小，僅是鬼筆頂部的形狀稍有差異（「嘴」的有無），加上鬼筆分類混亂，異名極多，中華散尾鬼筆是否真為有效分類（單系群）也未可知。
這篇條目的英文版質量不錯，篇幅也不長，要不要把它翻譯過來？（只有一個小問題，英文版說中國僅福建有分布，實際上中國各地均有分布，例如上述的吉林）--Mesomycetozoea🧬 2021年8月12日 (四) 02:40 (UTC)[回覆]
@靖天子 或許我可以嘗試一下？最近總算也有些時間--TheWindGrahame（留言） 2021年8月16日 (一) 06:09 (UTC)[回覆]

Wikipedia:典範條目評選/提名區#紫式部

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我已經再修改好了，不知道閣下有沒有再看一次？我至少想有個回應。SANMOSA Σουέζ 2021年8月4日 (三) 08:31 (UTC)[回覆]

中文版離越南語版條目數量差距不到5萬了

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這個暑假裡，中文版條目數量平均日增300+，另外，瑞典語版條目數量從原300多萬下跌到298萬了，閣下知道怎麼回事嗎？ --Htmlzycq（留言） 2021年8月9日 (一) 00:22 (UTC)[回覆]

  • @Htmlzycq：瓦瑞是不是也有掉？難不成他們良心發現開始清掃那堆垃圾物種條目了......基金會有沒有工具可以看各語言條目數每天的增長情形？
閣下參加幾天後舉行的線上Wikimania嗎--Mesomycetozoea🧬 2021年8月12日 (四) 03:01 (UTC)[回覆]

在下找了這個頁面的編輯歷史，瑞典語版是從去年年中373萬開始緩慢下跌的，一年來下跌了75萬多，估計是瑞典語維基人在手動提刪吧；宿務語還在上升，有可能突破600萬；瓦瑞語沒有往下掉，不過中文版快超過他了。線上Wikimania估計參加不了，在下這裡老是掉線 囧rz……--Htmlzycq（留言） 2021年8月12日 (四) 05:11 (UTC)[回覆]

@Htmlzycq：宿務語好像也就一個禮拜多個一兩篇條目吧。瑞典語雖然機器刷了不少條目，但有些知識類的條目還是蠻全的。--Googol19980904（留言） 2021年8月13日 (五) 04:11 (UTC)[回覆]
@Htmlzycq：摸索了一下線上Wikimania實在很難參加.....不過演講影片都上傳到Youtube了，可以慢慢欣賞（有幾個人講的挺有意思的）--Mesomycetozoea🧬 2021年8月15日 (日) 19:58 (UTC)[回覆]

有關於Transposable element的討論

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見en:User_talk:Evolution_and_evolvability#Transposable_element，另外，7-8月間有英文用戶創建了冠狀病毒S蛋白在內的多個條目，見en:Template:Coronavirus genomes

@Htmlzycq：厲害，都是同一位維基人寫的，而且內容都相當豐富，SMEN這四種蛋白都挺難寫的，我僅在主條目冠狀病毒中介紹（包括5'與3'UTR），我倒是曾想過寫ORF3與ORF8這兩種對冠狀病毒致病、免疫非常重要的蛋白，這兩篇目前英文版沒有，估計那位維基人很快也會寫到。
但是這個模板有一個問題，nonstructural protein X在這裡看起來是指輔助蛋白（ORF1a/b與SMEN以外的其他蛋白），只列到ns8，但容易與ORF1a/b編碼的14種蛋白（也稱為ns）混淆，改稱ORFX比較妥當。可能還有因命名未統一而產生的連結問題，例如ORF3b（英語：ORF3b），英文版已經有條目了，模板中的nonstructural protein 3卻仍是紅字。另一點是這些輔助蛋白在不同冠狀病毒的種類與數目經常不同，不同屬冠狀病毒中名為ORF3的蛋白可能是完全不同的，可能僅能稱為ORF3b in SARS-like coronaviruses，而不能稱為Coronavirus ORF3b（但即使是SARS-like coronavirus輔助蛋白也可能有異，例如ORF8可能分成8a與8b兩個ORF，或者僅有一個完整的ORF），這裡命名不好處理，我猜那位維基人可能是因此而暫時止步於結構蛋白。--Mesomycetozoea🧬 2021年9月3日 (五) 06:36 (UTC)[回覆]

96.8%

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是在下根據新聞添加的，，不過似乎學界對全基因組相似度不太關心了，更關心RdRP的相似度，比如法文維基的編者已經把SARS-CoV-2樹改成了基於RdRP的樹。在下一直有一個想法，就是一模板多用，比如:

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|whole}} 用於展示基於全基因組的樹

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|Orf1ab}} 用於展示基於Orf1ab的樹

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|RdRP}} 用於展示基於RdRP的樹

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|Spike}} 用於展示基於S基因的樹

不過沒時間做。--Htmlzycq（留言） 2021年10月31日 (日) 11:12 (UTC)[回覆]

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立陶宛星章
感謝閣下對本次「立陶宛感謝祭」線上編輯松的踴躍貢獻！希望未來閣下能秉持此般熱忱，持續貢獻維基百科。祝　編安！-Peacearth（留言） 2021年8月25日 (三) 01:25 (UTC)[回覆]

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編輯星章
感謝靖天子的勉勵和提醒，使條目「紅槍會」有所改善。先生的認真精神值得所有維基人效法。 Banyangarden（留言） 2021年9月18日 (六) 06:38 (UTC)[回覆]

能擴充艾恩宏嗎?

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[63]，因也與立陶宛與台灣關係有關。--Outlookxp（留言）

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